New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | 5 | = 1340 | 74 (1.140) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAG > 5/1242‑1440 | aaTATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgg > 1:256906‑M2/1‑99 (MQ=255) atatGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg > 1:697359‑M2/1‑98 (MQ=255) tatGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggg < 2:804868/101‑1 (MQ=255) atGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggat < 1:1436444‑M2/101‑6 (MQ=255) atGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGt > 1:1028999/1‑101 (MQ=255) tGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGtt < 2:934201/101‑1 (MQ=255) tGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggata > 1:1382076‑M2/1‑95 (MQ=255) gggCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGttt < 1:1269347/101‑1 (MQ=255) gCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattact < 1:454798‑M2/101‑10 (MQ=255) gCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTtt > 1:508350‑M1/1‑99 (MQ=255) ccAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactc < 2:296807‑M2/101‑11 (MQ=255) cAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcc > 2:1431572‑M1/1‑97 (MQ=255) aGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccc > 1:1355926‑M1/1‑96 (MQ=255) 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cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccgcacaa < 1:887447‑M2/101‑20 (MQ=255) tGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttc > 2:499879‑M1/1‑88 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccgcacaacg < 2:209210‑M2/101‑22 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTcc > 1:715192/1‑101 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTcc < 2:1567917/101‑1 (MQ=255) aCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggttttttt > 2:646267‑M2/1‑79 (MQ=255) cAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcaggg < 1:756838‑M1/101‑18 (MQ=255) 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gagaGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgc > 1:1570202‑M1/1‑74 (MQ=255) agagTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatc > 2:1462204‑M2/1‑66 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCgg > 2:1620568/1‑101 (MQ=255) gTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacc > 1:384841‑M2/1‑63 (MQ=255) tAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagct > 2:552747‑M2/1‑62 (MQ=255) aaTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagcta < 1:150957‑M2/101‑41 (MQ=255) aTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaa < 1:1094560‑M2/101‑42 (MQ=255) aTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCaa < 1:411285/101‑1 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg > 1:170002‑M1/1‑66 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg < 1:117843‑M1/101‑36 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg > 1:1291212‑M1/1‑66 (MQ=255) tCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggg > 1:243667‑M1/1‑65 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctg > 1:1591004‑M2/1‑54 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagag > 1:1606130‑M2/1‑54 (MQ=255) 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aTgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgaccaatcaaatacccttgcagatattgcaccccgagcttatgcaat > 1:33020‑M2/1‑2 (MQ=255) aTgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttgcctgggtaaataactggctggcaggcgattgcg < 1:231821‑M2/101‑100 (MQ=255) tGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATTCTTATCGAAg < 1:1227774/101‑1 (MQ=255) | AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAG > 5/1242‑1440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |