New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | GFP_Plasmid_Sequ | 2820 = | 40418 (0.960) | 5 (0.000) | 4/174 | 103.2 | 0.014% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | GFP_Plasmid_Sequ | = 2830 | 35364 (0.970) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 40875 total aligned reads displayed.
CACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGA > GFP_Plasmid_Sequ/2730‑2930 | cACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGGGCCTATGGAAAAAAGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGCTTctggccttttg > 1:597262/1‑101 (MQ=255) ccTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgct < 1:778851/101‑1 (MQ=255) ctctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctg > 2:143137/1‑101 (MQ=255) tctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctgg > 1:111966/1‑101 (MQ=255) tGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcc > 1:35696/1‑101 (MQ=255) tGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcc > 1:1148336/1‑101 (MQ=255) tGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcc > 1:718371/1‑101 (MQ=255) gACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcct > 3:1526754/1‑101 (MQ=255) gACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcct < 1:1240456/101‑1 (MQ=255) gACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGAAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcct > 1:657936/1‑101 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcctt > 3:1465143/1‑101 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCCTTTTACGGGTCctggccttttgctggcctt > 1:1330017/1‑101 (MQ=255) cTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttt < 1:538094/101‑1 (MQ=255) cTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttt < 3:1375886/101‑1 (MQ=255) cTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttt < 2:50121/101‑1 (MQ=255) ttGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcctttt < 3:1341454/101‑1 (MQ=255) ttGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcctttt > 1:234579/1‑101 (MQ=255) tGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttttg > 1:325789/1‑101 (MQ=255) tGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttttg > 1:996566/1‑101 (MQ=255) cGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAt > 1:1300732/1‑101 (MQ=255) aTTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGt < 1:1056857/101‑1 (MQ=255) tttttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTc > 1:387707/1‑101 (MQ=255) tttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCATATGTCCt > 3:1557837/1‑101 (MQ=255) ttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCtt > 3:1407409/1‑101 (MQ=255) tgtgATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCttt > 1:902265/1‑101 (MQ=255) tgATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTcc < 3:695973/101‑1 (MQ=255) aTGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTg < 3:723316/101‑1 (MQ=255) tGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGc > 1:1028576/1‑101 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGtt > 1:1000064/1‑101 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGtt < 3:477986/101‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGCTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGtt < 1:1577757/101‑1 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTAt > 1:748230/1‑101 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTAt < 3:1278335/101‑1 (MQ=255) cAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATcc > 1:871040/1‑101 (MQ=255) cAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGGTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATcc > 1:446490/1‑101 (MQ=255) aGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATccc > 3:323542/1‑101 (MQ=255) aGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATccc > 3:1185594/1‑101 (MQ=255) ggggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATcccc > 3:202386/1‑101 (MQ=255) gggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCt < 1:568379/101‑1 (MQ=255) gggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCt < 1:1209124/101‑1 (MQ=255) gggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTGTCCTGCGTTATCCCCt < 4:148826/101‑1 (MQ=255) ggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTg < 3:636870/101‑1 (MQ=255) gCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGAtt < 1:506640/101‑1 (MQ=255) gCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGAtt < 3:1155386/101‑1 (MQ=255) cGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTc > 1:625805/1‑101 (MQ=255) aGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTAAGTCtgt < 4:101327/101‑1 (MQ=255) gCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCtgtg > 1:807942/1‑101 (MQ=255) gCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCtgtg > 1:1452212/1‑101 (MQ=255) tATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGAt < 1:174687/101‑1 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATa > 1:204923/1‑101 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATa > 3:876340/1‑101 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATa > 3:511073/1‑101 (MQ=255) tGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATaa < 3:1588360/101‑1 (MQ=255) tGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATaa > 3:262210/1‑101 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg > 1:932357/1‑101 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg > 1:1269476/1‑101 (MQ=255) aaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGt > 1:1421690/1‑101 (MQ=255) aaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTa < 3:173290/101‑1 (MQ=255) aCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTAtt > 3:1029469/1‑101 (MQ=255) cGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTa > 1:294841/1‑101 (MQ=255) cGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTa < 3:844033/101‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTAcc > 1:840209/1‑101 (MQ=255) cAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCg > 1:963962/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGcc < 3:293538/101‑1 (MQ=255) cAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCt < 3:385492/101‑1 (MQ=255) aaCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCtt > 3:1058243/1‑101 (MQ=255) gcgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtga < 1:1087742/101‑1 (MQ=255) cgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgag > 1:416371/1‑101 (MQ=255) ggCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagt < 3:354594/101‑1 (MQ=255) gCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtg > 3:232058/1‑101 (MQ=255) gCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtg < 3:1495557/101‑1 (MQ=255) ccTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtga < 3:751326/101‑1 (MQ=255) ccTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtga < 3:782864/101‑1 (MQ=255) ccTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtga > 3:1311347/1‑101 (MQ=255) ccTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtga > 3:813238/1‑101 (MQ=255) ccTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtga > 3:417644/1‑101 (MQ=255) ttttACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCt < 3:1090402/101‑1 (MQ=255) tACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGAt < 1:1513772/101‑1 (MQ=255) cGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAc > 3:1217432/1‑101 (MQ=255) cGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAc < 3:1435205/101‑1 (MQ=255) cGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAc > 1:686533/1‑101 (MQ=255) ggTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAcc < 3:607656/101‑1 (MQ=255) gTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCg < 3:575082/101‑1 (MQ=255) ttCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGc > 3:450216/1‑101 (MQ=255) ttCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGc > 3:1248163/1‑101 (MQ=255) tCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCt < 3:545396/101‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTc > 3:666358/1‑101 (MQ=255) ccTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTc < 4:54215/101‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTc < 1:1483255/101‑1 (MQ=255) ctggccttttgctggccttttgCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTcg < 1:1389065/101‑1 (MQ=255) ctggccttttgctggccttttgCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTcg > 1:1545729/1‑101 (MQ=255) cttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCa > 3:1000285/1‑101 (MQ=255) cttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCa < 1:476059/101‑1 (MQ=255) ttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAg < 1:265027/101‑1 (MQ=255) tttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGc > 3:970703/1‑101 (MQ=255) ttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGcc > 3:938943/1‑101 (MQ=255) ttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGcc < 1:1359217/101‑1 (MQ=255) tgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCg > 3:906870/1‑101 (MQ=255) tgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCg < 3:1124332/101‑1 (MQ=255) gctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGa > 1:1179311/1‑101 (MQ=255) | CACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGA > GFP_Plasmid_Sequ/2730‑2930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |