New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 117 | 1 = | 0 (0.000) | 25 (0.440) | 23/196 | 1.9 | 49.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 76 | = 13488 | 51 (0.840) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCTTCT > 117/1‑100 | cctcgctctgtagggagagggccggggtgggggtgattgttcgcaccggtgctggtctgttcccctcaccctaaccctctccccgaaggggcgaggggacg > 1:1075542‑M1/101‑101 (MQ=255) ctcgctctgtagggagagggccggggtgggggtgattgttcgcaccggtgctggtctgttcccctcaccctaaccctctccccgaaggggcgaggggacgg > 2:205721‑M1/100‑101 (MQ=255) tagggagagggccggggtgggggtgattgttcgcaccggtgctggtctgttcccctcaccctaacaccctccccgaaggggcgcggggacgggtcgggcga < 1:82288‑M1/11‑10 (MQ=255) ggtgagggctggggtgagggttaatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTg > 1:1439641‑M1/87‑101 (MQ=255) ggctggggtgagggttaatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAAt > 1:1470037‑M1/81‑101 (MQ=255) ggctggggtgagggttaatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAAt > 2:885052‑M1/81‑101 (MQ=255) gagggttaatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTa > 2:1602379‑M1/72‑101 (MQ=255) gttaatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGcc > 2:847282‑M1/68‑101 (MQ=255) aatgttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCtt > 1:594506‑M1/65‑101 (MQ=255) gttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAAc > 1:368446‑M1/62‑101 (MQ=255) ttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAAcc > 2:372894‑M1/61‑101 (MQ=255) ttcgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAAcc > 1:864562‑M1/61‑101 (MQ=255) cgcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCtt > 2:509690‑M1/59‑101 (MQ=255) gcaccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCtta > 2:202408‑M1/58‑101 (MQ=255) caccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCttat > 1:5253‑M1/57‑101 (MQ=255) accagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCttatt > 2:538888‑M1/56‑101 (MQ=255) ccagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCttatta > 1:1591923‑M1/55‑101 (MQ=255) cagtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATtaa > 2:659712‑M1/54‑101 (MQ=255) agtgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATtaat > 1:1004371‑M1/53‑101 (MQ=255) tgctggctgttcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATtaataa > 1:600196‑M1/51‑101 (MQ=255) tcccctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTg > 1:427077‑M1/41‑101 (MQ=255) cctcaccctaaccctctccccaaaggggcgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGAtt < 1:1481461‑M1/64‑1 (MQ=255) cgaggggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAAc > 1:1501288‑M1/10‑101 (MQ=255) ggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCt < 2:890191‑M1/97‑1 (MQ=255) ggacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCt > 2:1064440‑M1/5‑101 (MQ=255) gacGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCtt > 1:348825‑M1/4‑101 (MQ=255) acGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCTTc < 2:817046‑M1/99‑1 (MQ=255) cGGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCTTCt > 1:1514770‑M1/2‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGATTGTGCGCTTTGTCGAATTTGTCATTACGCCCTTAACCTTATTAATAACAGGAAGCTGATTTGTGAGACTCGCCCCGCTCTACCGCAACGCCCTTCT > 117/1‑100 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |