| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,092,861 | IS150 (+) +3 bp | 94.4% | coding (87‑89/429 nt) | yiiT → | stress‑induced protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3893554 = | NA (NA) | 31 (1.180) | 20/274 | NT | 93.8% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 4092863 | 2 (0.080) | coding (89/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 36 (1.380) | 25/272 | NT | 94.6% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 4092861 = | 2 (0.080) | coding (87/429 nt) | yiiT | stress‑induced protein | |||||
TATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATG > REL606/4092715‑4093010 | gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:681866‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:341973‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:22823‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 1:422163‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:204549‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:282985‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:671837‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 1:347260‑M2/4‑1 (MQ=255)gaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAAt < 2:486280‑M2/4‑1 (MQ=255) tgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCt < 2:129057‑M2/15‑1 (MQ=255) gttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtccgtacaTAATGACGCTCACCTGACg > 1:23687‑M2/132‑150 (MQ=255) gttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACg < 2:471238‑M2/19‑1 (MQ=255) gttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACg < 2:117820‑M2/19‑1 (MQ=255) 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gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 2:128477‑M2/6‑150 (MQ=255) gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 2:536112‑M2/6‑150 (MQ=255) gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 2:126304‑M2/6‑150 (MQ=255) gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 2:178976‑M2/6‑150 (MQ=255) gtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATAtt > 1:603416‑M2/6‑150 (MQ=255) aCATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttg < 2:476274‑M2/150‑145 (MQ=255) aCATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttg < 2:39175‑M2/150‑145 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttgg < 2:194113‑M2/150‑146 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttgg < 1:191355‑M2/150‑146 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttgg < 2:636090‑M2/150‑146 (MQ=255) cATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttgg > 1:400980‑M2/1‑5 (MQ=255) aTAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttggt < 1:5719‑M2/150‑147 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgagaagggccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacagggtctttgaggcacgttttggta < 1:632379‑M2/150‑148 (MQ=255) tAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttggtg > 2:66081‑M2/1‑3 (MQ=255) | TATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATG > REL606/4092715‑4093010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |