| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 165 | = 8501 | 0 (0.000) | 58 (1.050) +CT |
50/196 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 210 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GCGCGTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 165/8401‑8501 | gcgcGTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCgg < 2:886218/101‑1 (MQ=255) gTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctgg > 1:1096938‑M1/1‑97 (MQ=255) ttttACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggt < 2:416891‑M1/101‑6 (MQ=255) tttACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtg < 2:1417507‑M1/101‑7 (MQ=255) tACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggt > 2:1128781‑M1/1‑93 (MQ=255) tACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggt < 2:635031‑M1/101‑9 (MQ=255) tACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGGGGATTTTCCTGACGCTCGGCGTTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggg > 1:124883‑M1/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttc > 1:458634‑M1/1‑91 (MQ=255) tCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttct > 1:1340282‑M1/1‑90 (MQ=255) cGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctg < 1:1184175‑M1/101‑13 (MQ=255) gCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgg < 1:1067186‑M1/101‑14 (MQ=255) cccGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctggg < 2:666486‑M1/101‑15 (MQ=255) cccGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGcgggtggttctggg > 1:1562426‑M1/1‑87 (MQ=255) ccGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctggga < 2:103071‑M1/101‑16 (MQ=255) gTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatc > 2:156369‑M1/1‑84 (MQ=255) tGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctgggggttctgggatcc > 2:794606‑M1/1‑83 (MQ=255) cGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggta < 2:1249485‑M1/101‑23 (MQ=255) cggcgTGGATTTTCCTGACGCTTGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTTCGAACTCGGCTGGGGCGGctggttgttctgggctccggtagaaaac < 2:173287‑M1/101‑29 (MQ=255) cggcgTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaac < 2:330268‑M1/101‑29 (MQ=255) cggcgTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaac < 1:303510‑M1/101‑29 (MQ=255) cggcgTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctgggggttctgggatccggtagaaaac > 2:667285‑M1/1‑73 (MQ=255) gTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcct < 1:1341621‑M1/101‑33 (MQ=255) gATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgt > 1:19333‑M1/1‑66 (MQ=255) ttCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttat < 1:1139689‑M1/101‑40 (MQ=255) ttCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttat < 2:1096933‑M1/101‑40 (MQ=255) ttCCCGACGCGCGGTATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggacccggtagaaaacgcctcgtttat < 2:688283‑M1/101‑40 (MQ=255) cTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgcc > 2:979878‑M1/1‑59 (MQ=255) cTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatcctgtagaaaacgcctcgtttatgccgtggct < 2:1041437‑M1/101‑49 (MQ=255) cTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggct < 2:1190187‑M1/101‑49 (MQ=255) cGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctgg < 2:945007‑M1/101‑51 (MQ=255) cGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctgg > 2:765052‑M1/1‑51 (MQ=255) gCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtg < 2:1112922‑M1/101‑53 (MQ=255) ttGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtgggg < 1:618249‑M1/101‑56 (MQ=255) gtgCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggac < 1:1093852‑M1/101‑58 (MQ=255) tgCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggact < 1:667290‑M1/101‑59 (MQ=255) gCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactg < 2:458629‑M1/101‑60 (MQ=255) ggTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgct > 1:353162‑M1/1‑38 (MQ=255) ccGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctgggggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatg > 1:793697‑M1/1‑34 (MQ=255) gCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgca > 1:1671321‑M1/1‑32 (MQ=255) aTGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcact < 2:45198‑M1/101‑72 (MQ=255) aTGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcact > 1:836993‑M1/1‑30 (MQ=255) aTGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcact > 2:409948‑M1/1‑30 (MQ=255) tGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactc < 2:1340276‑M1/101‑73 (MQ=255) tGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactc > 1:1703626‑M1/1‑29 (MQ=255) tGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGccggtggttctgggatccggtagagaacgcctcgtttaagccgtggctgggggggactgcgctgatgcactc > 1:1395340‑M1/1‑29 (MQ=255) gggCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcc > 2:18507‑M1/1‑28 (MQ=255) cTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactgg < 2:923832‑M1/101‑78 (MQ=255) cTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgccccgtttatgccgtggctggtgggggctgcgctgatgcactcactgg > 2:1611444‑M1/1‑24 (MQ=255) tATTACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggc < 1:781934‑M1/101‑79 (MQ=255) tACGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggt < 1:990447‑M1/101‑82 (MQ=255) aCGAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtc < 1:689862‑M1/101‑83 (MQ=255) gAACTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcac < 1:456266‑M1/101‑85 (MQ=255) cTCGGCTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactga > 2:1557390‑M1/1‑14 (MQ=255) cTGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaac < 1:794611‑M1/101‑93 (MQ=255) tGGGGCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaacg < 1:1288299‑M1/101‑94 (MQ=255) ggggCGGctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaacgc > 2:48235‑M1/1‑7 (MQ=255) gcggctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaacgcgcc < 2:319650‑M1/101‑98 (MQ=255) cggctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaacgcgcca > 2:814057‑M1/1‑3 (MQ=255) gctggtggttctgggatccggtagaaaacgcctcgtttatgccgtggctggtggggactgcgctgatgcactcactggcggtcactgaacaacgcgccagt > 2:416800‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCGCGTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 165/8401‑8501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |