New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | 178 | 4072 = | 12 (0.320) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AAAGGTTCTGCTCACCCTGTGGGATTATATGTCTACGCCCGACCAGATTAAGCGGATGCAGGACGTCATTAGCAACCCCAAACGACTGGATGGAGTTCTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 116/141‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgatcctacccacgtaatatggacacaggcctaagcgaggttcTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTA > 178/4072‑4171 AAAGGTTCTGCTCACCCTGTGGGATTATATGTCTACGCCCGACCAGATTAAGCGGATGCAGGACGTCATTAGCAACCCCAAACGACTGGATGGAGTTCTGA > 1:1508484/1‑101 AGGTTCTGCTCACCCTGTGGGATTATATGTCTACGCCCGACCAGATTAAGCGGATGCAGGACGTCATTAGCAACCCCAAACGACTGGATGGAGTTCTGATC > 1:929755/1‑101 GGTTCTGCTCACCCTGTGGGATTATATGTCTACGCCCGACCAGATTAAGCGGATGCAGGACGTCATTAGCAACCCCAAACGACTGGATGGAGTTCTGATCC < 1:1711583/101‑1 GTTCTGCTCACCCTGTGGGATTATATGTCTACGCCCGACCAGATTAAGCGGATGCAGGACGTCATTAGCAACCCCAAACGACTGGATGGAGTTCTGATCCT < 1:1345949/101‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |