| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | ADP1‑WT | = 1668722 | 0 (0.000) | 40 (1.190) | 37/250 | 0.0 | 100% | intergenic (‑145/+101) | ACIAD1663/ACIAD1664 | hypothetical protein/phosphatidate cytidylyltransferase |
| ? | pYTK001_with_tdk_kan | 14 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1797) | –/CamR | –/– | |||||
ATTTTTTAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAATAACAAGAGAAAAATCATACATTGTTTTAAATATTATTTTACGATTACTCACTCCTAATCAATGAATCGAATCTCGAAATTGAAGTCAAATTTTCCAATTTAGCTCCACCAATATCTTAAA > ADP1‑WT/1668605‑1668844 | aTTTTTTAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcct > 1:197392‑M1/1‑118 (MQ=255) ttttttAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctc < 2:136424‑M1/126‑10 (MQ=255) ttAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaat > 1:72792‑M1/1‑113 (MQ=255) ttAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaat < 1:261724‑M1/126‑14 (MQ=255) tAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaatt < 1:42120‑M1/126‑15 (MQ=255) tttCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaa < 2:197091‑M1/126‑18 (MQ=255) tttCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaa > 1:278632‑M1/1‑109 (MQ=255) ttCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaa > 1:72528‑M1/1‑108 (MQ=255) tCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaat < 1:334173‑M1/126‑20 (MQ=255) aaGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatca < 1:36493‑M1/126‑22 (MQ=255) ttGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaat > 1:14699‑M1/1‑97 (MQ=255) aTAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttattt < 2:72710‑M1/126‑36 (MQ=255) tCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttatt > 2:467099‑M1/1‑83 (MQ=255) tCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttatt < 2:260441‑M1/126‑44 (MQ=255) tCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGGAGCTTGCTGTTATTCTTACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttatt > 2:223696‑M1/1‑83 (MQ=255) aaGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaa < 2:423114‑M1/126‑46 (MQ=255) 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tGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatat < 2:468805‑M1/126‑78 (MQ=255) ggATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatt < 1:21220‑M1/126‑79 (MQ=255) tGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattcc < 2:68558‑M1/126‑90 (MQ=255) ttCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaa < 2:278215‑M1/126‑98 (MQ=255) aTACGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgc < 1:166988‑M1/126‑101 (MQ=255) cGTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcggg > 2:316287‑M1/1‑23 (MQ=255) gTCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcgggt > 1:51815‑M1/1‑22 (MQ=255) tCAATATTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcgggta > 2:336214‑M1/1‑21 (MQ=255) tatTTGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggtgaaattaattaatggcacagctatatttctactattcctcaatgaatgcgggtaagtc > 1:40114‑M1/1‑17 (MQ=255) tttGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcgggtaagtcta > 1:259654‑M1/1‑15 (MQ=255) tGATAACTTTTCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcgggtaagtctaca < 2:59932‑M1/126‑114 (MQ=255) ttCAcccagcctccaattcaaatcataaaaaatttatttgctttattaaagaggagaaattaattaatggcacagctatatttctactattccgcaatgaatgcgggtaagtctacagcattgttg > 1:39919‑M1/1‑4 (MQ=255) | ATTTTTTAGTTTCAAGTGAGGTTGAAAATAAGAGATCAAGATAAACAACCCATCCAAAAATTTGATTCTTGGATGGTAGTTTGCTGTTATTCATACGTCAATATTTGATAACTTTTCAATAACAAGAGAAAAATCATACATTGTTTTAAATATTATTTTACGATTACTCACTCCTAATCAATGAATCGAATCTCGAAATTGAAGTCAAATTTTCCAATTTAGCTCCACCAATATCTTAAA > ADP1‑WT/1668605‑1668844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |