| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,584,733 | 10 bp→CGCCGTAT | 11.1% | coding (663‑672/1191 nt) | sotB → | sugar efflux transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 1584732 | 69 (0.730) | 7 (0.090) +CGCCGTAT |
3/64 | NT | 11.1% | coding (662/1191 nt) | sotB | sugar efflux transporter |
| ? | REL606 | 1584743 = | 72 (0.760) | coding (673/1191 nt) | sotB | sugar efflux transporter | |||||
TTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACAAA > REL606/1584683‑1584782 | ttGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGtt < 1:6506231/51‑1 (MQ=255)ttGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGtt > 1:4952303/1‑51 (MQ=255)ttGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGtt < 1:4983225/51‑1 (MQ=255)ttGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGtt > 1:7362578/1‑51 (MQ=255) tGTTCCGCTGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg > 1:122713/1‑51 (MQ=255) tGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg > 1:8486436/1‑51 (MQ=255) gTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGt > 1:10533446/1‑51 (MQ=255) gTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGt < 1:223054/51‑1 (MQ=255) tCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCa < 1:8246332/51‑1 (MQ=255) tCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCa > 1:583116/1‑51 (MQ=255) tCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCa > 1:8889025/1‑51 (MQ=255) cgccgcCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCAcc < 1:160478/51‑1 (MQ=255) gccgccCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCg < 1:7133562/51‑1 (MQ=255) gccgccCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCg < 1:8727878/51‑1 (MQ=255) cgccCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGcc > 1:1032401/1‑51 (MQ=255) gccCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGccc < 1:8654629/51‑1 (MQ=255) gccCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGccc < 1:57464/51‑1 (MQ=255) cccGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa < 1:2057359/51‑1 (MQ=255) ccGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAt > 1:4049868/1‑51 (MQ=255) ccGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAt < 1:10895486/51‑1 (MQ=255) cGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAtt > 1:9830103/1‑51 (MQ=255) ggCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTa < 1:7310167/51‑1 (MQ=255) ggCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTa > 1:6033143/1‑51 (MQ=255) gCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTac > 1:887706/1‑51 (MQ=255) gCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTac < 1:8596187/51‑1 (MQ=255) cATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTaca < 1:7109354/51‑1 (MQ=255) cATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTaca > 1:7576813/1‑51 (MQ=255) aTTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTacac < 1:10418001/51‑1 (MQ=255) aTTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTacac < 1:2355853/51‑1 (MQ=255) ttGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAtt > 1:2567512/1‑46 (MQ=255) ttGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACg < 1:5823879/51‑1 (MQ=255) tgatgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACgg < 1:6208346/51‑1 (MQ=255) tgatgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACgg > 1:4930414/1‑51 (MQ=255) gatgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACg < 1:9332505/49‑1 (MQ=255) gatgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGc > 1:10800146/1‑51 (MQ=255) gatgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGc < 1:6580971/51‑1 (MQ=255) atgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCa > 1:7876978/1‑51 (MQ=255) atgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCa > 1:8631399/1‑51 (MQ=255) tgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCAt > 1:4249672/1‑51 (MQ=255) tgaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCAt < 1:5945031/51‑1 (MQ=255) gaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATa < 1:778530/51‑1 (MQ=255) gaGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATa < 1:10244582/51‑1 (MQ=255) aGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATAc > 1:2407323/1‑51 (MQ=255) gCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACa > 1:5520006/1‑51 (MQ=255) gCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACa > 1:3977015/1‑51 (MQ=255) gCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACa < 1:2966316/51‑1 (MQ=255) gCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACa < 1:7768266/51‑1 (MQ=255) gCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACa < 1:339583/51‑1 (MQ=255) cATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAg > 1:5892898/1‑51 (MQ=255) cATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAg < 1:2867666/51‑1 (MQ=255) cATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAg < 1:10202815/51‑1 (MQ=255) cATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAg < 1:8983077/51‑1 (MQ=255) tttatttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCt < 1:462402/51‑1 (MQ=255) ttatttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCta > 1:2544108/1‑51 (MQ=255) ttatttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCta < 1:6472020/51‑1 (MQ=255) ttatttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCta < 1:8420504/51‑1 (MQ=255) ttatttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCta < 1:9417635/51‑1 (MQ=255) tttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTatat > 1:6455492/1‑51 (MQ=255) tttGTTAACTGCGGTGGTcgccgtatcattacacggcatacag < 1:2102383‑M1/43‑26 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:96794/51‑1 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:9592371/51‑1 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:6816569/51‑1 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:6997908/51‑1 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:5363607/51‑1 (MQ=255) ttGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:4104705/51‑1 (MQ=255) tGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc > 1:10337145/1‑50 (MQ=255) tGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCg > 1:121242/1‑51 (MQ=255) tGTTAACTGCGGTGGTcgccgtatcattacacggcatac < 1:9436221‑M1/39‑24 (MQ=255) tGTTAACTGCGGTGGTcgccgtatcattacacgg < 1:9996282‑M1/34‑19 (MQ=255) gTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATc < 1:2372566/49‑1 (MQ=255) gTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGa < 1:1314495/51‑1 (MQ=255) gTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGa < 1:7082982/51‑1 (MQ=255) tAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGc < 1:5806748/51‑1 (MQ=255) tAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGc < 1:3019526/51‑1 (MQ=255) aCTGTGGTGGGTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGc > 1:2936821/1‑49 (MQ=255) cTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCtt < 1:1800937/51‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCttt < 1:4241600/51‑1 (MQ=255) gtggtgGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCtttt < 1:3685623/51‑1 (MQ=255) gtggtgGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCtttt < 1:4541142/51‑1 (MQ=255) tggtggTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTg < 1:8868139/51‑1 (MQ=255) tggtggTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTg < 1:9041396/51‑1 (MQ=255) tggtggTTGTCACCACCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTg < 1:6648368/51‑1 (MQ=255) cggtggtcgccgtatcattacacggcatacagctatatcgagccttttgta < 1:6638802‑M1/50‑45 (MQ=255) cggtggtcgccgtatcattacacggcatacagctatatcgagccttttgta < 1:10595799‑M1/50‑45 (MQ=255) cggtggtcgccgtatcattacacggcatacagctatatcgagccttttgta < 1:6109801‑M1/50‑45 (MQ=255) cggtggtcgccgtatcattacacggcatacagctatatcgagcctt < 1:7297274‑M1/45‑40 (MQ=255) ggtggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATGCAGCTATATCGAGCCTTTTGt < 1:3557229/51‑1 (MQ=255) gtggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTa > 1:3600926/1‑51 (MQ=255) gtggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTa < 1:6009907/51‑1 (MQ=255) gtggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTa < 1:10203174/51‑1 (MQ=255) tggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTAc > 1:10620848/1‑51 (MQ=255) ggtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACa < 1:7862047/51‑1 (MQ=255) gtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACaa > 1:7337245/1‑51 (MQ=255) gtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACaa < 1:9592888/51‑1 (MQ=255) gtTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACaa > 1:9091593/1‑51 (MQ=255) ttGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACaaa < 1:596183/51‑1 (MQ=255) tcgccgtatcattacacggcatacagctatatcgagccttttgtacaaaac < 1:8791993‑M1/51‑51 (MQ=255) | TTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATACAGCTATATCGAGCCTTTTGTACAAA > REL606/1584683‑1584782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |