Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | 41 | 700 | 0 | C | T | 58.5% | 65.6 / 144.7 | 123 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/20); new base T (46/26); total (77/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCACCATCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAG > 41/600‑797 | tCACCATCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCAcc < 1:1285323/101‑1 (MQ=255) cACCATCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGCAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCg > 2:1115013/1‑101 (MQ=255) aCCATCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCgg > 1:940187/1‑101 (MQ=255) ccATCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGt < 1:1329779/101‑1 (MQ=255) ccATCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGt < 2:379179/101‑1 (MQ=255) cATCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtg < 2:1467993/101‑1 (MQ=255) aTCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGtgc > 1:1257460/1‑101 (MQ=255) aTCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGtgc > 2:685450/1‑101 (MQ=255) aTCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtgc > 2:149219/1‑101 (MQ=255) aTCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtgc > 1:292241/1‑101 (MQ=255) aTCAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtgc > 1:1604544/1‑101 (MQ=255) tCAACACTTCTCACGTTGAATACGACCCCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtgct < 2:1049474/101‑1 (MQ=255) cAACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGtgctg > 1:1482891/1‑101 (MQ=255) aaCACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGtgctgc > 2:1310751/1‑101 (MQ=255) cTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAg < 1:1153593/101‑1 (MQ=255) tctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGAt < 1:1669829/101‑1 (MQ=255) tcACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATgg > 1:775486/1‑101 (MQ=255) cACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGa < 1:1290930/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACAGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:1117797/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc > 1:1503096/1‑101 (MQ=255) cGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACg > 1:311522/1‑101 (MQ=255) gTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACgg < 2:1598082/101‑1 (MQ=255) gTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACgg > 2:299059/1‑101 (MQ=255) gAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGgcgc > 1:1284979/1‑101 (MQ=255) tGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATcc > 1:178498/1‑101 (MQ=255) cgACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATcc < 2:13758/100‑1 (MQ=255) gACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCt > 1:1108670/1‑101 (MQ=255) acacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTg > 2:210200/1‑101 (MQ=255) cccccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGt < 2:1269363/100‑1 (MQ=255) acCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGt > 2:370181/1‑101 (MQ=255) cccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAg > 2:244917/1‑101 (MQ=255) cGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGtt < 1:488783/101‑1 (MQ=255) gACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtg > 1:1655205/1‑101 (MQ=255) aCCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgc > 2:736713/1‑101 (MQ=255) ccGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctg > 2:147693/1‑101 (MQ=255) ccGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctg < 2:781018/101‑1 (MQ=255) ccGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctg > 2:1151149/1‑101 (MQ=255) cGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctgc > 2:1640385/1‑101 (MQ=255) cGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctgc > 2:840671/1‑101 (MQ=255) cGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgctgc > 2:174717/1‑101 (MQ=255) gTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCg > 2:118874/1‑101 (MQ=255) gTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCg > 2:1584928/1‑101 (MQ=255) gTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCg > 1:1011485/1‑101 (MQ=255) aCTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACt < 2:1656104/101‑1 (MQ=255) aCTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACt > 1:515607/1‑101 (MQ=255) cTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCACGATCCTGATAGTTGCTGCGACTg > 2:1145884/1‑101 (MQ=255) tACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGa < 1:1121459/101‑1 (MQ=255) acgctgccGTAGACTGCCCGGGGCACGTAGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGAc < 1:174717/94‑1 (MQ=255) aCGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGAc < 2:1257455/101‑1 (MQ=255) cGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACg < 1:1623614/101‑1 (MQ=255) acacGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGcc > 1:195194/1‑101 (MQ=255) acGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg > 1:982375/1‑101 (MQ=255) acGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg > 1:1584961/1‑101 (MQ=255) gTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 2:616224/101‑1 (MQ=255) gTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 2:160370/101‑1 (MQ=255) gTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 1:1072348/101‑1 (MQ=255) gTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 1:380031/101‑1 (MQ=255) aGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:680894/1‑101 (MQ=255) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc > 2:621049/1‑101 (MQ=255) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:611849/101‑1 (MQ=255) gACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc > 1:802730/1‑101 (MQ=255) cTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGc > 1:1425956/1‑101 (MQ=255) gCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAg < 2:1153229/101‑1 (MQ=255) cccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGa > 2:353152/1‑101 (MQ=255) gggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCg < 2:292241/101‑1 (MQ=255) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg < 1:1586092/101‑1 (MQ=255) cACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGa > 2:1305109/1‑101 (MQ=255) cACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGa > 1:1552405/1‑101 (MQ=255) aCGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAg > 2:412286/1‑101 (MQ=255) aCGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAg > 1:809343/1‑101 (MQ=255) gCCGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGca > 2:935379/1‑101 (MQ=255) gCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGca > 1:907230/1‑101 (MQ=255) ccGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcac < 1:170101/101‑1 (MQ=255) ccGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcac > 2:190832/1‑101 (MQ=255) cGACTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGcaca < 1:1435987/101‑1 (MQ=255) aCTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATc > 2:877493/1‑101 (MQ=255) aCTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATc > 2:102788/1‑101 (MQ=255) aCTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATc > 1:1241596/1‑101 (MQ=255) cTATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGACCACATcc < 1:1042387/101‑1 (MQ=255) cTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATcc < 1:71557/101‑1 (MQ=255) tATGTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCct > 1:915884/1‑101 (MQ=255) gTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCctgct > 1:1538883/1‑101 (MQ=255) gTTAAAAACATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCctgct > 1:1031831/1‑101 (MQ=255) ttAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCctgctg > 1:366905/1‑101 (MQ=255) aaaaaCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTggg > 2:585201/1‑101 (MQ=255) aaaaCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgt > 1:1522898/1‑101 (MQ=255) aaaCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtc > 1:588669/1‑101 (MQ=255) aaaCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtc < 2:16055/101‑1 (MQ=255) aCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgt < 2:1584955/101‑1 (MQ=255) aCATGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgt > 1:816972/1‑101 (MQ=255) aCATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGgtcgt < 2:795871/101‑1 (MQ=255) aTGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa > 1:1583937/1‑101 (MQ=255) aTGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa > 1:516122/1‑101 (MQ=255) aTGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCa > 2:1565271/1‑101 (MQ=255) tGATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAg > 1:1430422/1‑101 (MQ=255) tGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAg < 2:102585/101‑1 (MQ=255) gATCACTGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:1151154/101‑1 (MQ=255) gATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAgg < 1:102788/101‑1 (MQ=255) tCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTa < 2:1672899/101‑1 (MQ=255) cACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAg > 2:900221/1‑101 (MQ=255) | TCACCATCAACACTTCTCACGTTGAATATGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAG > 41/600‑797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |