| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 107 | = 15491 | 0 (0.000) | 86 (2.120) +TTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC |
36/122 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 107/15392‑15491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 223/1‑46 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTG < 2:842607/101‑1 GGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 1:556989/101‑1 GTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:1556830/1‑101 CACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGGGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGCTAGAGT > 1:80006/1‑101 CTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:1683537/101‑1 GAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 2:1480922/101‑1 GATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 2:1038554/101‑1 ATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:318748/1‑101 TTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:90893/1‑101 CATCCGCACATGTTACGTCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:390315/101‑1 CATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 2:455103/1‑101 ATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 1:907149/1‑101 ATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 2:1500438/1‑101 TCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:362271/101‑1 CCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGAAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 2:1120869/1‑101 CGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGCTTTATGTTCAGATAA < 2:1510276/101‑1 GCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:72498/1‑101 GCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 2:1560804/101‑1 CACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:385776/101‑1 ACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 1:1420729/101‑1 TGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATTCCCG < 2:1194791/101‑1 TGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:1324830/101‑1 TGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:728932/1‑101 TTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:855055/101‑1 CGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:533577/101‑1 GCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 1:1672625/101‑1 CATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 2:1145309/1‑101 ATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:1349754/101‑1 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TTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 1:1651283/101‑1 TTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC > 1:150422/1‑101 GCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:850135/1‑101 CGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 1:1295050/101‑1 GAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG > 1:1216480/1‑101 AATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA > 1:599390/1‑101 AATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA > 2:1006829/1‑101 ATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG < 2:306514/101‑1 TATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGA < 2:957843/101‑1 agttctggggCGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCACCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 2:922743/11‑101 GGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 1:1002135/1‑101 GGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 2:922404/1‑101 gttctggggCGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAC < 2:362927/92‑1 gttctggggCGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAC < 2:1282409/92‑1 taacgtcagcCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 2:150389/91‑1 AATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 1:401040/101‑1 tgatgaacatGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 1:83957/11‑101 tgatgaacatGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 2:263180/11‑101 tctggggCGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 1:194551/94‑1 tacgatttttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 1:1266974/91‑1 cgggaatgttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 2:852674/11‑101 ATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 1:1339321/101‑1 ATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 1:650428/101‑1 ATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 1:76880/1‑101 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aatgttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 2:344905/7‑101 ATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 1:272432/101‑1 tttttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 1:202740/6‑101 gtccaGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 2:1043576/6‑101 cagcCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT < 2:386519/97‑1 cagcCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATCTTGAGAACGACAGCGACT < 1:1413197/97‑1 atgttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 2:1175459/6‑101 atgttGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 1:1409876/6‑101 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ATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 107/15392‑15491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 223/1‑46 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |