Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,322,340 | IS186 (+) +6 bp | 66.0% | coding (131‑136/963 nt) | menC ← | O‑succinylbenzoate synthase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2322340 = | 9 (0.360) | 7 (0.270) | 5/272 | NT | 42.6% | coding (136/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoate synthase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2322345 | 9 (0.360) | 28 (1.070) | 19/272 | NT | 74.8% | coding (131/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoate synthase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
GAACACCCCTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGC > REL606/2772706‑2772993 | gAACACCCCTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCCTGGCCGAAATGTTGACTCGTCGAGCAAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACCCCCTGAACGGTGCGCAAAAccca > 1:352024/1‑149 (MQ=255) gAACACCCCTCACACCGATTCGCCAAACGGCGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGATCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAAacc > 1:681466/1‑150 (MQ=255) ccccTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTTATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATaa > 1:195188/1‑150 (MQ=255) ccccTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGGTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGACCGGTGGGGAAAAACCACATaa > 1:538040/1‑150 (MQ=255) cccTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAg < 1:569387/150‑1 (MQ=255) cccTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAg < 2:352917/150‑1 (MQ=255) cTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAgcg > 2:377894/1‑150 (MQ=255) cGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 1:392570/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTATGATGCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTCACCGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt < 1:632655/150‑1 (MQ=255) gCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt < 2:539598/150‑1 (MQ=255) gCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt < 2:229514/150‑1 (MQ=255) gCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt < 2:683468/150‑1 (MQ=255) gCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt < 2:312356/150‑1 (MQ=255) cGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGt > 2:585257/1‑150 (MQ=255) cGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGt > 2:300277/1‑150 (MQ=255) gTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTGATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGTAAAACCCCATCAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGGAt > 1:421329/1‑150 (MQ=255) ggagaacgagttttaccccTCTGGCGCGGTTAACACCGAGGGGCAAGACTTCGTGTCATCGTGATGCCCGGTTTATCCAGGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAGCGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTGGTGGTATTa < 1:307844/135‑1 (MQ=255) ggAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGTCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGTGGTTTTa > 1:652068/1‑150 (MQ=255) gaAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc < 2:53079/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc > 2:478534/1‑150 (MQ=255) ataagagacaggAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACg < 1:50501/140‑1 (MQ=255) gAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACgctgtctcttat > 2:50654/1‑139 (MQ=255) acacAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGT‑GGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc > 2:17667/1‑150 (MQ=255) aagttttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc < 1:497521/147‑1 (MQ=255) aaaTTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc < 2:195751/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc < 2:422531/150‑1 (MQ=255) ttGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 2:123395/150‑1 (MQ=255) tCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCaa < 2:376355/150‑1 (MQ=255) atgcCCGGTTTAGCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAGCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGcc < 1:583541/150‑1 (MQ=255) atgaCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGcc < 1:299428/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCata > 2:230320/1‑150 (MQ=255) gattATCCCCGCTGGCGCGGGGAACCCCCTGAGCGGTGGGGAAAAACCACATAAGCGCTAACTCAAGGGTTGTGGTATTACTCATGATATGGTCTAAGGTGGCGATGTATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCGCagagtg > 1:412455/3‑145 (MQ=18) gTTTATGCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGCACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATCAATTAACGTGCCGATTAAATACGCTCCCGAAAACTGGTCAGCCATTCTGGCCCATAttt > 1:345515/1‑149 (MQ=18) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg > 2:515136/1‑150 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg > 2:174292/1‑150 (MQ=255) tATCCCCGCTGGCTCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTa < 1:477180/150‑1 (MQ=255) tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTa < 2:543804/150‑1 (MQ=255) gaTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAATCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTa < 1:376802/149‑1 (MQ=255) gaTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTa < 1:420479/149‑1 (MQ=255) aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTac > 2:421678/1‑149 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGc < 2:653989/150‑1 (MQ=255) tgacgcgGGGAACACCCTGAACGGTGGCGAAAAACCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTACGCCCgaag < 1:101170/147‑1 (MQ=255) cgcgGGGAGCACCCTGAACGGTGGGGAATGAGCGCATAAGCGATAACATAAGGGTTGTCGTAGTACGCCTGATATAATTTACCGTGCCGATGAATGACGCACACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAGGCCGGAAGAAc < 1:573220/150‑1 (MQ=14) gggAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa > 2:70976/1‑150 (MQ=255) gggAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGATTCTGGTATTACGCCTAATATGATTTAACGTGCCGATCAATTACTCTCACGATAACTGGTCCGCAACACTGGCCCATATTGGTAAGACCGAAGAACTGGa > 1:274208/1‑150 (MQ=17) acCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTc > 2:288584/1‑150 (MQ=255) acCCTCAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTATGGGTTGTGGTCTTACGCCTGTTGCGATTTAACGTGCCGAGGCATCACTCCCACGATAACTGGTCCGCAAGTCCGGACCATAGTGGTAAGCCCGCTGAACTGGATACtta > 1:195746/1‑149 (MQ=14) gTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAAt > 2:55857/1‑150 (MQ=35) ggggAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACGGGATACTTCGGCCCGTAATGc < 1:482447/150‑1 (MQ=21) | GAACACCCCTCACACCGATTCGCCAAACGGTGGAGAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGCTGGGCGAAATTTTGATTCATCGTGATGACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCCTGAACGGTGGGGAAAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGC > REL606/2772706‑2772993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |