Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 87 [0] | [0] 88 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 79 (1.030) | 55/96 | 0.1 | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
CGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4205017‑4205068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAA > REL606/4205074‑4205123 CGTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCT > 1:7092011/1‑51 GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG > 1:604/1‑51 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGT > 1:1561482/1‑51 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGT > 1:4636019/1‑51 TGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGT < 1:6022572/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA < 1:762320/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA > 1:5939149/1‑51 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA < 1:1962508/51‑1 GAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTA > 1:5246396/1‑51 AGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAAC > 1:956415/1‑51 AGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAAC < 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ATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGA > 1:2518651/1‑51 ATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGA > 1:2584785/1‑51 ATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGA > 1:2698980/1‑51 TCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGAT > 1:198381/1‑51 TCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGAT < 1:323279/51‑1 GGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCT > 1:1896616/1‑51 GGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCT > 1:4687148/1‑51 GTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTC > 1:6418414/1‑51 GTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTC > 1:2458588/1‑51 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG < 1:6979705/51‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCG < 1:7012600/51‑1 TAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCG > 1:753479/1‑45 AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGG < 1:4927100/51‑1 AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGG > 1:3676363/1‑51 AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGG < 1:561602/51‑1 AAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGC < 1:4985300/51‑1 AAATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCG > 1:3311502/1‑51 AATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGT > 1:6700715/1‑51 ATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTT < 1:6339234/51‑1 ATATCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTT < 1:4444899/51‑1 TCGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATG < 1:337530/51‑1 CGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG > 1:4683197/1‑51 CGTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGG > 1:6443899/1‑51 GTTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGT < 1:940135/51‑1 TTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTG < 1:1028747/51‑1 TTGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTA > 1:333278/1‑46 TGGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGC > 1:7053918/1‑51 GGTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCC > 1:1141004/1‑51 GTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCT < 1:5306763/51‑1 GTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCT > 1:6263258/1‑51 GTGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCT < 1:4441460/51‑1 TGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTG < 1:7296591/51‑1 TGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTG > 1:6232795/1‑51 TGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTG < 1:4117505/51‑1 TGTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTG > 1:1877426/1‑51 GTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGC > 1:2763003/1‑51 GTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGC > 1:1696213/1‑51 GTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGC > 1:1473446/1‑51 GTGGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGC < 1:1179346/51‑1 GGTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGG > 1:5533124/1‑51 GTGCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGA < 1:4553195/51‑1 GCTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAA > 1:5991646/1‑51 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |