| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 3,981,782 | IS150 (–) +3 bp | 100% | coding (249‑251/1224 nt) | ECB_03710 ← | putative permease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 24 (0.900) | 17/278 | NT | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 3981782 = | 0 (0.000) | coding (251/1224 nt) | ECB_03710 | putative permease | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 36 (1.360) | 24/276 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 3981784 | 0 (0.000) | coding (249/1224 nt) | ECB_03710 | putative permease | |||||
AGCCGCCACTAACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAATACGACGCTAATTAAACTGCTGCTGGAAAGTTGATTGCCGAGGC > REL606/3981640‑3981932 | agccGCCACTAACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtac > 2:508979‑M2/1‑145 (MQ=255) ccgccACTAACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACAAATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactg < 2:405622‑M2/150‑8 (MQ=255) gccACTAACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgac < 2:1845‑M2/150‑10 (MQ=255) ccACTTACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGACCCTTTTtgtactgaac < 1:617463‑M2/150‑11 (MQ=255) gTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagt < 2:224164‑M2/150‑20 (MQ=255) agagacaggttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATAc < 2:158352‑M2/33‑1 (MQ=255) cTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa < 2:511785‑M2/150‑32 (MQ=255) cTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggaacgttaaa < 1:585609‑M2/150‑32 (MQ=255) atcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACg < 2:138956‑M2/34‑1 (MQ=255) atcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTCTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACg < 1:214918‑M2/34‑1 (MQ=255) atcatcagttatgtagtagtgagtcactacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattagtagctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACATTGCCATACg < 1:113454‑M2/34‑1 (MQ=255) ttCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:514099‑M2/150‑33 (MQ=255) ataagagacaggaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGt < 1:224856‑M2/35‑1 (MQ=255) ccAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTTATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:415591‑M2/1‑116 (MQ=255) ccAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 1:436160‑M2/1‑116 (MQ=255) ccAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:515574‑M2/1‑116 (MQ=255) gttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAatgccatacctgtctct > 1:157907‑M2/110‑142 (MQ=255) aTGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat < 2:46289‑M2/150‑42 (MQ=255) gaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACaatgccatacgtctgtctcttat > 2:225498‑M2/105‑139 (MQ=255) gtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCtt > 1:462851‑M2/102‑150 (MQ=255) gAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatagg > 1:29146‑M2/1‑104 (MQ=255) gAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatagg > 1:404458‑M2/1‑104 (MQ=255) agtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCtttt > 2:196368‑M2/100‑150 (MQ=255) aGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctga < 2:305274‑M2/150‑52 (MQ=255) attcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCCCAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTcc > 1:170282‑M2/95‑150 (MQ=255) gTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccg < 2:171602‑M2/150‑57 (MQ=255) gTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccg < 1:9721‑M2/150‑57 (MQ=255) gTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccg < 2:653251‑M2/150‑57 (MQ=255) gtataagagacagaccaaacatattGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgat > 1:194147‑M2/13‑92 (MQ=255) agagacagtttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATgg < 2:124563‑M2/67‑1 (MQ=255) aaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATgg < 2:409404‑M2/67‑1 (MQ=255) aaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATgg < 2:599063‑M2/67‑1 (MQ=255) cgcttttccaaagggtaatttgtctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGAt < 1:487612‑M2/71‑1 (MQ=255) tGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattgga < 2:150982‑M2/150‑70 (MQ=255) gACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggag > 2:585327‑M2/1‑80 (MQ=255) aCCAAACTTATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatagatctgattccgatattcaatttgagt < 1:373806‑M2/150‑72 (MQ=255) aCCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatctgtctcttatac < 2:194708‑M2/150‑72 (MQ=255) tttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCacgctaatggctgtctct > 1:124198‑M2/76‑142 (MQ=255) aCATATTGGCGGAAACGCCAATCCACCCCAACATACTTATCGCCATCAACATATGAATGGCGATGGCCCCTTTTtgaactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggaatagaggtctgattccgatattcaattggagtcagac > 1:541061‑M2/1‑74 (MQ=255) aagggtattttggctttgacatattatgggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGt < 1:410330‑M2/81‑1 (MQ=255) ggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaactaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGTATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGATAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAAt < 1:135280‑M2/92‑1 (MQ=255) acatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGAcgccg > 2:273406‑M2/52‑150 (MQ=255) catattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGAcgccgc > 2:474814‑M2/51‑150 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAAt > 1:491636‑M2/43‑150 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCCCCAAACGAATATTTCACTATGACATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTTAGTGTGATGGACGTAAGTAAGGTCAGATTGACGCCGCCTAACAAt > 1:288489‑M2/43‑150 (MQ=255) ggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAATa > 2:385338‑M2/42‑150 (MQ=255) gACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 1:319702‑M2/150‑110 (MQ=255) gACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 1:441213‑M2/150‑110 (MQ=255) gACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:202415‑M2/150‑110 (MQ=255) cTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag > 1:651330‑M2/1‑39 (MQ=255) aTCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat > 1:150553‑M2/1‑36 (MQ=255) cATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaat > 1:201831‑M2/1‑31 (MQ=255) tCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatat > 2:442463‑M2/1‑29 (MQ=255) gaaaaatgTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgacaccaaaaagttggacagttaaacacgaggcaaataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatat > 1:264170‑M2/3‑29 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAATACGACGCTAATTAAActg > 2:595311‑M2/25‑150 (MQ=255) aaaaTGTTAATGGCGATGGCCCCTATTtgtactgaccccaaaaagttgaacagttaaacacgaggcataaaggtctgattcctatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatat > 1:373940‑M2/1‑27 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaTTTTCGCCAAACGAATATTTCATAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAATACGACGCTAATTAAActgc < 2:464168‑M2/127‑1 (MQ=255) tGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccg < 2:680887‑M2/150‑128 (MQ=255) ttAATGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgta > 2:9753‑M2/1‑21 (MQ=255) aaTGGCGATGGCCCCTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaac > 2:619272‑M2/1‑19 (MQ=255) aaTGGCGATGGCACCCTTTggtactgaccccaaaaagttggaaagttaaacacgaggcatataggtctcattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaac > 1:344632‑M2/1‑19 (MQ=255) cTTTTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatacttcagtt < 1:617794‑M2/150‑146 (MQ=255) tttttgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttc < 1:550816‑M2/150‑147 (MQ=255) tttgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctacttcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgc < 2:482541‑M2/150‑149 (MQ=255) | AGCCGCCACTAACAGTGCCAGTGGAACTTCCAGTCCATGTTGAGCCAGTAAGTCATGTACCGAATGACCAAACATATTGGCGGTAACGGCAATCCAGCCGAACAGACTTATCGCCATCAAAATGTTAATGGCGATGGCCCCTTTTTCGCCAAACGAATATTTCACAATGCCATACGTTGGCAGGCGGGCTTTTTCTCCCACGCTAATGGTGATGGCTGAAAGTAAGGTCAGAATGACGCCGCCTAACAATACGACGCTAATTAAACTGCTGCTGGAAAGTTGATTGCCGAGGC > REL606/3981640‑3981932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |