Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
JC REL606 3,947,860 (ATTGATA)1→2 100% intergenic (‑54/+632) aslA ← / ← hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 3947854 =9 (0.090)88 (1.340) 42/56 NT 96.6% intergenic (‑48/+638) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein
?REL606 = 3947860 0 (0.000)intergenic (‑54/+632) aslA/hemY acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein

Only 100 of 323 total aligned reads displayed.

CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA  >  REL606/3947804‑3947904
                                                  |                                                  
cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCa                                                    <  1:1417415/51‑1 (MQ=255)
aatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataa                                                    >  1:3244142‑M1/51‑51 (MQ=255)
 aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat                                                   <  1:4373757/51‑1 (MQ=255)
 aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat                                                   >  1:9180029/1‑51 (MQ=255)
  tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt                                                  >  1:5448528‑M1/49‑51 (MQ=255)
  tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt                                                  <  1:5857661‑M1/3‑1 (MQ=255)
  tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt                                                  >  1:3818360/1‑51 (MQ=255)
     tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat                                               <  1:3838873‑M1/6‑1 (MQ=255)
      ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                              >  1:6073871‑M1/45‑51 (MQ=255)
      ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata                                              <  1:10010068‑M1/7‑1 (MQ=255)
      aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata                                              <  1:9372478/51‑1 (MQ=255)
      aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata                                              >  1:4780041/1‑51 (MQ=255)
       cggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa                                             >  1:4761714‑M1/44‑51 (MQ=255)
       aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAa                                             <  1:7928680‑M2/51‑2 (MQ=255)
        ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                            >  1:6832522‑M1/43‑51 (MQ=255)
        ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                            >  1:288858‑M1/43‑51 (MQ=255)
        ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat                                            >  1:9011208‑M1/43‑51 (MQ=255)
         tGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatt                                           >  1:6625654‑M2/1‑48 (MQ=255)
          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          <  1:1839573‑M1/11‑1 (MQ=255)
          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          >  1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255)
          tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg                                          >  1:7479153‑M1/41‑51 (MQ=255)
          gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattg                                          <  1:10479472‑M2/51‑5 (MQ=255)
          gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattg                                          >  1:3495586‑M2/1‑47 (MQ=255)
           ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga                                         <  1:903543‑M1/12‑1 (MQ=255)
           cTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattga                                         <  1:8084405‑M2/51‑6 (MQ=255)
            tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat                                        >  1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255)
            tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat                                        <  1:1085742‑M1/13‑1 (MQ=255)
            tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                        <  1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255)
            tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                        <  1:3896538‑M2/51‑7 (MQ=255)
            tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat                                        <  1:6836851‑M2/51‑7 (MQ=255)
             ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata                                       >  1:4718156‑M2/1‑44 (MQ=255)
             catgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata                                       >  1:7880397‑M1/38‑51 (MQ=255)
              cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa                                      <  1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255)
              atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa                                      >  1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255)
              atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa                                      >  1:4928833‑M1/37‑51 (MQ=255)
               ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat                                     <  1:5633567‑M2/51‑10 (MQ=255)
                gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt                                    >  1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255)
                 tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattg                                   <  1:980328‑M2/51‑12 (MQ=255)
                 tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattg                                   >  1:9111143‑M2/1‑40 (MQ=255)
                  ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga                                  <  1:2335221‑M2/51‑13 (MQ=255)
                  ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga                                  <  1:1163449‑M2/51‑13 (MQ=255)
                   tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat                                 <  1:1871346‑M2/51‑14 (MQ=255)
                   gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag                                 <  1:3727239‑M1/20‑1 (MQ=255)
                    tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                <  1:354980‑M1/21‑1 (MQ=255)
                    tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                >  1:10534092‑M1/31‑51 (MQ=255)
                    tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga                                <  1:7294104‑M1/21‑1 (MQ=255)
                    cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgata                                <  1:5902205‑M2/51‑15 (MQ=255)
                    cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatcgataattgata                                >  1:7127616‑M2/1‑37 (MQ=255)
                     caaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGAt                               <  1:2528811‑M1/22‑1 (MQ=255)
                      tGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataat                              >  1:4837730‑M2/1‑35 (MQ=255)
                       gtcgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataatt                             >  1:8631263‑M2/1‑34 (MQ=255)
                        aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc                            <  1:2424988‑M1/25‑1 (MQ=255)
                        aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATcc                             <  1:8689791‑M1/24‑1 (MQ=255)
                         cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga                           >  1:5297400‑M2/1‑32 (MQ=255)
                         atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                           <  1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255)
                         atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                           <  1:968276‑M1/26‑1 (MQ=255)
                         atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct                           <  1:8556257‑M1/26‑1 (MQ=255)
                          gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag                          >  1:7496226‑M2/1‑31 (MQ=255)
                            cAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagat                        <  1:8693271‑M2/51‑23 (MQ=255)
                             tgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTcc                       <  1:3872623‑M1/30‑1 (MQ=255)
                             aaaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatc                       >  1:6361775‑M2/1‑28 (MQ=255)
                              gacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTccc                      <  1:2783612‑M1/31‑1 (MQ=255)
                              gacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTccc                      <  1:7519369‑M1/31‑1 (MQ=255)
                              aaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatcc                      <  1:3735324‑M2/51‑25 (MQ=255)
                               acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt                     <  1:9653589‑M1/32‑1 (MQ=255)
                               acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt                     >  1:5358904‑M1/20‑51 (MQ=255)
                               acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt                     >  1:6889030‑M1/20‑51 (MQ=255)
                                cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg                    <  1:5281508‑M1/33‑1 (MQ=255)
                                cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg                    >  1:3473540‑M1/19‑51 (MQ=255)
                                aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct                    >  1:5167293‑M2/1‑25 (MQ=255)
                                 tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc                   >  1:4891372‑M2/1‑24 (MQ=255)
                                 tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc                   >  1:6931169‑M2/1‑24 (MQ=255)
                                  taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc                  <  1:6491005‑M1/35‑1 (MQ=255)
                                  taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc                  <  1:8341498‑M1/35‑1 (MQ=255)
                                  gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct                  >  1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255)
                                   ttGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctc                 >  1:10928402‑M2/1‑22 (MQ=255)
                                    tGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctcc                <  1:6847772‑M2/51‑31 (MQ=255)
                                    attaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAg                >  1:17649‑M1/15‑51 (MQ=255)
                                    attaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAg                >  1:5132616‑M1/15‑51 (MQ=255)
                                      taagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGga              >  1:6317375‑M1/13‑51 (MQ=255)
                                       aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat             >  1:2742652‑M1/12‑51 (MQ=255)
                                       aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat             >  1:10885048‑M1/12‑51 (MQ=255)
                                       aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat             >  1:4873604‑M1/12‑51 (MQ=255)
                                        gTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctga            <  1:8133249‑M2/51‑35 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           <  1:10038147‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           <  1:7711672‑M2/51‑36 (MQ=255)
                                         tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac           >  1:5753620‑M2/1‑16 (MQ=255)
                                          aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca          >  1:4066010‑M2/1‑15 (MQ=255)
                                          aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca          <  1:8904569‑M2/51‑37 (MQ=255)
                                           aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag         <  1:10700671‑M2/51‑38 (MQ=255)
                                            ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTg        >  1:4971822‑M1/7‑51 (MQ=255)
                                            ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCATCTCCCTGACAGGATGATTg        >  1:2116840‑M1/7‑51 (MQ=255)
                                             tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc       <  1:4515786‑M1/46‑1 (MQ=255)
                                              gataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCa      <  1:10420067‑M1/47‑1 (MQ=255)
                                                gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga    >  1:2504371‑M2/1‑9 (MQ=255)
                                                 cATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgat   >  1:1017112‑M2/1‑8 (MQ=255)
                                                 aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa   >  1:3941439‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                                 aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa   >  1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                                 aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa   >  1:1189055‑M1/2‑51 (MQ=255)
                                                  attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt  >  1:7032497‑M2/1‑7 (MQ=255)
                                                  |                                                  
CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA  >  REL606/3947804‑3947904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.