| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 107 | = 15491 | 0 (0.000) | 86 (2.120) +TTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC |
36/122 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 107/15391‑15491 | aaTGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAc < 2:1099491/101‑1 (MQ=255) aTGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACt < 1:65592‑M1/101‑2 (MQ=255) gggTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattg < 2:842607‑M1/101‑7 (MQ=255) gTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgat > 1:1556830‑M1/1‑93 (MQ=255) cACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGGGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgctagagt > 1:80006‑M1/1‑88 (MQ=255) cTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttt < 2:1683537‑M1/101‑16 (MQ=255) gagaTTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttat < 2:1480922‑M1/101‑19 (MQ=255) gaTTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgt < 2:1038554‑M1/101‑21 (MQ=255) ttCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttc > 1:90893‑M1/1‑79 (MQ=255) cATCCGCACATGTTACGTCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcag < 2:390315‑M1/101‑25 (MQ=255) cATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcag > 2:455103‑M1/1‑77 (MQ=255) aTCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcaga > 2:1500438‑M1/1‑76 (MQ=255) tCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagat < 2:362271‑M1/101‑27 (MQ=255) ccGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGAAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagata > 2:1120869‑M1/1‑74 (MQ=255) cGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgctttatgttcagataa < 2:1510276‑M1/101‑29 (MQ=255) gCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:72498‑M1/1‑72 (MQ=255) gCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataat < 2:1560804‑M1/101‑30 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataattcccg < 2:1194791‑M1/101‑35 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg > 1:728932‑M1/1‑67 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:1324830‑M1/101‑35 (MQ=255) ttACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat < 1:855055‑M1/101‑37 (MQ=255) cGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac < 1:533577‑M1/101‑40 (MQ=255) cGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac > 1:1680113‑M1/1‑62 (MQ=255) gCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact < 1:1672625‑M1/101‑41 (MQ=255) ccATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt > 2:379326‑M1/1‑60 (MQ=255) aTTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg < 1:1349754‑M1/101‑44 (MQ=255) cGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 1:1557774‑M1/1‑55 (MQ=255) gtgtGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 2:1315419‑M1/101‑48 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCGACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 2:690127‑M1/1‑52 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 2:352334‑M1/1‑52 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 1:1040754‑M1/1‑52 (MQ=255) tgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 2:1225853‑M1/101‑51 (MQ=255) ggTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag > 1:1214981‑M1/1‑50 (MQ=255) ggTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 1:821936‑M1/101‑52 (MQ=255) tttGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctc > 1:150422‑M1/1‑47 (MQ=255) ttGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 1:397362‑M1/101‑56 (MQ=255) gCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 1:850135‑M1/1‑44 (MQ=255) gCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:1483962‑M1/101‑58 (MQ=255) cGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 1:1295050‑M1/101‑65 (MQ=255) gAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttg > 1:1216480‑M1/1‑36 (MQ=255) aaTATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 1:599390‑M1/1‑35 (MQ=255) aaTATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 2:1006829‑M1/1‑35 (MQ=255) atatGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:306514‑M1/101‑68 (MQ=255) tatGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga < 2:957843‑M1/101‑69 (MQ=255) ggAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacga > 1:1002135‑M1/1‑29 (MQ=255) ggAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacga > 2:922404‑M1/1‑29 (MQ=255) agttctggggcgctggtaatgactCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcacctccaccgattttgagaacga > 2:922743‑M1/11‑29 (MQ=255) gttctggggcgctggtaatgacTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac < 2:1282409‑M1/92‑74 (MQ=255) gttctggggcgctggtaatgacTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac < 2:362927‑M1/92‑74 (MQ=255) ttctggggcgctggtaatgaCTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca < 2:1281390‑M1/93‑75 (MQ=255) aaTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca < 1:401040‑M1/101‑75 (MQ=255) tgatgaacatgggtaatgactccAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 1:83957‑M1/11‑26 (MQ=255) tctggggcgctggtaatgACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:194551‑M1/94‑76 (MQ=255) tacgatttttgggtaatgactccAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:1266974‑M1/91‑76 (MQ=255) cgggaatgttgggtaatgactccAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 2:852674‑M1/11‑26 (MQ=255) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 1:76880‑M1/1‑26 (MQ=255) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:1339321‑M1/101‑76 (MQ=255) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:650428‑M1/101‑76 (MQ=255) tAGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:24153‑M1/1‑25 (MQ=255) gggaatgttgggtaatgactcCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:1705552‑M1/92‑77 (MQ=255) gggaatgttgggtaatgactcCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:1456304‑M1/10‑25 (MQ=255) gggaatgttgggtaatgactcCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:1398222‑M1/92‑77 (MQ=255) cgcggccccgggtaatgaCTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:452240‑M1/93‑77 (MQ=255) acgtcagccgggtaatgaCTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:144852‑M1/9‑25 (MQ=255) acgatttttgggtaatgactcCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:914565‑M1/92‑77 (MQ=255) acgatttttgggtaatgactcCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 1:490406‑M1/10‑25 (MQ=255) cgtcagccgggtaatgACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 2:1245986‑M1/94‑78 (MQ=255) aGATACGCGGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 2:1015526‑M1/101‑78 (MQ=255) naatgttgggtaatgacTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcga > 1:702026‑M1/8‑23 (MQ=255) 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atgttgggtaatgACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact > 2:1175459‑M1/6‑21 (MQ=255) tgttgggtaatGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt < 2:406747‑M1/97‑82 (MQ=255) ccccgggtAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt < 2:1282337‑M1/98‑82 (MQ=255) agccgggtAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 2:181513‑M1/4‑20 (MQ=255) acatgggtaatGACTCCAACttattgatagtgttctatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:1346610‑M1/5‑20 (MQ=255) gccgggTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:272041‑M1/99‑83 (MQ=255) cgcgGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 2:80006‑M1/101‑83 (MQ=255) ccagggtaaTGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:739792‑M1/98‑83 (MQ=255) catgggtaaTGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:816821‑M1/98‑83 (MQ=255) ccggGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 1:1492742‑M1/2‑18 (MQ=255) ccggGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 2:4435‑M1/2‑18 (MQ=255) atgggtaATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc < 2:26965‑M1/99‑84 (MQ=255) cgGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccg > 1:341804‑M1/1‑17 (MQ=255) cgGGTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccg < 2:49448‑M1/101‑85 (MQ=255) gggTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt > 2:528937‑M1/1‑16 (MQ=255) gggTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt > 1:471293‑M1/1‑16 (MQ=255) gggTAATGACTCCAACttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt < 1:1105121‑M1/101‑86 (MQ=255) | AATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 107/15391‑15491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |