Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,405,131 | IS1 (–) +9 bp | coding (168‑176/1347 nt) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 2263507 | NA (NA) | 83 (1.290) | 57/200 | 0.1 | 97.4% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | REL606 | 2405131 = | 2 (0.030) | coding (168/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter | |||||
* | ? | REL606 | = 2405139 | 2 (0.030) | 82 (1.270) | 63/200 | 0.1 | 97.4% | coding (176/1347 nt) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
? | REL606 | 2407442 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
GGTCGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2405040‑2405139 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > REL606/2407442‑2407541 GGTCGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGG > 1:326690/1‑101 GTCGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGG < 1:68489/101‑1 GTCGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGG > 2:838906/1‑101 CGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTA < 2:912817/101‑1 CGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTCCTTCCTCTGCCCTGGCCCGGGCTTATTCAGGGGAACGCCCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTA < 1:116624/101‑1 GCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAAT > 1:386524/1‑101 CAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATG < 2:1119858/101‑1 CAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATG < 2:10985/101‑1 CAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATG > 1:1213997/1‑101 AGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGA > 1:150389/1‑101 GGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGAC > 2:761635/1‑101 TTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGTCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCC > 1:993985/1‑101 TTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCC < 2:201508/101‑1 TTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCC < 2:1418007/101‑1 AGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACT < 1:647668/101‑1 TAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:1135889/101‑1 AAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:1380431/1‑101 ACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 2:267133/1‑101 ACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 2:832312/101‑1 CGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:1333980/101‑1 ATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:677155/101‑1 TTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 2:1513126/1‑101 TTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:120286/101‑1 TTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:865096/101‑1 CTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:892944/1‑101 TTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 2:789641/101‑1 TCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 2:353422/101‑1 CCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:1089797/1‑101 CTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 2:498670/1‑101 CTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:1149332/1‑101 CTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 2:1714295/1‑101 CCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:1074400/101‑1 CCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:1363692/101‑1 CCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:936403/101‑1 CTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:815364/101‑1 CTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:637158/101‑1 TGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 2:1413191/1‑101 GGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:838911/101‑1 GGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 2:342096/101‑1 GGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:256858/101‑1 CCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:1714233/101‑1 CGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:1609967/101‑1 GGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:6171/1‑101 GGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:1669574/101‑1 CTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:1281288/1‑101 TTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 2:1530215/101‑1 TTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 2:1089792/101‑1 CAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 2:1688729/101‑1 GGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 1:718971/101‑1 GGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 2:755690/101‑1 GGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:842094/101‑1 GGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:1356049/1‑101 AGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA > 2:1135501/1‑101 GGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 1:972919/101‑1 CAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 1:621965/101‑1 CAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC > 2:774465/1‑101 AATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 2:192080/1‑101 AATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 1:381040/101‑1 GCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:1657785/1‑101 GCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGCAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTAATGCAGCTCCACCGA > 2:1458084/1‑101 GATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTT < 1:654030/101‑1 GATGATGCAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTT < 1:596775/101‑1 CAGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAC < 1:454534/101‑1 AGGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:1500070/1‑101 GGTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 2:303158/1‑101 GTAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAC < 1:381750/101‑1 TAACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 2:150389/101‑1 ACGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC > 2:144852/1‑101 CGTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG < 2:1245986/101‑1 GTCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 1:1243902/1‑101 TCAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 1:1510336/1‑101 CAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT < 2:386519/101‑1 CAGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATCTTGAGAACGACAGCGACT < 1:1413197/101‑1 AGCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTT > 2:181513/1‑101 GCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC < 1:272041/101‑1 CCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 1:1492742/1‑101 CCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 2:4435/1‑101 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > 1:341804/1‑101 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG < 2:49448/101‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 2:528937/1‑101 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 1:1105121/101‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 1:471293/1‑101 GGTCGGCAGGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2405040‑2405139 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > REL606/2407442‑2407541 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |