| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 138 | 1 = | 0 (0.000) | 64 (1.130) | 51/170 | 0.0 | 67.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 24 | 27433 = | 63 (1.110) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GTGCAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTCCA > 24/27337‑27533 | gTGCAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGc > 1:89214/1‑101 (MQ=255)gTGCAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGc > 2:700499/1‑101 (MQ=255)acagaaaagaagcgatttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGc > 2:1265344‑M2/97‑101 (MQ=255) gCAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGccc < 2:1118763/101‑1 (MQ=255) agaaaagaagcgatttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGccc > 1:1569049‑M2/95‑101 (MQ=255) cAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCg > 2:22064/1‑101 (MQ=255) aTAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGa > 2:357106/1‑101 (MQ=255) aTAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGa > 2:1515883/1‑101 (MQ=255) aTAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGa > 2:1597537/1‑101 (MQ=255) cGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGc > 1:111963/1‑101 (MQ=255) cGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGc < 1:1634600/101‑1 (MQ=255) ggCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCt > 1:781275/1‑101 (MQ=255) agcgatttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCt > 2:572511‑M2/87‑101 (MQ=255) cAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCa < 2:579386/101‑1 (MQ=255) gatttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAg > 1:458322‑M2/84‑101 (MQ=255) gatttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAg > 2:1685433‑M2/84‑101 (MQ=255) aaaGTGATGATAGATTGTGCAGTATGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAg < 2:623497/101‑1 (MQ=255) atttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGt < 2:1343503‑M2/19‑1 (MQ=255) tttgccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTc < 1:543497‑M2/20‑1 (MQ=255) aGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTc > 1:1460519/1‑101 (MQ=255) ccgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaagtaggttgacgagatgtgctgattacggtttaatgccccccGTTCCCCGGATACCTCAGTCGGTa < 2:329114‑M2/24‑1 (MQ=255) atgatAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTa < 1:1535230/101‑1 (MQ=255) atgatAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTa > 1:1035582/1‑101 (MQ=255) cgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTag < 2:1690804‑M2/25‑1 (MQ=255) cgcaatcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTag < 2:1280675‑M2/25‑1 (MQ=255) gatAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTaga > 1:654389/1‑101 (MQ=255) cagtcttaagcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTagag > 2:1238467‑M2/75‑101 (MQ=255) 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gcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGAtt > 2:1305708‑M2/66‑101 (MQ=255) gcagttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGAtt > 1:573878‑M2/66‑101 (MQ=255) cAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTg < 2:670740/101‑1 (MQ=255) aGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGa < 2:756825/101‑1 (MQ=255) gttgaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGaa > 1:1370074‑M2/63‑101 (MQ=255) gTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGaa > 2:187762/1‑101 (MQ=255) tGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAAt < 1:200192/101‑1 (MQ=255) gaatcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAAt > 1:465031‑M2/60‑101 (MQ=255) atcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATcc > 2:1629464‑M2/58‑101 (MQ=255) tcgcttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATccc > 2:1101889‑M2/57‑101 (MQ=255) ccTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATccc > 1:913177/1‑101 (MQ=255) cttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCgt < 2:1455724‑M2/48‑1 (MQ=255) cttttactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCgt > 1:118435‑M2/54‑101 (MQ=255) aTTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCgtgt < 2:1124038/101‑1 (MQ=255) tactgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTcc < 1:787894‑M2/52‑1 (MQ=255) gaagaaATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCt > 2:1102612/1‑101 (MQ=255) gaagaaATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCt > 1:1047594/1‑101 (MQ=255) gaagaaATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCt > 2:1364042/1‑101 (MQ=255) actgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCt > 1:880984‑M2/49‑101 (MQ=255) actgaaattaggttgacgagatgtgcagattacggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCt > 1:977681‑M2/49‑101 (MQ=255) agaaATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTg > 1:590528/1‑101 (MQ=255) 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cGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTcc > 1:1103169‑M2/2‑101 (MQ=255) gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTCCa > 1:877681/1‑101 (MQ=255) gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATAAACGGACCTCCa < 1:1685439/101‑1 (MQ=255) | GTGCAATAGCGGCAAAGTGATGATAGATTGTGCAGTCTGCCCTAAATTGAAGAAATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTCCA > 24/27337‑27533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |