| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2103888 = | 45 (0.560) | 58 (0.740) +G |
43/98 | 0.6 | 57.4% | coding (155/216 nt) | ECB_01992 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 2103918 | 43 (0.540) | coding (185/216 nt) | ECB_01992 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GAAATTTGCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATACTATA > REL606/2103868‑2103968 | gAAATTTGCATTAGATTTCACAGccagccagccagccagccagccagccag > 1:5077591/1‑51 (MQ=255)cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:2323898‑M1/31‑1 (MQ=255) agccagccagccagccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAgg < 1:5545872‑M1/32‑1 (MQ=255) ccagccagccagccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAgg < 1:5757717‑M1/32‑1 (MQ=255) aTTTGCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGcca > 1:1536182‑M2/1‑48 (MQ=255) ttGCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagc < 1:6653903‑M2/51‑6 (MQ=255) gCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagcca < 1:2180324‑M2/51‑8 (MQ=255) gCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagcca > 1:68426‑M2/1‑44 (MQ=255) agccagccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAAtg < 1:2020424‑M1/40‑1 (MQ=255) aTTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagc < 1:676454‑M2/51‑10 (MQ=255) aTTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagc < 1:5924014‑M2/51‑10 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:7246113‑M1/31‑1 (MQ=255) ccagccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGaa > 1:6564873‑M1/10‑47 (MQ=255) cagccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTgg > 1:1887754‑M1/9‑51 (MQ=255) aGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagcc > 1:6082303‑M2/1‑39 (MQ=255) aTTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagccagcc < 1:6392701‑M2/51‑15 (MQ=255) tttCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagcca > 1:2350634‑M2/1‑36 (MQ=255) tttCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagcca > 1:2619638‑M2/1‑36 (MQ=255) ccagcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAAtgtg > 1:999504‑M1/6‑47 (MQ=255) ttCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagccagccag > 1:4408399‑M2/1‑35 (MQ=255) tCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagccagccagc < 1:1571044‑M2/51‑18 (MQ=255) agcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTGGAtttt < 1:3096368‑M1/48‑1 (MQ=255) agcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTGGAtt > 1:6834078‑M1/4‑49 (MQ=255) gcCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTGGATTTTg > 1:1202591‑M1/3‑51 (MQ=255) acaGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGccagccagccagccagcca < 1:4344694‑M2/51‑20 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:4732352‑M2/51‑21 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:4312028‑M2/51‑21 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagcCAGGTGTGAATGTGGATTTTGta > 1:608502/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagcCAGGTGTGAATGTGGATTTTGta > 1:2174107/1‑51 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagc < 1:6120902‑M2/51‑22 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagc < 1:3104268‑M2/51‑22 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc < 1:6277344‑M2/51‑23 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccaGGTGTGAATGTGGATTTTGtact > 1:1739868/1‑51 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccaGGTGTGAATGTGGATTTTGtact < 1:987233/51‑1 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccaGGTGTGAATGTGGATTTTGtact < 1:5406651/51‑1 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccaGGTGTGAATGTGGATTTTGtact > 1:5405270/1‑51 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcca < 1:1724712‑M2/51‑24 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:5541211‑M2/1‑28 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:3707266‑M2/1‑28 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:5476020‑M2/1‑28 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGtacta < 1:4440738/51‑1 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag > 1:1455202‑M2/1‑27 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagGTGTGAAtgtg < 1:6109516/37‑1 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACg < 1:6069689/51‑1 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGa > 1:1731348/1‑51 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaa < 1:6731258/51‑1 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:1441319‑M2/51‑29 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:4726136‑M2/51‑29 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGtactac < 1:4599930/47‑1 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaaa > 1:2217754/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaaa > 1:2217753/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaaa > 1:2345562/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaaa > 1:587535/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGaaa > 1:5486914/1‑51 (MQ=255) agccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAaat > 1:1472365/1‑51 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:2778787‑M2/1‑21 (MQ=255) gccagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAaata < 1:3697556/51‑1 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcca < 1:940143‑M2/51‑32 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcca < 1:3123728‑M2/51‑32 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:1591742‑M2/1‑20 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:2323898‑M2/51‑33 (MQ=255) cagccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAaataat < 1:4483065/51‑1 (MQ=255) agccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAAtt > 1:515760/1‑51 (MQ=255) agccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAAtt > 1:1253785/1‑51 (MQ=255) agccagccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAAtt < 1:1203823/51‑1 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccagccagcc > 1:2362698‑M2/1‑17 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtg < 1:320766‑M2/51‑36 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagg < 1:5757717‑M2/49‑34 (MQ=255) agccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGccc > 1:2453640/1‑51 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtga > 1:6994286‑M2/1‑13 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaa < 1:1611772‑M2/51‑40 (MQ=255) ccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCtt < 1:1209674/51‑1 (MQ=255) ccagccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCtt < 1:2306743/51‑1 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaat < 1:4664204‑M2/51‑41 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaat > 1:930350‑M2/1‑11 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatg < 1:2020424‑M2/51‑42 (MQ=255) agccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCttat > 1:6354280/1‑51 (MQ=255) agccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCttat < 1:354409/51‑1 (MQ=255) gccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCttatt < 1:5236563/51‑1 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaa > 1:6564873‑M2/1‑8 (MQ=255) ccagccagccagccagccagccagccagccagccagccag < 1:7246113‑M2/40‑33 (MQ=255) ccagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCttatta < 1:6930119/51‑1 (MQ=255) cagtcagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACAAAATAATTGCCCTtattat > 1:4557458/1‑51 (MQ=255) cagccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtgg > 1:1887754‑M2/1‑7 (MQ=255) cagccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTtattat < 1:7149616/51‑1 (MQ=255) agccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATtata > 1:2672762/1‑51 (MQ=255) agccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATtata > 1:1510926/1‑51 (MQ=255) agccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATtata > 1:4025042/1‑51 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtgg > 1:1488531‑M2/1‑5 (MQ=255) gccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATAc < 1:633710/51‑1 (MQ=255) gccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATAc < 1:5156340/51‑1 (MQ=255) ccagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATACt < 1:2220014/51‑1 (MQ=255) cagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATACta < 1:2623722/51‑1 (MQ=255) cagGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATACta > 1:1030411/1‑51 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggatttt > 1:2609112‑M2/1‑2 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggatttt > 1:4446360‑M2/1‑2 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggatttt < 1:2304464‑M2/51‑50 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggatttt < 1:3096368‑M2/51‑50 (MQ=255) agccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggatt > 1:6834078‑M2/1‑2 (MQ=255) gccagccagccagccagccagccagccagccaggtgtgaatgtggattttg > 1:1202591‑M2/1‑1 (MQ=255) | GAAATTTGCATTAGATTTCACAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGCCAGGTGTGAATGTGGATTTTGTACTACGAAATAATTGCCCTTATTATACTATA > REL606/2103868‑2103968 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |