New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | ADP1‑WT | = 1668722 | 0 (0.000) | 40 (1.190) | 37/250 | 0.0 | 100% | intergenic (‑145/+101) | ACIAD1663/ACIAD1664 | hypothetical protein/phosphatidate cytidylyltransferase |
? | pYTK001_with_tdk_kan | 14 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1797) | –/CamR | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGGTCTCAAACGCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTACAGCATTGTTGCAAT > pYTK001_with_tdk_kan/1‑139 | attttttagtttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCt > 1:197392‑M2/119‑126 (MQ=255) ttttttagtttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTc < 2:136424‑M2/9‑1 (MQ=255) ttagtttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAAt < 1:261724‑M2/13‑1 (MQ=255) ttagtttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAAt > 1:72792‑M2/114‑126 (MQ=255) tagtttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAAtt < 1:42120‑M2/14‑1 (MQ=255) tttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCaa > 1:278632‑M2/110‑126 (MQ=255) tttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCaa < 2:197091‑M2/17‑1 (MQ=255) ttcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCaaa > 1:72528‑M2/109‑126 (MQ=255) tcaagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAAt < 1:334173‑M2/19‑1 (MQ=255) aagtgaggttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCa < 1:36493‑M2/21‑1 (MQ=255) ttgaaaataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAat > 1:14699‑M2/98‑126 (MQ=255) ataagagatcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAatttattt < 2:72710‑M2/35‑1 (MQ=255) tcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTttatt > 2:467099‑M2/84‑126 (MQ=255) tcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTttatt < 2:260441‑M2/43‑1 (MQ=255) tcaagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatgggagcttgctgttattcttacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTttatt > 2:223696‑M2/84‑126 (MQ=255) aagataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTaa < 2:423114‑M2/45‑1 (MQ=255) agataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTaaa < 2:69586‑M2/46‑1 (MQ=255) gataaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAag < 1:173332‑M2/47‑1 (MQ=255) taaacaacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAagag > 1:68639‑M2/78‑126 (MQ=255) aacccatccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGaa < 1:321628‑M2/54‑1 (MQ=255) atccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAaattaa < 2:72446‑M2/59‑1 (MQ=255) tccaaaaatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAaattaat < 2:171328‑M2/60‑1 (MQ=255) ccaaaaatttgattcgtggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAaattaatt < 2:51224‑M2/61‑1 (MQ=255) aatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATgg > 1:453271‑M2/61‑126 (MQ=255) aatttgattcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATgg > 1:200820‑M2/61‑126 (MQ=255) tcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCta > 2:199467‑M2/53‑126 (MQ=255) tcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCta < 1:199770‑M2/74‑1 (MQ=255) tcttggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCta < 2:4669‑M2/74‑1 (MQ=255) tggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTatat < 2:468805‑M2/77‑1 (MQ=255) ggatggtagtttgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATAtt < 1:21220‑M2/78‑1 (MQ=255) tgctgttattcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTcc < 2:68558‑M2/89‑1 (MQ=255) ttcatacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCaatgaa < 2:278215‑M2/97‑1 (MQ=255) atacgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGc < 1:166988‑M2/100‑1 (MQ=255) cgtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCggg > 2:316287‑M2/24‑126 (MQ=255) gtcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGt > 1:51815‑M2/23‑126 (MQ=255) tcaatatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTa > 2:336214‑M2/22‑126 (MQ=255) tatttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGTGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCTCAATGAATGCGGGTAAGTc > 1:40114‑M2/18‑126 (MQ=255) tttgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTa > 1:259654‑M2/16‑126 (MQ=255) tgataacttttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTACa < 2:59932‑M2/113‑1 (MQ=255) ttcaCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTACAGCAttgttg > 1:39919‑M2/5‑126 (MQ=255) cccAGCCTCCAACTCACATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTACAGCATTGTTGCAAt < 1:336674/126‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGGTCTCAAACGCCCAGCCTCCAATTCAAATCATAAAAAATTTATTTGCTTTATTAAAGAGGAGAAATTAATTAATGGCACAGCTATATTTCTACTATTCCGCAATGAATGCGGGTAAGTCTACAGCATTGTTGCAAT > pYTK001_with_tdk_kan/1‑139 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |