New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 22 | = 41696 | 0 (0.000) | 59 (0.060) +CT |
41/196 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 22/41597‑41696 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 223/698‑616 || TGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAAC < 2:1353186/101‑1 CGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:1481610/1‑101 GTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:192597/1‑101 GTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:503712/1‑101 GTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:545851/1‑101 tAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 2:108299/100‑1 AAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:583217/1‑101 AAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:1612747/1‑101 AAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGGGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:1138900/1‑101 ATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:300294/101‑1 TTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:901320/101‑1 GTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:1595833/101‑1 GTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:407608/1‑101 GTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:388704/1‑101 GAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:963428/101‑1 AAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:104699/101‑1 AGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAGCTTACTGATTTAGTGTATGAT > 2:1671484/1‑101 GATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 2:799731/1‑101 CTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 2:526531/101‑1 TGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATAGTGTT < 2:1140524/101‑1 GACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:1660576/101‑1 CTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:366092/101‑1 CTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:1374372/101‑1 AATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:1366652/1‑101 AATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:1181493/101‑1 ttccgatctAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:687722/92‑1 ATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:1525628/101‑1 TCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:1669736/101‑1 CATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 2:868948/1‑101 CATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:1080063/101‑1 CATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:285908/101‑1 ATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:628399/101‑1 TGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 2:764473/1‑101 AGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGagatcggaa > 1:687727/1‑92 TGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 2:1492177/101‑1 GATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:1598361/1‑101 GATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:80515/101‑1 ACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:126710/101‑1 CGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:525947/101‑1 GCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:1573216/101‑1 GCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 2:1349818/1‑101 CTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 1:963822/101‑1 TCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:1380470/101‑1 AGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 2:1558618/101‑1 CAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:799736/101‑1 ATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:545846/101‑1 ATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 1:770776/1‑101 ATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:665226/1‑101 ATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:1353272/1‑101 ATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 1:643150/101‑1 TCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 2:791375/101‑1 TCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:1113159/101‑1 TCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:407613/101‑1 CGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:1421330/101‑1 CGACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:853725/101‑1 GACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:1566766/101‑1 CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 1:22308/1‑101 CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 1:572749/1‑101 CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 1:815967/1‑101 CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 1:319606/1‑101 || TGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCCAGATTCAACATCATCGTTTCGACGGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 22/41597‑41696 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 223/698‑616 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |