Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | REL606 | 4,205,069 | Δ5 bp | coding (2311‑2315/3684 nt) | metH → | B12‑dependent methionine synthase |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 4205069 | 4205073 | 5 | 87 [0] | [0] 88 | metH | B12‑dependent methionine synthase |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 4205068 | 0 (0.000) | 79 (1.030) | 55/96 | 0.1 | 100% | coding (2310/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
? | REL606 | 4205074 = | 0 (0.000) | coding (2316/3684 nt) | metH | B12‑dependent methionine synthase |
GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGA > REL606/4205018‑4205118 | gTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTG > 1:604‑M1/1‑51 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt > 1:1561482‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt > 1:4636019‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt < 1:6022572‑M1/51‑2 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta < 1:762320‑M1/51‑3 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta < 1:1962508‑M1/51‑3 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta > 1:5939149‑M1/1‑49 (MQ=255) gAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGta > 1:5246396‑M1/1‑49 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac < 1:2588665‑M1/51‑5 (MQ=255) aGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaac > 1:956415‑M1/1‑47 (MQ=255) gggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaaca > 1:3612646‑M1/1‑46 (MQ=255) ggCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaa < 1:5903713‑M1/51‑7 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:6716749‑M1/51‑8 (MQ=255) gCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaac < 1:2374485‑M1/51‑8 (MQ=255) cGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact < 1:6160930‑M1/51‑9 (MQ=255) cGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaact < 1:3429069‑M1/51‑9 (MQ=255) aCGTCCACGACATGGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGt < 1:6374668‑M1/42‑2 (MQ=255) aCGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactac > 1:1373335‑M1/1‑41 (MQ=255) aCGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactac < 1:1501316‑M1/51‑11 (MQ=255) cGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacg > 1:486075‑M1/1‑40 (MQ=255) cGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacg > 1:186396‑M1/1‑40 (MQ=255) cGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacg < 1:3560341‑M1/51‑12 (MQ=255) cGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaa < 1:4236305‑M1/43‑4 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGttacaactacga > 1:6593047‑M1/1‑39 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacga < 1:5333591‑M1/51‑13 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacga < 1:605549‑M1/51‑13 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacga > 1:4553038‑M1/1‑39 (MQ=255) gTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacga < 1:6046052‑M1/51‑13 (MQ=255) tCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaa < 1:1335677‑M1/51‑14 (MQ=255) ccACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaa > 1:5215757‑M1/1‑37 (MQ=255) cACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaat < 1:5810641‑M1/51‑16 (MQ=255) aCGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaatt < 1:4739221‑M1/51‑17 (MQ=255) cGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattg < 1:2649487‑M1/51‑18 (MQ=255) cGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattg > 1:4322337‑M1/1‑34 (MQ=255) cGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaa < 1:2566473‑M1/47‑14 (MQ=255) aCATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtc > 1:1990309‑M1/1‑32 (MQ=255) aCATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtc < 1:3093725‑M1/51‑20 (MQ=255) cATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcg < 1:435042‑M1/51‑21 (MQ=255) aTCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcga > 1:2698980‑M1/1‑30 (MQ=255) aTCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcga > 1:2584785‑M1/1‑30 (MQ=255) aTCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcga > 1:2518651‑M1/1‑30 (MQ=255) tCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgat < 1:323279‑M1/51‑23 (MQ=255) tCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgat > 1:198381‑M1/1‑29 (MQ=255) ggTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatct > 1:1896616‑M1/1‑27 (MQ=255) ggTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatct > 1:4687148‑M1/1‑27 (MQ=255) gTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctc > 1:6418414‑M1/1‑26 (MQ=255) gTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctc > 1:2458588‑M1/1‑26 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg < 1:7012600‑M1/51‑27 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcg < 1:6979705‑M1/51‑27 (MQ=255) tAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcg > 1:753479‑M1/1‑25 (MQ=255) aaaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcgg > 1:3676363‑M1/1‑24 (MQ=255) aaaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcgg < 1:561602‑M1/51‑28 (MQ=255) aaaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcgg < 1:4927100‑M1/51‑28 (MQ=255) aaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggc < 1:4985300‑M1/51‑29 (MQ=255) aaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcg > 1:3311502‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTATCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgt > 1:6700715‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtt < 1:4444899‑M1/51‑32 (MQ=255) atatCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtt < 1:6339234‑M1/51‑32 (MQ=255) tCGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatg < 1:337530‑M1/51‑35 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg > 1:6443899‑M1/1‑16 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatgg > 1:4683197‑M1/1‑16 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggt < 1:940135‑M1/51‑37 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtg < 1:1028747‑M1/51‑38 (MQ=255) ttGGTGTGGTGCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgtta > 1:333278‑M1/1‑14 (MQ=255) tggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgc > 1:7053918‑M1/1‑13 (MQ=255) ggtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcc > 1:1141004‑M1/1‑12 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct < 1:4441460‑M1/51‑41 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct < 1:5306763‑M1/51‑41 (MQ=255) gtgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcct > 1:6263258‑M1/1‑11 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg > 1:1877426‑M1/1‑10 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg > 1:6232795‑M1/1‑10 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg < 1:7296591‑M1/51‑42 (MQ=255) tgtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctg < 1:4117505‑M1/51‑42 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc < 1:1179346‑M1/51‑43 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc > 1:2763003‑M1/1‑9 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc > 1:1473446‑M1/1‑9 (MQ=255) gtggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgc > 1:1696213‑M1/1‑9 (MQ=255) ggtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgg > 1:5533124‑M1/1‑7 (MQ=255) gtgCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcgga < 1:4553195‑M1/51‑46 (MQ=255) gCTGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaa > 1:5991646‑M1/1‑4 (MQ=255) tGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaa > 1:3278916‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaa < 1:1037955‑M1/51‑50 (MQ=255) tGtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaa < 1:4514334‑M1/51‑50 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa < 1:312336‑M1/51‑51 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa < 1:5385309‑M1/51‑51 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa > 1:7291005‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaacaactacgaaattgtcgatctcggcgttatggtgcctgcggaaaaaa > 1:2513170‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTGAAGGGCGACGTCCACGACATCGGTAAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGA > REL606/4205018‑4205118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |