Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 3,947,860 | (ATTGATA)1→2 | 100% | intergenic (‑54/+632) | aslA ← / ← hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3947854 = | 9 (0.090) | 88 (1.340) | 42/56 | NT | 96.6% | intergenic (‑48/+638) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
? | REL606 | = 3947860 | 0 (0.000) | intergenic (‑54/+632) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA > REL606/3947804‑3947904 | cATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCa < 1:1417415/51‑1 (MQ=255) aatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataa > 1:3244142‑M1/51‑51 (MQ=255) aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat < 1:4373757/51‑1 (MQ=255) aTGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCat > 1:9180029/1‑51 (MQ=255) tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt > 1:5448528‑M1/49‑51 (MQ=255) tgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataatt < 1:5857661‑M1/3‑1 (MQ=255) tGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCatt > 1:3818360/1‑51 (MQ=255) tccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgat < 1:3838873‑M1/6‑1 (MQ=255) ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata > 1:6073871‑M1/45‑51 (MQ=255) ccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgata < 1:10010068‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata < 1:9372478/51‑1 (MQ=255) aaaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCattgata > 1:4780041/1‑51 (MQ=255) cggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 1:4761714‑M1/44‑51 (MQ=255) aaTGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAa < 1:7928680‑M2/51‑2 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat > 1:6832522‑M1/43‑51 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat > 1:288858‑M1/43‑51 (MQ=255) ggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataat > 1:9011208‑M1/43‑51 (MQ=255) tGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatt > 1:6625654‑M2/1‑48 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg < 1:1839573‑M1/11‑1 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:1011682‑M1/41‑51 (MQ=255) tttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattg > 1:7479153‑M1/41‑51 (MQ=255) gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattg < 1:10479472‑M2/51‑5 (MQ=255) gCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattg > 1:3495586‑M2/1‑47 (MQ=255) ttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 1:903543‑M1/12‑1 (MQ=255) cTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattga < 1:8084405‑M2/51‑6 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat > 1:5957929‑M1/39‑51 (MQ=255) tcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgat < 1:1085742‑M1/13‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:5517504‑M2/51‑7 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:3896538‑M2/51‑7 (MQ=255) tCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgat < 1:6836851‑M2/51‑7 (MQ=255) ccGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgata > 1:4718156‑M2/1‑44 (MQ=255) catgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata > 1:7880397‑M1/38‑51 (MQ=255) cGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataa < 1:2671723‑M2/51‑9 (MQ=255) atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa > 1:3583164‑M1/37‑51 (MQ=255) atgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa > 1:4928833‑M1/37‑51 (MQ=255) ggTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataat < 1:5633567‑M2/51‑10 (MQ=255) gTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataatt > 1:947183‑M2/1‑41 (MQ=255) tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattg < 1:980328‑M2/51‑12 (MQ=255) tttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattg > 1:9111143‑M2/1‑40 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga < 1:2335221‑M2/51‑13 (MQ=255) ttCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattga < 1:1163449‑M2/51‑13 (MQ=255) tCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgat < 1:1871346‑M2/51‑14 (MQ=255) gtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgag < 1:3727239‑M1/20‑1 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga < 1:354980‑M1/21‑1 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga > 1:10534092‑M1/31‑51 (MQ=255) tcaaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTgaga < 1:7294104‑M1/21‑1 (MQ=255) cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgata < 1:5902205‑M2/51‑15 (MQ=255) cATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAatcgataattgata > 1:7127616‑M2/1‑37 (MQ=255) caaaatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGAt < 1:2528811‑M1/22‑1 (MQ=255) tGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataat > 1:4837730‑M2/1‑35 (MQ=255) gtcgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataatt > 1:8631263‑M2/1‑34 (MQ=255) aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATccc < 1:2424988‑M1/25‑1 (MQ=255) aatgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATcc < 1:8689791‑M1/24‑1 (MQ=255) cgtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattga > 1:5297400‑M2/1‑32 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct < 1:884084‑M1/26‑1 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct < 1:968276‑M1/26‑1 (MQ=255) atgttgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCct < 1:8556257‑M1/26‑1 (MQ=255) gtcAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgag > 1:7496226‑M2/1‑31 (MQ=255) cAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagat < 1:8693271‑M2/51‑23 (MQ=255) tgacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTcc < 1:3872623‑M1/30‑1 (MQ=255) aaaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatc > 1:6361775‑M2/1‑28 (MQ=255) gacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTccc < 1:2783612‑M1/31‑1 (MQ=255) gacgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTccc < 1:7519369‑M1/31‑1 (MQ=255) aaaTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatcc < 1:3735324‑M2/51‑25 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt < 1:9653589‑M1/32‑1 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt > 1:5358904‑M1/20‑51 (MQ=255) acgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCt > 1:6889030‑M1/20‑51 (MQ=255) cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg < 1:5281508‑M1/33‑1 (MQ=255) cgtaattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTg > 1:3473540‑M1/19‑51 (MQ=255) aTGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccct > 1:5167293‑M2/1‑25 (MQ=255) tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc > 1:4891372‑M2/1‑24 (MQ=255) tGTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctc > 1:6931169‑M2/1‑24 (MQ=255) taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc < 1:6491005‑M1/35‑1 (MQ=255) taattaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGAc < 1:8341498‑M1/35‑1 (MQ=255) gTTGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctct > 1:6157681‑M2/1‑23 (MQ=255) ttGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctc > 1:10928402‑M2/1‑22 (MQ=255) tGACGTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctcc < 1:6847772‑M2/51‑31 (MQ=255) attaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAg > 1:17649‑M1/15‑51 (MQ=255) attaagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAg > 1:5132616‑M1/15‑51 (MQ=255) taagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGga > 1:6317375‑M1/13‑51 (MQ=255) aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat > 1:2742652‑M1/12‑51 (MQ=255) aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat > 1:10885048‑M1/12‑51 (MQ=255) aagcattgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGgat > 1:4873604‑M1/12‑51 (MQ=255) gTAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctga < 1:8133249‑M2/51‑35 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac < 1:10038147‑M2/51‑36 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac < 1:7711672‑M2/51‑36 (MQ=255) tAATTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgac > 1:5753620‑M2/1‑16 (MQ=255) aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca > 1:4066010‑M2/1‑15 (MQ=255) aaTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgaca < 1:8904569‑M2/51‑37 (MQ=255) aTTAAGCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacag < 1:10700671‑M2/51‑38 (MQ=255) ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTg > 1:4971822‑M1/7‑51 (MQ=255) ttgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCATCTCCCTGACAGGATGATTg > 1:2116840‑M1/7‑51 (MQ=255) tgataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGc < 1:4515786‑M1/46‑1 (MQ=255) gataATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCa < 1:10420067‑M1/47‑1 (MQ=255) gCATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatga > 1:2504371‑M2/1‑9 (MQ=255) cATTGATAattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgat > 1:1017112‑M2/1‑8 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:3941439‑M1/2‑51 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:626420‑M1/2‑51 (MQ=255) aATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCataa > 1:1189055‑M1/2‑51 (MQ=255) attgataattgataattgataattgagatccctctccctgacaggatgatt > 1:7032497‑M2/1‑7 (MQ=255) | CATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAA > REL606/3947804‑3947904 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |