Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA REL606 430,835 C→T intergenic (‑48/‑108) insL‑2/lon putative transposase insL for insertion sequence IS186/DNA‑binding ATP‑dependent protease La

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  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL606430,8350C→T100.0% 138.9 48intergenic (‑48/‑108)insL‑2/lonputative transposase insL for insertion sequence IS186/DNA‑binding ATP‑dependent protease La
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (19/27):  ref base (0/0):  total (19/29)

GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGT  >  REL606/430811‑430867
                        |                                
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gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       >  1:6190393/1‑36 (MQ=12)
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   aTACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAAc                    <  1:2738671/36‑1 (MQ=255)
    tACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACa                   <  1:1318713/36‑1 (MQ=255)
    tACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACa                   >  1:2214761/1‑36 (MQ=255)
     aCCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACAt                  <  1:4491715/36‑1 (MQ=255)
     aCCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACAt                  <  1:3195941/36‑1 (MQ=255)
     aCCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAAAAt                  >  1:1084504/1‑36 (MQ=14)
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      ccACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATc                 <  1:2597652/36‑1 (MQ=255)
       cacaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcc                <  1:6552551/36‑1 (MQ=255)
       cacaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcc                >  1:3386773/1‑36 (MQ=255)
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        acaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATccc               <  1:3507598/36‑1 (MQ=255)
        acaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATccc               <  1:234101/36‑1 (MQ=255)
        acaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATccc               >  1:2125831/1‑36 (MQ=255)
          aaCCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCa             >  1:5162345/1‑36 (MQ=255)
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            cccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCata           >  1:6711090/1‑36 (MQ=255)
            cccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCata           <  1:1230086/36‑1 (MQ=255)
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             ccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCatat          <  1:3774153/36‑1 (MQ=255)
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              cTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCAtata         >  1:306391/1‑36 (MQ=255)
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                tAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCCTCTACt       >  1:6787938/1‑36 (MQ=21)
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                   gTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGAc    <  1:48810/36‑1 (MQ=255)
                   gTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATAAACTGAc    >  1:1862599/1‑36 (MQ=25)
                    ttAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACg   >  1:3367303/1‑36 (MQ=255)
                     tAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGt  <  1:1223813/36‑1 (MQ=255)
                     tAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGt  >  1:2235775/1‑36 (MQ=255)
                        |                                
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGT  >  REL606/430811‑430867

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 10 ≤  ATCG  < 20 ≤  ATCG  < 29 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG