| 
GAGCACAAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.GG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCTTTTC  >  REL606/475255‑475319
 
                                  |                                
 
gAGCACAAGGCCGCCAACTATGGTGGCGCTAAGC.gg                                >  1:6044653/1‑36 (MQ=255)
 
  gCACAAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.gg.gg                             <  1:4500811/36‑1 (MQ=255)
 
  gCACAAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.gg.gg                             >  1:4802074/1‑36 (MQ=255)
 
   cacaAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.gg.ggg                            >  1:5488595/1‑35 (MQ=255)
 
     caAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.gg.gggtg                          <  1:6206392/36‑4 (MQ=255)
 
       aGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.GG.GGGgggc                        >  1:2801360/1‑34 (MQ=25)
 
        ggCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCg                        <  1:1881262/36‑1 (MQ=21)
 
        ggCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCg                        >  1:5634318/1‑36 (MQ=21)
 
         gccgccAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGt                       <  1:5990647/36‑1 (MQ=21)
 
            gccAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGAt                    <  1:3047435/36‑1 (MQ=21)
 
             ccAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATg                   <  1:4155108/36‑1 (MQ=21)
 
             ccAACAATGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATg                   <  1:3251921/36‑1 (MQ=21)
 
              caacaaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGc                  >  1:1502726/1‑36 (MQ=21)
 
              caacaaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGc                  <  1:2402895/36‑1 (MQ=21)
 
              caacaaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGc                  <  1:2498056/36‑1 (MQ=21)
 
                acaaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGGGTGATGCAt                >  1:6149126/1‑36 (MQ=18)
 
                acaaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCAt                <  1:7171223/36‑1 (MQ=21)
 
                acaaTGGTGATGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATgact                >  1:3575510/1‑33 (MQ=18)
 
                 caaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGGGGCGTGATGCAtt               >  1:7154842/1‑36 (MQ=18)
 
                  aaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTc              <  1:1509408/36‑1 (MQ=21)
 
                  aaTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATAGATTc              >  1:6217501/1‑36 (MQ=17)
 
                   aTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTcc             <  1:5026874/36‑1 (MQ=21)
 
                   aTGGTGGTGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTcc             <  1:1708221/36‑1 (MQ=21)
 
                     ggtggtGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGt           <  1:4439407/36‑1 (MQ=25)
 
                     ggtggtGATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGt           <  1:3865454/36‑1 (MQ=25)
 
                      gtggtgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGtc          >  1:2389353/1‑36 (MQ=25)
 
                       tggagATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGtct         <  1:4189690/36‑1 (MQ=21)
 
                        ggtgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGtctc        <  1:2598848/36‑1 (MQ=25)
 
                         gtgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTTCGTCTcc       >  1:3237855/1‑36 (MQ=21)
 
                         gtgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTcc       >  1:5106150/1‑36 (MQ=25)
 
                          tgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCt      <  1:4864881/36‑1 (MQ=25)
 
                          tgATAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCt      >  1:2202101/1‑36 (MQ=25)
 
                            aTAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCttt    >  1:359037/1‑36 (MQ=25)
 
                            aTAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCttt    <  1:2099570/36‑1 (MQ=25)
 
                            aTAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCttt    >  1:1800488/1‑36 (MQ=25)
 
                             tAAGCGGG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCtttt   <  1:4286487/36‑1 (MQ=21)
 
                              aaGC.GGAGGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCTTTTc  <  1:1319735/36‑1 (MQ=21)
 
                                  |                                
 
GAGCACAAGGCCGCCAACAATGGTGGTGATAAGC.GG.GGTGGCGTGATGCATTCCGTCTCCTTTTC  >  REL606/475255‑475319
 
 Base quality scores: 
ATCG
 < 3 ≤ 
ATCG
 < 9 ≤ 
ATCG
 < 18 ≤ 
ATCG
 < 30 ≤ 
ATCG
 < 32 ≤ 
ATCG
 |