New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 165 | = 8501 | 0 (0.000) | 58 (1.050) +CT |
50/196 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 210 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 165/8405‑8501 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTT > 210/1‑100 || GTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGG > 1:1096938/1‑101 TTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGT < 2:416891/101‑1 TTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTG < 2:1417507/101‑1 TACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGT < 2:635031/101‑1 TACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGT > 2:1128781/1‑101 TACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGGGGATTTTCCTGACGCTCGGCGTTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGg > 1:124883/1‑100 CTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTC > 1:458634/1‑101 TCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCT > 1:1340282/1‑101 CGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTG < 1:1184175/101‑1 GCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGG < 1:1067186/101‑1 CCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGG < 2:666486/101‑1 CCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCGGGTGGTTCTGGG > 1:1562426/1‑101 CCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGA < 2:103071/101‑1 GTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATC > 2:156369/1‑101 TGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGGGGTTCTGGGATCC > 2:794606/1‑101 CGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTA < 2:1249485/101‑1 CGGCGTGGATTTTCCTGACGCTTGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTTCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTTGTTCTGGGCTCCGGTAGAAAAC < 2:173287/101‑1 CGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAC < 1:303510/101‑1 CGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAC < 2:330268/101‑1 CGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGGGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAC > 2:667285/1‑101 GTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCT < 1:1341621/101‑1 GATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGT > 1:19333/1‑101 TTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAT < 2:1096933/101‑1 TTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAT < 1:1139689/101‑1 TTCCCGACGCGCGGTATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGACCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAT < 2:688283/101‑1 CTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCC > 2:979878/1‑101 CTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCTGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCT < 2:1041437/101‑1 CTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCT < 2:1190187/101‑1 CGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGG < 2:945007/101‑1 CGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGG > 2:765052/1‑101 GCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTG < 2:1112922/101‑1 TTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGG < 1:618249/101‑1 GTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGAC < 1:1093852/101‑1 TGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACT < 1:667290/101‑1 GCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTG < 2:458629/101‑1 GGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCT > 1:353162/1‑101 CCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGGGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATG > 1:793697/1‑101 GCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCA > 1:1671321/1‑101 ATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACT > 1:836993/1‑101 ATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACT < 2:45198/101‑1 ATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACT > 2:409948/1‑101 TGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTC < 2:1340276/101‑1 TGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTC > 1:1703626/1‑101 TGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCCGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAGAACGCCTCGTTTAAGCCGTGGCTGGGGGGGACTGCGCTGATGCACTC > 1:1395340/1‑101 GGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCc > 2:18507/1‑100 CTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGG < 2:923832/101‑1 CTATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCCCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGGCTGCGCTGATGCACTCACTGG > 2:1611444/1‑101 TATTACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGC < 1:781934/101‑1 TACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGT < 1:990447/101‑1 ACGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTC < 1:689862/101‑1 GAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCAC < 1:456266/101‑1 CTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGA > 2:1557390/1‑101 CTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAAC < 1:794611/101‑1 TGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACG < 1:1288299/101‑1 GGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGC > 2:48235/1‑101 GCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCC < 2:319650/101‑1 CGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCA > 2:814057/1‑101 GCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGT > 2:416800/1‑101 TGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTT > 1:358966/1‑101 || GTTTTACTCGCCCGTGGACGCTGGCGGCGTGGATTTTCCTGACGCTCGGCATTGTGCTCGGTTCCGCATGGGCCTATTACGAACTCGGCTGGGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 165/8405‑8501 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTT > 210/1‑100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |