Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	REL606	1,976,879	T→G	intergenic (‑57/‑76)	yedW/yedX	predicted DNA‑binding response regulator in two‑component system with YedV/hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	REL606	1,976,879	0	T→G	100.0%	160.3	47	intergenic (‑57/‑76)	yedW/yedX	predicted DNA‑binding response regulator in two‑component system with YedV/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (31/16):  ref base (0/0):  total (31/16)

ATGTTATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATTGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGCTT  >  REL606/1976846‑1976911                                  |                                 atGTTATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGt                                >  1:7099651/1‑36 (MQ=255)   gTTATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTaa                              <  1:4044641/36‑1 (MQ=255)    ttATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAt                             >  1:3571040/1‑36 (MQ=255)    ttATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAt                             <  1:2323172/36‑1 (MQ=255)     tataGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAtg                            <  1:6750100/36‑1 (MQ=255)     tataAAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAtg                            <  1:2774763/36‑1 (MQ=25)        aGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAtgctg                         <  1:1539534/36‑1 (MQ=255)         gAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAtgctgc                        >  1:6370431/1‑36 (MQ=255)         gAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAAtgctgc                        <  1:5099649/36‑1 (MQ=255)          aaaCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATgctgct                       <  1:7060416/36‑1 (MQ=255)          aaaCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATgctgct                       >  1:6267148/1‑36 (MQ=255)          aaaCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATgctgct                       >  1:3894718/1‑36 (MQ=255)          aaaCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATgctgct                       <  1:1222090/36‑1 (MQ=255)          aaaCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATgctgct                       >  1:1008442/1‑36 (MQ=255)            aCAGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGt                     >  1:3652337/1‑36 (MQ=255)             cacccTCGTTCATTACAAAATGGTAATGCTCCAGTa                    >  1:3778643/4‑36 (MQ=12)              aGCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTaa                   >  1:1828320/1‑36 (MQ=255)               gCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAg                  >  1:3229778/1‑36 (MQ=255)               gCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAg                  >  1:3384866/1‑36 (MQ=255)               gCCTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAg                  <  1:4069000/36‑1 (MQ=255)                ccTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAgg                 >  1:3466373/1‑36 (MQ=255)                ccTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAgg                 >  1:1578805/1‑36 (MQ=255)                 cTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGt                >  1:4438287/1‑36 (MQ=255)                 cTGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGt                >  1:45467/1‑36 (MQ=255)                 cTGGTTCATTACAAAATGGTAATACTGCTGTAAGGt                >  1:1769293/1‑36 (MQ=25)                 cTGGTTCATTACAAAATGGGAAAGCTGCTGTAAGGt                <  1:1763876/36‑1 (MQ=21)                  tGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGtt               >  1:690698/1‑36 (MQ=255)                  tGGTTCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGtt               <  1:2806506/36‑1 (MQ=255)                     ttCTTTACAGAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTAcc            <  1:2292543/36‑1 (MQ=21)                     ttCATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTAcc            >  1:1428326/1‑36 (MQ=255)                       cATTACAGAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCt          <  1:7450913/36‑1 (MQ=25)                       cATTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCt          >  1:4077405/1‑36 (MQ=255)                        aTTACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTg         >  1:7247885/1‑36 (MQ=255)                         ttACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTgg        >  1:6611437/1‑36 (MQ=255)                         ttACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTgg        <  1:1281874/36‑1 (MQ=255)                         ttACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTAACCTgg        >  1:1376892/1‑36 (MQ=25)                          tACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGc       <  1:4091965/36‑1 (MQ=255)                          tACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGc       >  1:7430003/1‑36 (MQ=255)                          tACAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCCGGc       >  1:4493119/1‑36 (MQ=25)                           aCAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGcc      >  1:1843837/1‑36 (MQ=255)                            cAAAATGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCg     <  1:5732038/36‑1 (MQ=255)                             aaaaTGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGc    >  1:2080235/1‑36 (MQ=255)                              aaaTGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGCt   >  1:631669/1‑36 (MQ=255)                              aaaTGGTAATGCTACTGTAAGGTTACCCTGGCCGCt   >  1:921569/1‑36 (MQ=25)                               aaTGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGCtt  >  1:5221675/1‑36 (MQ=255)                               aaTGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGCtt  >  1:1844791/1‑36 (MQ=255)                               aaTGGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGACGCtt  >  1:7448335/1‑36 (MQ=25)                                  |                                 ATGTTATAGAAACAGCCTGGTTCATTACAAAATTGTAATGCTGCTGTAAGGTTACCCTGGCCGCTT  >  REL606/1976846‑1976911 Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 12 ≤  ATCG  < 19 ≤  ATCG  < 29 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG