Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
JC REL606 3,947,860 (ATTGATA)1→2 100% intergenic (‑54/+632) aslA ← / ← hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 3947854 =9 (0.090)88 (1.340) 42/56 NT 96.6% intergenic (‑48/+638) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein
?REL606 = 3947860 0 (0.000)intergenic (‑54/+632) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

Only 100 of 332 total aligned reads displayed.

AAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAG  >  REL606/3947810‑3947910
                                                  |                                                  
ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                                    <  1:10010068‑M1/7‑1 (MQ=255)
ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                                    >  1:6073871‑M1/45‑51 (MQ=255)
ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                                    >  1:1072645‑M1/45‑51 (MQ=255)
aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata                                                    >  1:3427546/1‑51 (MQ=255)
 cggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa                                                   >  1:4761714‑M1/44‑51 (MQ=255)
  ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                                  <  1:5633567‑M1/9‑1 (MQ=255)
  ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                                  <  1:4864078‑M1/9‑1 (MQ=255)
    tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                                >  1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255)
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    gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattg                                                >  1:3495586‑M2/1‑47 (MQ=255)
     ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga                                               <  1:903543‑M1/12‑1 (MQ=255)
      tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat                                              >  1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255)
      tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                              <  1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255)
      tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                              <  1:3896538‑M2/51‑7 (MQ=255)
      tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                              <  1:3838873‑M2/51‑7 (MQ=255)
      tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                              <  1:6836851‑M2/51‑7 (MQ=255)
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       ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata                                             >  1:534399‑M2/1‑44 (MQ=255)
        cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa                                            <  1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255)
        atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa                                            >  1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255)
         tgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataat                                           >  1:2221661‑M1/36‑51 (MQ=255)
         ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat                                           >  1:9011208‑M2/1‑42 (MQ=255)
          gtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataatt                                          >  1:8631263‑M1/35‑51 (MQ=255)
          gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt                                          >  1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255)
           tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattg                                         >  1:9111143‑M2/1‑40 (MQ=255)
            ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga                                        <  1:1163449‑M2/51‑13 (MQ=255)
            cgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataattga                                        >  1:5297400‑M1/33‑51 (MQ=255)
             tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat                                       <  1:1085742‑M2/51‑14 (MQ=255)
             tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat                                       <  1:1871346‑M2/51‑14 (MQ=255)
             gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag                                       >  1:7496226‑M1/32‑51 (MQ=255)
             gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag                                       >  1:7082444‑M1/32‑51 (MQ=255)
              tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                      >  1:10534092‑M1/31‑51 (MQ=255)
              tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                      <  1:354980‑M1/21‑1 (MQ=255)
              tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                      <  1:5044630‑M1/21‑1 (MQ=255)
              cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgata                                      <  1:5902205‑M2/51‑15 (MQ=255)
              cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgata                                      >  1:7880397‑M2/1‑37 (MQ=255)
               caaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGAt                                     <  1:2528811‑M1/22‑1 (MQ=255)
                aaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATc                                    >  1:6361775‑M1/29‑51 (MQ=255)
                 aaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATcc                                   <  1:3735324‑M1/24‑1 (MQ=255)
                  aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc                                  <  1:491980‑M1/25‑1 (MQ=255)
                  aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc                                  <  1:4833742‑M1/25‑1 (MQ=255)
                   cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga                                 >  1:5769630‑M2/1‑32 (MQ=255)
                   cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga                                 <  1:4386515‑M2/51‑20 (MQ=255)
                   atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                                 >  1:5167293‑M1/26‑51 (MQ=255)
                   atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                                 <  1:8556257‑M1/26‑1 (MQ=255)
                   atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                                 <  1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255)
                    gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag                                <  1:1557258‑M2/51‑21 (MQ=255)
                    gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag                                <  1:9205145‑M2/51‑21 (MQ=255)
                      ttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCtctc                              >  1:7768052‑M1/23‑51 (MQ=255)
                      cAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagat                              <  1:8693271‑M2/51‑23 (MQ=255)
                         aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                           <  1:2424988‑M2/51‑26 (MQ=255)
                         aaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccc                           <  1:3690837‑M2/51‑26 (MQ=255)
                          aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct                          <  1:968276‑M2/51‑27 (MQ=255)
                           gtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGa                         <  1:8133249‑M1/34‑1 (MQ=255)
                            taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc                        >  1:6871999‑M1/17‑51 (MQ=255)
                            gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct                        >  1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255)
                             aattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACa                       >  1:9399714‑M1/16‑51 (MQ=255)
                             aattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACa                       <  1:4304070‑M1/36‑1 (MQ=255)
                               ttaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAgg                     >  1:2387845‑M1/14‑51 (MQ=255)
                                taagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGga                    >  1:6317375‑M1/13‑51 (MQ=255)
                                aCGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccct                    >  1:6889030‑M2/1‑19 (MQ=255)
                                   tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac                 <  1:6491005‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                   tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac                 <  1:8341498‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                   tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac                 <  1:10038147‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                   gcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgatga                 >  1:2504371‑M1/10‑51 (MQ=255)
                                    aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca                <  1:8904569‑M2/51‑37 (MQ=255)
                                     aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag               <  1:8678720‑M2/51‑38 (MQ=255)
                                      ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTg              <  1:7619353‑M1/45‑1 (MQ=255)
                                      ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTg              >  1:4971822‑M1/7‑51 (MQ=255)
                                      ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTg              <  1:8336462‑M1/45‑1 (MQ=255)
                                       tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc             <  1:2655776‑M1/46‑1 (MQ=255)
                                       tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc             >  1:1155596‑M1/6‑51 (MQ=255)
                                        aaGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggat            >  1:10885048‑M2/1‑11 (MQ=255)
                                        aaGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggat            >  1:4873604‑M2/1‑11 (MQ=255)
                                        aaGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggat            >  1:2742652‑M2/1‑11 (MQ=255)
                                         ataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCat           <  1:9841650‑M1/48‑1 (MQ=255)
                                          taATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCata          <  1:7261406‑M1/49‑1 (MQ=255)
                                          taATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCata          >  1:9670208‑M1/3‑51 (MQ=255)
                                          gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga          <  1:5263668‑M2/51‑43 (MQ=255)
                                           cATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgat         >  1:1017112‑M2/1‑8 (MQ=255)
                                           cATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgat         <  1:7517988‑M2/51‑44 (MQ=255)
                                           aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa         >  1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                           aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa         >  1:6935522‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                           aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa         >  1:1189055‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                            attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt        >  1:6708688‑M2/1‑7 (MQ=255)
                                             TTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataaat       <  1:2865230‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                              TGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataaata      >  1:4948173‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                               gataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgca     <  1:10420067‑M2/51‑48 (MQ=255)
                                               GATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataaataa     <  1:64385‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                                ATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAaataat    >  1:1821637‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                ATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAaataat    >  1:7459984‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                ATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAaataat    <  1:2931152‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                                 TAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAataata   >  1:565804‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                 TAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAataata   >  1:1385351‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                 TAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAataata   >  1:7124370‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                 TAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAataata   >  1:802316‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                  aattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa  >  1:3759438‑M2/1‑1 (MQ=255)
                                                  aattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgattgcataa  >  1:3941439‑M2/1‑1 (MQ=255)
                                                  AATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAg  >  1:2039026‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                  AATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAg  >  1:3855347‑M1/1‑51 (MQ=255)
                                                  |                                                  
AAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAG  >  REL606/3947810‑3947910

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.