| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 31 | 2,079 | 0 | A | G | 57.9% | 50.0 / 109.5 | 95 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/14); new base G (35/20); total (61/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.82e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AAATCAATCTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACGGCAATTTCC > 31/1979‑2176 | aaaTCAATCTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCa < 1:1176643/101‑1 (MQ=255)aaaTCAATCTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCa > 2:678062/1‑101 (MQ=255) atcaatcTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGc > 2:299191/1‑101 (MQ=255) tcaatcTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCgcggcg < 1:494183/101‑1 (MQ=255) aatcTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCggg > 2:802852/1‑101 (MQ=255) tcTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTc < 2:1247395/101‑1 (MQ=255) cTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGcc < 2:786186/101‑1 (MQ=255) cTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGcc > 1:568191/1‑101 (MQ=255) tGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCg < 2:1192800/101‑1 (MQ=255) tGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCg < 2:743112/101‑1 (MQ=255) gCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCgg < 2:796299/101‑1 (MQ=255) cGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCggg > 2:682958/1‑100 (MQ=255) tGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCggtgg > 1:1538693/1‑101 (MQ=255) tGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCggtgg > 2:48569/1‑101 (MQ=255) tGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCACCGGGTCCggtgg > 2:944200/1‑101 (MQ=255) gCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGa > 1:1678073/1‑101 (MQ=255) gCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGGGGTGGa > 2:1439730/1‑101 (MQ=255) cTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGAc < 1:212934/101‑1 (MQ=255) aCGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCt > 2:73858/1‑101 (MQ=255) cGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTa > 2:1557487/1‑101 (MQ=255) gTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCAt > 1:796201/1‑101 (MQ=255) aTCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGaa < 1:1703355/101‑1 (MQ=255) tCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAg > 2:1134486/1‑101 (MQ=255) tCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAg < 1:1548914/101‑1 (MQ=255) cACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGc > 1:1642359/1‑101 (MQ=255) aCCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGcc > 2:162301/1‑101 (MQ=255) aCCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGcc > 1:478968/1‑101 (MQ=255) aCCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGcc > 1:1638643/1‑101 (MQ=255) ccTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGccc > 1:1546573/1‑101 (MQ=255) ccTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGccc > 2:1616577/1‑101 (MQ=255) cTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCg > 1:949184/1‑101 (MQ=255) cTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCg < 2:850131/101‑1 (MQ=255) tGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGc > 2:1337651/1‑101 (MQ=255) gTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCt > 1:1121732/1‑101 (MQ=255) gTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCt > 1:473139/1‑101 (MQ=255) tCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCTGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCttt < 1:416266/101‑1 (MQ=255) ggTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTaa < 1:214504/101‑1 (MQ=255) ggTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTaa > 1:1556150/1‑101 (MQ=255) gTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTaaa > 2:865760/1‑100 (MQ=255) gTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTaaa < 1:1168092/101‑2 (MQ=255) ttATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGGGCTTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGCGGTGGACGCCATTGAAGCCCGATTTaaac > 2:803436/1‑99 (MQ=255) tataTCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGc > 1:1320558/1‑101 (MQ=255) atatCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGcc > 1:1515549/1‑101 (MQ=255) tatTAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGccc > 2:1379939/1‑101 (MQ=255) tatCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGccc > 2:1436977/1‑101 (MQ=255) tCAGCGTCAAAGCCCTCCCGCCGCGCACGCGGGGGCGCAGCTCCAGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGGAGCCCGCTTTAACGCCCtt < 1:361440/101‑2 (MQ=255) tCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTc < 1:588931/101‑1 (MQ=255) tCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTc < 2:628943/101‑1 (MQ=255) tCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTc > 2:1420911/1‑101 (MQ=255) aaCGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGCGATCAACTCCGGGAACAGCGCAGCGGGTCCGTTGGTGGGCGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCACTCga > 1:184854/1‑100 (MQ=255) aCGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGgc > 1:580170/1‑101 (MQ=255) cGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGgcg > 1:337984/1‑101 (MQ=255) tCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAACGGGTCCGCTGGTGGACGCTATCGAAGCCAGCTTTAACGCCCTCGgcgcc > 2:1498385/1‑100 (MQ=255) aaaaaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTcc > 1:1635981/1‑101 (MQ=255) aaaaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCg > 2:1630367/1‑101 (MQ=255) aaaaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCg > 1:191203/1‑101 (MQ=255) aaaaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCg < 2:949179/101‑1 (MQ=255) aaaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCgg > 1:550966/1‑101 (MQ=255) aaCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGt < 1:1589470/101‑1 (MQ=255) aCCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTg < 1:386621/101‑1 (MQ=255) ccTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTgg < 2:1603354/101‑1 (MQ=255) cTCCCGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCGCGGCGCCCCGGTGGa < 2:1060311/101‑1 (MQ=255) cACGCCGCTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAAt > 1:961511/1‑101 (MQ=255) cACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAAt < 1:1089155/101‑1 (MQ=255) cACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAAt < 2:1661207/101‑1 (MQ=255) cgccgcTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTa < 1:1098958/101‑1 (MQ=255) gccgcTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTaa > 1:426943/1‑101 (MQ=255) cgcTCAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATc > 1:503648/1‑101 (MQ=255) cgcTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGGCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTCATc > 2:1242465/1‑101 (MQ=255) cTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCaa > 2:290325/1‑101 (MQ=255) cTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCaa > 1:242519/1‑101 (MQ=255) cAAGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAg < 2:1354222/101‑1 (MQ=255) cAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAg < 1:12859/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGt > 1:1673433/1‑101 (MQ=255) aaGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGt > 2:688458/1‑101 (MQ=255) cTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTAca < 2:510209/101‑1 (MQ=255) cTGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTAca < 1:1134491/101‑1 (MQ=255) tGGTGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTacac < 1:1294614/101‑1 (MQ=255) ggTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGcaca < 2:445956/101‑1 (MQ=255) gTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCacaa > 2:976019/1‑101 (MQ=255) tGATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACacaac < 2:664072/101‑1 (MQ=255) tGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCacaac > 2:1019985/1‑101 (MQ=255) gATTAACTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGGCGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACacaaca > 1:1496220/1‑101 (MQ=255) gATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCacaaca < 1:1157624/101‑1 (MQ=255) gATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCacaaca > 2:249001/1‑101 (MQ=255) attaaCTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAacac > 2:756869/4‑101 (MQ=255) attaaCTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAacac > 2:383089/4‑101 (MQ=255) tCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACg < 2:146763/101‑1 (MQ=255) taaCTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGc > 1:693354/2‑101 (MQ=255) aaCTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGcc < 2:935925/101‑1 (MQ=255) cTCCGGGAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGCCgg > 2:126186/1‑101 (MQ=255) tCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGa > 2:1500451/1‑101 (MQ=255) cGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACg > 1:181281/1‑101 (MQ=255) gggAATGGCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGCCGGACgg < 2:746624/101‑1 (MQ=255) aaCGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACGGCaa > 2:234032/1‑101 (MQ=255) atggCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGCCGGACGGCAAt > 2:471244/3‑101 (MQ=255) tggCGCGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGCCGGACGGCAAtt > 2:41260/2‑101 (MQ=255) cGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACGGCAAtt < 1:1287467/101‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGGGCCGGTGGTGGACGCCATTGAAGCCCGCTTTAAAGCCCTCGGCGCACCGGTGGAATTAATCAAAGTACACAACACGCCGGACGGCAATTTc < 1:1466457/101‑1 (MQ=255) cgcAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACGGCAATTTcc > 2:1330475/1‑101 (MQ=255) | AAATCAATCTGCGTGACGCTTACGTTGATCACCTGTTCGGTTATATCAACGTCAAAAACCTCACGCCGCTCAAGCTGGTGATCAACTCCGGGAACGGCGCAGCGGGTCCGGTGGTGGACGCTATCGAAGCCCGCTTTAACGCCCTCGGCGCTCCGGTGGAATTAATCAAAGTGCACAACACGCCGGACGGCAATTTCC > 31/1979‑2176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |