New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 226 | 1 = | 0 (0.000) | 61 (0.920) | 55/200 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 5 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAGTCGC > 226/1‑99 | cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaggttagcgcttatgggtt < 2:1456174‑M1/2‑1 (MQ=255) cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggtt < 1:1448036‑M1/2‑1 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggttt < 2:987517‑M1/3‑1 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggtttt > 1:1039734‑M1/98‑101 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggtttt < 1:1455005‑M1/4‑1 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTa > 2:107942‑M1/97‑101 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTAc < 2:1272718‑M1/6‑1 (MQ=255) aaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTAccc > 1:28012‑M1/94‑101 (MQ=255) aacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTAcccc > 2:1454999‑M1/93‑101 (MQ=255) acgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTAccccc > 1:1019805‑M1/92‑101 (MQ=255) gcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCcgc < 1:8289‑M1/12‑1 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCgt < 2:655769‑M1/14‑1 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCgtggt > 1:425097‑M1/85‑101 (MQ=255) aagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGtggtgg > 1:575148‑M1/83‑101 (MQ=255) aagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGtggtgg < 2:482207‑M1/19‑1 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 2:111373‑M1/27‑1 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct > 1:671382‑M1/75‑101 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAt > 1:332616‑M1/70‑101 (MQ=255) tcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGt < 1:565464‑M1/36‑1 (MQ=255) cttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTa < 1:671064‑M1/37‑1 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAg > 2:49286‑M1/63‑101 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCg < 1:496946‑M1/41‑1 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCgaga > 2:245565‑M1/58‑101 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCgaga > 2:671059‑M1/58‑101 (MQ=255) ggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGaa > 1:1372888‑M1/57‑101 (MQ=255) gcaccgaggagtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAAc > 2:1705379‑M1/56‑101 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTg < 2:615564‑M1/48‑1 (MQ=255) aggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCtt > 2:548354‑M1/50‑101 (MQ=255) cgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTaaa > 1:212156‑M1/47‑101 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACt > 2:1006899‑M1/45‑101 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTTCTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTcc < 2:1145537‑M1/59‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTcc > 2:1484402‑M1/43‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCAt < 1:368796‑M1/61‑1 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCAt < 1:1071032‑M1/61‑1 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCAt < 2:1435587‑M1/61‑1 (MQ=255) tcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATAc < 1:382233‑M1/63‑1 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATAcc < 1:1695014‑M1/64‑1 (MQ=255) tcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCAc > 2:1606360‑M1/36‑101 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACg < 1:950280‑M1/67‑1 (MQ=255) agatggttcaacccttaggttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGt < 1:139095‑M1/68‑1 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTtct > 2:1656183‑M1/31‑101 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAGCTCCATACCACGTTctct > 2:1030664‑M1/29‑101 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTctct > 1:655774‑M1/29‑101 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTg < 2:1468880‑M1/74‑1 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggTTTTCCCCCCGCGTGCTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGAt > 2:1639201‑M1/26‑101 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACCTCTTCGCTTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATa > 2:571655‑M1/25‑101 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATac < 1:471727‑M1/78‑1 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACCCCACACCACGTTCTCTGATac > 2:52999‑M1/24‑101 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATactca < 1:612468‑M1/81‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATactcaa < 1:1066989‑M1/82‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATactcaac < 2:1230169‑M1/83‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATactcaact < 1:280326‑M1/84‑1 (MQ=255) agcgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTcacac < 1:761169‑M1/89‑1 (MQ=255) cgcttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAActcacacta < 1:953483‑M1/91‑3 (MQ=255) cttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACg < 2:665001‑M1/93‑1 (MQ=255) ttatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGa > 1:997355‑M1/8‑101 (MQ=255) tatgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAg > 2:368796‑M1/7‑101 (MQ=255) tatgggTTTTACCCCCGCGTGGGGGCTACTTCTTCGGTTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAGACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAg < 2:159477‑M1/95‑1 (MQ=255) tgggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAGTc > 1:1668544‑M1/5‑101 (MQ=255) ggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGGGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAGTCGc < 2:92841‑M1/99‑1 (MQ=255) ggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAGTCGc < 2:863269‑M1/99‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGATTCGTAAGCGAGAACTGCCTTAAACTCCATACCACGTTCTCTGATACTCAACTCACACAACGAGTCGC > 226/1‑99 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |