Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | 100% | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 19 (0.720) | 16/274 | NT | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 1619834 = | 0 (0.000) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 46 (1.740) | 29/276 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 1619836 | 0 (0.000) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
CTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACTTAACTACCGTTACCTCTCCAATATGAAATCAATCAG > REL606/1619687‑1619982 | cTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTTGCCTCAGAt > 1:454781/1‑150 (MQ=255) accaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggtgctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 2:460464‑M2/4‑1 (MQ=255) accaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 2:363632‑M2/4‑1 (MQ=255) accaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 2:318920‑M2/4‑1 (MQ=255) accaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 2:335031‑M2/4‑1 (MQ=255) accaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcagcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 1:248595‑M2/4‑1 (MQ=255) acaaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgggaagtagtgatttacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 1:31900‑M2/4‑1 (MQ=255) cGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCATATtg < 1:94316‑M2/150‑3 (MQ=255) ttACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATATCCTGCTTCTCCTTTCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGAATGAAATTGGCCTCAGATtgta < 1:277794‑M2/150‑5 (MQ=255) tACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 2:200524‑M2/1‑145 (MQ=255) tACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 1:670639‑M2/1‑145 (MQ=255) tACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 2:411472‑M2/1‑145 (MQ=255) tACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 2:325543‑M2/1‑145 (MQ=255) tgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg < 2:340274‑M2/13‑1 (MQ=255) gTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacc < 2:136705‑M2/150‑11 (MQ=255) gTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacc < 1:353036‑M2/150‑11 (MQ=255) cACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaa < 2:660800‑M2/150‑18 (MQ=255) cACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacccaaaaaa < 1:182719‑M2/150‑18 (MQ=255) aCTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaag < 1:376866‑M2/150‑19 (MQ=255) cTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagt < 2:134881‑M2/150‑20 (MQ=255) cTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagt < 2:645784‑M2/150‑20 (MQ=255) atcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAg < 2:591326‑M2/23‑1 (MQ=255) aCAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 2:126130‑M2/150‑33 (MQ=255) aGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 2:274983‑M2/1‑116 (MQ=255) gATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:680641‑M2/150‑36 (MQ=255) gATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:119175‑M2/150‑36 (MQ=255) gATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg > 1:643894‑M2/1‑115 (MQ=255) gtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCtttt > 2:140065‑M2/102‑150 (MQ=255) taggcattcacgacttctaagcgcttttaacaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcttcgtccaaccaaatgggtgcagtacaGAATAATGTCAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtc < 1:196820‑M2/50‑1 (MQ=255) gCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTGAAAGCTTGCTTCTGCTTGCCTTTAGGCACGTAAGAGGCTAAGCTACATGTGTTTAGCATGAAATTCGCGTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaagcacgaggcatataggtc > 1:519481‑M2/1‑102 (MQ=255) gCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtc > 2:682639‑M2/1‑102 (MQ=255) tCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgat > 1:322833‑M2/1‑92 (MQ=255) tcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTgg > 2:668286‑M2/86‑150 (MQ=255) 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tcCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttc > 1:47460‑M2/1‑63 (MQ=255) ggccttgacctattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaaagggtgcagtacaGATTACTGTTAAGCGGCTTGCAGGACGCGTACGGTTAACAGGGGCTTTTCACTATCAGCAGTTAGTGTTCATGCCCGAGGCAGacagcataa > 1:441639‑M2/59‑146 (MQ=255) gacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGACAGATAGCCTCAAGCAcc > 1:603680‑M2/53‑150 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCa > 2:27886‑M2/49‑150 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAg > 2:209383‑M2/48‑150 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAg > 2:52838‑M2/48‑150 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAg > 1:495371‑M2/48‑150 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGc < 1:456768‑M2/104‑1 (MQ=255) cGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgc > 2:377958‑M2/1‑47 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaTATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGAGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCAtt > 1:105355‑M2/43‑150 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCAtt > 2:327111‑M2/43‑150 (MQ=255) gagGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg < 2:161909‑M2/150‑109 (MQ=255) agacagacctacaTGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt > 2:365301‑M2/7‑41 (MQ=255) ttccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACtt < 2:49256‑M2/114‑1 (MQ=255) agacagacatgtgTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 2:110031‑M2/7‑37 (MQ=255) 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gCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttc > 2:354048‑M2/1‑9 (MQ=255) gtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACTTAACTACCGTTAcctctccaatatctgtctct > 1:428156‑M2/6‑142 (MQ=255) gtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACTTAACTACCGTTACCTCTCCAATATGAaatcaa > 1:388862‑M2/6‑150 (MQ=255) gtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACTTAACTACCGTTACCTCTCCAATATGAaatcaa > 1:493544‑M2/6‑150 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcag > 2:245263‑M2/1‑7 (MQ=255) aGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttc < 1:201358‑M2/150‑147 (MQ=255) | CTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTGGTGTTCATGCCCGAGGCAGATAGCCTCAAGCACCCGCAGCCATTCTACTTAACTACCGTTACCTCTCCAATATGAAATCAATCAG > REL606/1619687‑1619982 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |