| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 79 (1.250) | 59/196 | 0.1 | 98.7% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.020) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 88 (1.380) | 69/198 | 0.0 | 98.8% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.020) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
CGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCA > REL606/1619736‑1619935 | gtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:1017337‑M2/99‑101 (MQ=255)gtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:1475783‑M2/3‑1 (MQ=255)cGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGAt < 2:1439326/101‑1 (MQ=255) tgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt > 2:423209‑M2/98‑101 (MQ=255) gATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATt < 2:1616243‑M2/101‑2 (MQ=255) gattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTa > 1:1699184‑M2/97‑101 (MQ=255) gattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTa > 2:893424‑M2/97‑101 (MQ=255) aTTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtg > 1:1650849‑M2/1‑99 (MQ=255) aaCATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 2:804905‑M2/1‑96 (MQ=255) aaCATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 1:420462‑M2/1‑96 (MQ=255) cATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg > 1:482277‑M2/1‑94 (MQ=255) cATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGtt < 2:263181/101‑1 (MQ=255) gacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTaa < 1:230249‑M2/12‑1 (MQ=255) gCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccc < 1:186807‑M2/101‑12 (MQ=255) cttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc < 2:1493055‑M2/14‑1 (MQ=255) cTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacccca < 2:1126999‑M2/101‑14 (MQ=255) tgctgcTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaa < 2:1237816‑M2/101‑18 (MQ=255) tgctgcTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaa > 1:65147‑M2/1‑84 (MQ=255) cgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa > 1:618751‑M2/80‑101 (MQ=255) tgctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt < 1:511657‑M2/101‑21 (MQ=255) ctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgg < 1:1326371‑M2/101‑23 (MQ=255) ctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgaactgaccccaaaaagttgc < 2:498084‑M2/101‑23 (MQ=255) tttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc > 1:614765‑M2/76‑101 (MQ=255) ttCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgga < 2:765144‑M2/101‑24 (MQ=255) tCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:282517‑M2/1‑77 (MQ=255) aTAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:435581‑M2/101‑27 (MQ=255) aaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGt > 1:1044702‑M2/72‑101 (MQ=255) aaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTa > 2:400273‑M2/71‑101 (MQ=255) aGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:887472‑M2/101‑29 (MQ=255) ccTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:21687‑M2/101‑31 (MQ=255) ccTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:1148900‑M2/101‑31 (MQ=255) cTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa < 2:303693‑M2/101‑32 (MQ=255) cTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa > 1:718541‑M2/1‑70 (MQ=255) gtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:1122374‑M2/66‑101 (MQ=255) gtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:45139‑M2/66‑101 (MQ=255) cTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 1:1295380‑M2/1‑67 (MQ=255) cTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 1:714280‑M2/1‑67 (MQ=255) ttCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 2:939032‑M2/101‑36 (MQ=255) attttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTaa < 2:510995‑M2/38‑1 (MQ=255) ttttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAAc < 1:893429‑M2/39‑1 (MQ=255) tttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACt > 1:1318383‑M2/62‑101 (MQ=255) tttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACt < 2:428768‑M2/40‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:361275‑M2/1‑60 (MQ=255) ttGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:93389‑M2/1‑60 (MQ=255) gctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTgggg < 2:903767‑M2/44‑1 (MQ=255) tGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcata > 1:326800‑M2/1‑59 (MQ=255) tttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCt > 1:1007772‑M2/56‑101 (MQ=255) tttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCt > 1:778273‑M2/56‑101 (MQ=255) tttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCt > 2:1027004‑M2/56‑101 (MQ=255) ttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCtt > 1:500638‑M2/55‑101 (MQ=255) tgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACT‑GGGCtttt > 1:1629571‑M2/54‑101 (MQ=255) acatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtc > 1:15752‑M2/52‑101 (MQ=255) cGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtct > 2:593047‑M2/1‑52 (MQ=255) atattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtctc > 1:1093303‑M2/50‑101 (MQ=255) atattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtctc > 1:1242026‑M2/50‑101 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTctct < 2:618746‑M2/53‑1 (MQ=255) ggCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctg > 2:1223205‑M2/1‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTa > 2:555052‑M2/48‑101 (MQ=255) cACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgat < 2:1181010‑M2/101‑53 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCt > 2:1034802‑M2/45‑101 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattcc < 2:947701‑M2/101‑56 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccga < 1:30164‑M2/101‑58 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGt > 1:965462‑M2/40‑101 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGtt > 2:1556352‑M2/39‑101 (MQ=255) agGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatat > 2:1680533‑M2/1‑41 (MQ=255) ggCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatatt > 1:1706158‑M2/1‑40 (MQ=255) ttccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTgg < 1:1270327‑M2/65‑1 (MQ=255) cTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattca < 1:1672420‑M2/101‑64 (MQ=255) ccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGCTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGgtg > 2:1350055‑M2/35‑101 (MQ=255) catttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGgtgt > 1:1217448‑M2/34‑101 (MQ=255) ccTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattg < 2:1316764‑M2/101‑68 (MQ=255) cTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattgg > 1:1293188‑M2/1‑33 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGNNGTTGGTGTTCAt < 2:614760‑M2/72‑1 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag < 1:1399983‑M2/101‑71 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag < 2:1069794‑M2/101‑71 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag > 2:1148895‑M2/1‑31 (MQ=255) gtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattcggatattcaattggagtcagac < 2:1639101‑M2/101‑77 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 1:976705‑M2/101‑78 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 1:733509‑M2/101‑78 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAgg > 2:1706229‑M2/22‑101 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAgg > 1:772438‑M2/22‑101 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAgg < 2:516210‑M2/80‑1 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGc > 2:829096‑M2/21‑101 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCa < 2:657494‑M2/82‑1 (MQ=255) aGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttt < 2:775750‑M2/101‑81 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGa < 1:438623‑M2/84‑1 (MQ=255) cATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacctttta > 2:435576‑M2/1‑19 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATa < 2:1122369‑M2/86‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggaatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaa > 2:1341322‑M2/1‑18 (MQ=255) gAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatt > 1:1212237‑M2/1‑16 (MQ=255) aaaTTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaattt > 2:1264792‑M2/1‑15 (MQ=255) aaTTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttc < 2:263895‑M2/101‑88 (MQ=255) ttGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcag > 1:558219‑M2/1‑12 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCa < 2:21088‑M2/92‑1 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCa < 1:118551‑M2/92‑1 (MQ=255) gtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCa > 1:1141799‑M2/6‑101 (MQ=255) gtcAGATtgtactaaccccaaaaagttggacagttaaacacgcggcatataggtctgattccgatattcaattggaggcagaccttttaatttcaggctaa < 2:255867‑M2/100‑95 (MQ=255) caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCAccc < 2:776931‑M2/99‑1 (MQ=255) aGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattc > 2:1573423‑M2/1‑4 (MQ=255) aTTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCa > 1:1312105/1‑101 (MQ=255) | CGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCA > REL606/1619736‑1619935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |