| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 75 (0.940) | 46/100 | 0.5 | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 96 (1.210) | 58/100 | 0.1 | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
AATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTA > REL606/2522851‑2522950 | aTTTTCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:5349120/1‑51 (MQ=255) tttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt > 1:336755‑M1/1‑50 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:6669029‑M1/48‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:766039‑M1/4‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:3074578‑M1/48‑51 (MQ=255) ttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtg > 1:2068679‑M1/1‑49 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGt < 1:2495627‑M1/6‑1 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGt < 1:3313060‑M1/6‑1 (MQ=255) gCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgta < 1:2744307‑M1/51‑5 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGtt < 1:3271450‑M1/7‑1 (MQ=255) ggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTa < 1:1672291‑M1/8‑1 (MQ=255) ccGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtac > 1:3499663‑M1/1‑46 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:2007470‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg < 1:1577401‑M1/51‑8 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:1840938‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:683829‑M1/1‑44 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtctc > 1:5463526‑M1/40‑51 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:5443603‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:3156584‑M1/1‑41 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc > 1:3053606‑M1/39‑51 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:301568‑M1/13‑1 (MQ=255) tAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccc > 1:3173375‑M1/1‑40 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:830634‑M1/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:1479937‑M1/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:4936637‑M1/38‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:4047266‑M1/36‑51 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:5390249‑M1/1‑38 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:6473295‑M1/1‑38 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:1649916‑M1/1‑37 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa < 1:1599044‑M1/51‑15 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaa > 1:758297‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:4685557‑M1/51‑17 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtg < 1:576668‑M1/19‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:2946887‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:1150019‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:2330976‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:6127535‑M1/20‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:4468116‑M1/31‑51 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:618240‑M1/31‑51 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:3915049‑M1/21‑1 (MQ=255) gCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaag < 1:6516389‑M1/51‑19 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:4235897‑M1/30‑51 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:3348009‑M1/1‑32 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:2582043‑M1/1‑32 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:1900481‑M1/1‑32 (MQ=255) gAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagtt > 1:5984841‑M1/1‑31 (MQ=255) gAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagtt > 1:3982919‑M1/1‑31 (MQ=255) aaTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagtt > 1:268656‑M1/1‑30 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:5042635‑M1/1‑28 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:6103058‑M1/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:4601782‑M1/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 1:2336642‑M1/26‑51 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt < 1:5042192‑M1/27‑1 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:2577471‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:1867255‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac < 1:434636‑M1/51‑25 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:2702995‑M1/24‑51 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:1424153‑M1/28‑1 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:1065209‑M1/51‑26 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca > 1:2253588‑M1/1‑26 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt < 1:6559928‑M1/29‑1 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgcccccaaaaagttggacag < 1:4807228‑M1/51‑27 (MQ=255) aTAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:127994‑M1/51‑27 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:5577925‑M1/51‑28 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:3517205‑M1/51‑28 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTg > 1:5129848‑M1/22‑51 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 1:480639‑M1/31‑1 (MQ=255) aGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:690504‑M1/1‑23 (MQ=255) aGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:4254707‑M1/51‑29 (MQ=255) ctctCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa > 1:4464404‑M1/1‑20 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct > 1:152387‑M1/18‑51 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct < 1:3765636‑M1/34‑1 (MQ=255) aaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctc < 1:3725206‑M1/35‑1 (MQ=255) ctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca > 1:6854587‑M1/1‑18 (MQ=255) aatgggtgcggtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct < 1:6763930‑M1/36‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct > 1:6079047‑M1/16‑51 (MQ=255) tcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:5805926‑M1/51‑35 (MQ=255) tgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct > 1:4186425‑M1/14‑51 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:3015353‑M1/51‑36 (MQ=255) ggCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaagttggacagttaaacacgag < 1:4396002‑M1/51‑37 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:876310‑M1/12‑51 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt < 1:3933312‑M1/40‑1 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:4037655‑M1/12‑51 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:1541932‑M1/1‑14 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:4856030‑M1/1‑14 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgagg < 1:2437276‑M1/51‑39 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:7277536‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:6317446‑M1/1‑12 (MQ=255) tttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:588078‑M1/1‑11 (MQ=255) tttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca < 1:3944364‑M1/51‑41 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:6627214‑M1/1‑10 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:1381775‑M1/1‑10 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:2899054‑M1/7‑51 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt < 1:401169‑M1/45‑1 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:3490199‑M1/7‑51 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCACTCTATTCATTg < 1:4064113‑M1/46‑1 (MQ=255) aTGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatat > 1:6344853‑M1/1‑8 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt < 1:1490995‑M1/50‑1 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 1:1230805‑M1/2‑51 (MQ=255) gCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTta < 1:2839695/51‑1 (MQ=255) | AATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTA > REL606/2522851‑2522950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |