New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | 24 | 27433 = | 63 (1.110) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTTTAATGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 138/114‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTCC > 24/27433‑27532 CATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGG > 1:394746/1‑101 ATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGT > 1:1280680/1‑101 TTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTT < 1:1345485/101‑1 TTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTT > 1:251956/1‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |