Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 79 (1.250) | 59/196 | 0.1 | 98.7% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.020) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 88 (1.380) | 69/198 | 0.0 | 98.8% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.020) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
GTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/664785‑664688 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCG > REL606/1619834‑1619933 GTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT < 1:1475783/101‑1 GTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT > 1:1017337/1‑101 GTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAT < 1:1656875/101‑1 TGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATT > 1:21088/1‑101 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GCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGC < 2:625699/101‑1 CGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCA > 1:618751/1‑101 TTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAC > 1:614765/1‑101 TTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACG > 2:938294/1‑101 CAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCG > 1:312266/1‑101 AAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGT > 1:1044702/1‑101 AAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTA > 2:400273/1‑101 GGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGT < 1:1271337/101‑1 GTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTT > 1:45139/1‑101 GTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTT < 1:897358/101‑1 GTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTT > 1:1122374/1‑101 ATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAA < 2:510995/101‑1 TTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAAC < 1:893429/101‑1 TTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACT < 2:428768/101‑1 TTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACT > 1:1318383/1‑101 GCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGG < 2:903767/101‑1 TTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCT > 1:1007772/1‑101 TTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCT > 2:1027004/1‑101 TTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCT > 1:778273/1‑101 TTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTT > 1:500638/1‑101 TGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACT‑GGGCTTTT > 1:1629571/1‑101 ACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTC > 1:15752/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTC > 1:657499/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTC > 1:1093303/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTC > 1:1242026/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTC > 1:1257263/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTC > 1:776936/1‑101 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT > 2:765411/1‑101 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT < 2:618746/101‑1 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT < 1:765416/101‑1 ATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTA > 2:555052/1‑101 TAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATC > 2:604921/1‑101 AGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCT < 1:218496/101‑1 AGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCT > 2:1034802/1‑101 GCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG > 2:841221/1‑101 GCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG > 1:1322782/1‑101 CTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGT > 1:965462/1‑101 TATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTT > 1:973860/1‑101 TATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTT > 2:1556352/1‑101 TTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGG > 1:71689/1‑101 TTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGG < 1:1270327/101‑1 CCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGCTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTG > 2:1350055/1‑101 CATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGT > 1:1217448/1‑101 TTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCA > 2:471606/1‑101 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGNNGTTGGTGTTCAT < 2:614760/101‑1 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCAT < 2:94219/101‑1 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCAT < 1:95983/101‑1 CAACAAAATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGG > 2:1706229/1‑101 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AATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATA < 1:439159/101‑1 AATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATA < 2:1122369/101‑1 AATGGGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATA > 1:641301/1‑101 GGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCT > 1:535637/1‑101 GGTGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCT < 2:1217443/101‑1 TGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCA < 1:118551/101‑1 TGCAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCA < 2:21088/101‑1 CAGTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAG < 2:22995/101‑1 GTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCA > 2:128897/1‑101 GTACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCA > 1:1141799/1‑101 ACAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACC > 1:403833/1‑101 CAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCC < 2:776931/101‑1 AGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCG > 2:1171325/1‑101 GTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/664785‑664688 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCG > REL606/1619834‑1619933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |