| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 158 | 1 = | 0 (0.000) | 68 (1.040) +CT |
48/196 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
AGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 158/99‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 223/698‑615 || AGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACT > 1:794965/1‑101 AATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:952954/1‑101 ATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:204903/101‑1 TATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 2:210575/101‑1 TATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 2:1400296/1‑101 TTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:1665613/1‑101 TAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:1697722/101‑1 TAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAAGATAGATTAGGTGAGGCTGCCAACTTGCTGCTT > 2:297992/1‑101 AATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:1635365/1‑101 AATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 2:1391378/1‑101 ATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:197138/101‑1 ATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1514444/101‑1 TTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:857675/1‑101 TATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 2:1660780/1‑101 TATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:503210/1‑101 TTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 2:1119338/1‑101 TTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 2:354420/101‑1 AACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:338737/1‑101 AACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:1210662/1‑101 CTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1433713/101‑1 CTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:32472/101‑1 TGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 2:990776/1‑101 GCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:324744/1‑101 GCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 1:1681512/101‑1 CTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 1:1135443/101‑1 TGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 2:1356292/1‑101 TGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:48845/1‑101 TGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 2:125720/101‑1 GAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:1248754/1‑101 ATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:385326/101‑1 CTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:275903/101‑1 CTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:1685790/101‑1 CTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGAGGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 2:853418/1‑101 CCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:140574/1‑101 CTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:330601/101‑1 CTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:848368/101‑1 CTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:1119343/101‑1 TTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:1560277/101‑1 TTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:1295011/101‑1 TGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:966457/101‑1 GAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:435079/101‑1 ATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:1641083/1‑101 TATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:179992/1‑101 ATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:927282/1‑101 CCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:339176/101‑1 CCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:279303/101‑1 TTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:1370377/1‑101 TATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:270147/1‑101 TTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:144812/101‑1 ACATTTCATGTCATGTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:197040/101‑1 ATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:1208673/101‑1 CATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG > 2:1655618/1‑101 ATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:677502/1‑101 ATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 2:356070/1‑101 TTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT < 2:952949/101‑1 TTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT < 2:1046839/101‑1 ATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:927287/101‑1 ATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 1:746491/1‑101 ATATAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGAGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 2:1573720/1‑101 ggatatTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 2:660195/7‑101 TAGATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT < 1:882320/101‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:1084117/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:353979/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:11653/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:1227265/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:646270/101‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:585652/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:1504259/1‑101 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:1006836/101‑1 || AGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATATATCCATTATTACATTTCATGCCATTTTTAATATAGATTGGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 158/99‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 223/698‑615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |