| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 93 | 17,700 | +TGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTCCCCGTAGACCTGATAAGACACGTTAACCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCT | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 93 | 17666 = | 29 (0.440) | 28 (0.950) +GTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCA |
21/88 | 0.2 | 80.9% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 93 | = 17700 | 1 (0.020) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GACCGAATATTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 93/17600‑17731 | gACCGAATATTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCt < 1:1616795/101‑1 (MQ=255)atgcggcgcttgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCt > 1:634991‑M1/67‑101 (MQ=255) cggcgcttgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAgc > 2:886807‑M1/64‑101 (MQ=255) cGAATATTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgc < 1:1068207‑M2/101‑4 (MQ=255) cGAATATTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgc < 2:1204504‑M2/101‑4 (MQ=255) gcgcttgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAgcgc > 1:1249262‑M1/62‑101 (MQ=255) tatTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgcct > 2:1331690‑M2/1‑94 (MQ=255) tatTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgcct < 1:539278‑M2/101‑8 (MQ=255) tatTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgcct < 1:1474880‑M2/101‑8 (MQ=255) gcttgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCt < 2:358688‑M1/42‑1 (MQ=255) cttgcgccttatccgacctacattggtgttccccgtagacctgataagacacgttaacCGCCACATCAGGGATAGCTTGTCGGATTcggcgctaaggactt < 2:1163652‑M1/43‑8 (MQ=255) cttgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCtt < 2:1150723‑M1/43‑1 (MQ=255) cGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatcc > 1:730382‑M2/1‑89 (MQ=255) gccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCg < 1:1633516‑M1/48‑1 (MQ=255) gTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccg < 2:55781‑M2/101‑14 (MQ=255) tATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccga < 2:421600‑M2/101‑15 (MQ=255) aTCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgac < 1:878153‑M2/101‑16 (MQ=255) aTCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgac > 2:679593‑M2/1‑86 (MQ=255) ttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGAcc > 2:385758‑M1/51‑101 (MQ=255) tatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCt < 1:761728‑M1/52‑1 (MQ=255) tccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTAc > 2:1434560‑M1/48‑101 (MQ=255) ccGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacatt < 1:1048212‑M2/101‑23 (MQ=255) tacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATtggtg > 1:878707‑M1/41‑101 (MQ=255) tacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATtggtg < 2:356255‑M1/61‑1 (MQ=255) tacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATtggtg > 2:329084‑M1/41‑101 (MQ=255) attggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTc < 2:1172618‑M1/64‑1 (MQ=255) tGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctatattggtggtcc > 2:932276‑M2/1‑71 (MQ=255) tGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtcc > 2:493897‑M2/1‑71 (MQ=255) tggtggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTccc < 1:925901‑M1/66‑1 (MQ=255) gTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccc < 1:30595‑M2/101‑32 (MQ=255) gTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccc < 1:603869‑M2/101‑32 (MQ=255) cGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccg > 2:327169‑M2/1‑68 (MQ=255) ggTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgt < 2:1236943‑M2/101‑35 (MQ=255) ggTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgt > 1:1515625‑M2/1‑67 (MQ=255) ggtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAAGGAGCGCATATCGGATGGGGAGCTAGTGCCTTATCCGACCTACATTGGtggtcccgtag < 2:1521646‑M1/70‑5 (MQ=255) tCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtag < 1:1250684‑M2/101‑37 (MQ=255) gtccccgtagacctgataagacacgttaacCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGgtggtcccgtagg < 2:1025812‑M1/71‑6 (MQ=255) cACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtaga > 2:1048207‑M2/1‑64 (MQ=255) ccGTAGACCTGATAAGACACGTTAACCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTcccgtaggcctg < 2:1405432/101‑10 (MQ=37) tAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgat < 1:329084‑M2/101‑44 (MQ=255) tAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgat > 1:205948‑M2/1‑58 (MQ=255) gCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataag < 2:1137754‑M2/101‑47 (MQ=255) aTAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacg < 2:47705‑M2/101‑52 (MQ=255) aTAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacg > 1:421605‑M2/1‑50 (MQ=255) aaGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgtt < 2:634986‑M2/101‑54 (MQ=255) acacGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaac > 2:1352763‑M2/1‑45 (MQ=255) ncgTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatctgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccg < 1:1636811‑M2/100‑59 (MQ=255) tAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcac > 2:1646397‑M2/1‑39 (MQ=255) cGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatca < 2:1351554‑M2/101‑67 (MQ=255) cGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatca > 2:1527024‑M2/1‑35 (MQ=255) gTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcag < 2:531987‑M2/101‑68 (MQ=255) gTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcag < 1:822597‑M2/101‑68 (MQ=255) cacaTCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggc > 2:48578‑M2/1‑32 (MQ=255) cacaTCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggc < 2:1298553‑M2/101‑70 (MQ=255) caTCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcat > 2:640127‑M2/1‑30 (MQ=255) caTCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcat > 2:475466‑M2/1‑30 (MQ=255) aTCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatc > 1:113533‑M2/1‑29 (MQ=255) tCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcg > 2:204949‑M2/1‑28 (MQ=255) aTCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtc < 2:1184308‑M2/101‑80 (MQ=255) aTCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtc < 1:1439876‑M2/101‑80 (MQ=255) aTCGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtc < 2:1680553‑M2/101‑80 (MQ=255) cGCTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcgg > 1:47705‑M2/1‑20 (MQ=255) cTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggat > 2:154105‑M2/1‑18 (MQ=255) cTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggat > 2:1250769‑M2/1‑18 (MQ=255) cTTGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggat < 1:105791‑M2/101‑84 (MQ=255) tGTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgc < 1:1353793‑M2/101‑86 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcg < 2:1625292‑M2/101‑87 (MQ=255) cGGATGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggc > 2:603864‑M2/1‑13 (MQ=255) aTGCGGCGCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggcgct > 1:634991‑M2/1‑10 (MQ=255) cggcgCTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggcgctagc > 2:886807‑M2/1‑7 (MQ=255) gcgcTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggcgctagcgc > 1:1249262‑M2/1‑5 (MQ=255) gcTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggcgctagcgcct < 2:358688‑M2/101‑99 (MQ=255) cTtgcgccttatccgacctacattggtgttccccgtagacctgataagacacgttaaccgccacatcagggatagcttgtcggattcggcgctaaggactt < 2:1163652‑M2/101‑100 (MQ=255) cTtgcgccttatccgacctacattggtggtccccgtagacctgataagacacgttaaccgtcacatcaggcatcgcttgtcggatgcggcgctagcgcctt < 2:1150723‑M2/101‑100 (MQ=255) | GACCGAATATTTCGTATCGCTTCCGGGCATTGTCGGTCACCCGTAGGCCTGATAAGACACGTTAAACGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCTAGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 93/17600‑17731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |