| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 75 (0.940) | 46/100 | 0.5 | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 96 (1.210) | 58/100 | 0.1 | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
ATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATA > REL606/2522852‑2522952 | aTTTTCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:5349120/1‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:2256418‑M1/4‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:4463337‑M1/4‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:3074578‑M1/48‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:766039‑M1/4‑1 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtccaGCTgg > 1:341497‑M1/47‑51 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGt < 1:3313060‑M1/6‑1 (MQ=255) tGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgt > 1:4353507‑M1/1‑48 (MQ=255) ccGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtac > 1:3499663‑M1/1‑46 (MQ=255) cGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtact < 1:3996496‑M1/51‑7 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg < 1:1577401‑M1/51‑8 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:2007470‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:683829‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:1840938‑M1/1‑44 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtctc > 1:5463526‑M1/40‑51 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:5443603‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:1680484‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:3156584‑M1/1‑41 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc > 1:3053606‑M1/39‑51 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:2729399‑M1/13‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:4717113‑M1/13‑1 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:1479937‑M1/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:830634‑M1/38‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:4619501‑M1/36‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:4825944‑M1/36‑51 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:6473295‑M1/1‑38 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:5390249‑M1/1‑38 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:4056966‑M1/1‑37 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:1649916‑M1/1‑37 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa < 1:1599044‑M1/51‑15 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaa > 1:4078276‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:2556088‑M1/51‑17 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtg < 1:6996901‑M1/19‑1 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtg < 1:576668‑M1/19‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:2946887‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:6127535‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:1150019‑M1/20‑1 (MQ=255) tGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaa > 1:6899198‑M1/1‑34 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:3915049‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:3293730‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:2692149‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:618240‑M1/31‑51 (MQ=255) gCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaag < 1:6516389‑M1/51‑19 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:4235897‑M1/30‑51 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:3203195‑M1/1‑32 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:2582043‑M1/1‑32 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:3348009‑M1/1‑32 (MQ=255) gAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagtt > 1:5984841‑M1/1‑31 (MQ=255) aaTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagtt > 1:268656‑M1/1‑30 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:3498038‑M1/1‑28 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga < 1:5118098‑M1/51‑24 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:5042635‑M1/1‑28 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 1:2336642‑M1/26‑51 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:1867255‑M1/1‑27 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:1424153‑M1/28‑1 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:1065209‑M1/51‑26 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt < 1:6559928‑M1/29‑1 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgcccccaaaaagttggacag < 1:4807228‑M1/51‑27 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacag > 1:4027583‑M1/1‑25 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:127994‑M1/51‑27 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:3517205‑M1/51‑28 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:5577925‑M1/51‑28 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:3052690‑M1/1‑24 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt > 1:427285‑M1/20‑51 (MQ=255) ctctCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa > 1:4464404‑M1/1‑20 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct > 1:152387‑M1/18‑51 (MQ=255) tctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:2392670‑M1/51‑33 (MQ=255) aatgggtgcggtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct < 1:6763930‑M1/36‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct > 1:6079047‑M1/16‑51 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:6113356‑M1/51‑36 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:3015353‑M1/51‑36 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa > 1:6652331‑M1/1‑16 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa > 1:2077276‑M1/1‑16 (MQ=255) gggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTa < 1:3885813‑M1/39‑1 (MQ=255) ggCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacga < 1:4199362‑M1/51‑37 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:876310‑M1/12‑51 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:4037655‑M1/12‑51 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt < 1:3933312‑M1/40‑1 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag < 1:2475291‑M1/51‑38 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:1541932‑M1/1‑14 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:7277536‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc < 1:5031478‑M1/51‑40 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:6317446‑M1/1‑12 (MQ=255) tttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:588078‑M1/1‑11 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:1381775‑M1/1‑10 (MQ=255) tATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcata > 1:4925815‑M1/1‑9 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:2899054‑M1/7‑51 (MQ=255) aTGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatat < 1:5821504‑M1/51‑44 (MQ=255) tacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGa < 1:2038990‑M1/47‑1 (MQ=255) acaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc > 1:4557536‑M1/4‑51 (MQ=255) caGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACt > 1:6426168‑M1/3‑51 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 1:1230805‑M1/2‑51 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 1:3737583‑M1/2‑51 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt < 1:1490995‑M1/50‑1 (MQ=255) gCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc > 1:6723776‑M1/1‑3 (MQ=255) gCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTta < 1:2839695/51‑1 (MQ=255) gCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTta > 1:3976146/1‑51 (MQ=255) cTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtct < 1:1890245‑M1/51‑50 (MQ=255) cTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtat < 1:2932134/51‑1 (MQ=255) tGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtata > 1:5253120/1‑51 (MQ=255) | ATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATA > REL606/2522852‑2522952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |