| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 133 | 2,128 | 0 | T | C | 71.5% | 211.9 / 95.7 | 138 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (22/17); new base C (49/49); total (72/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGCGCGTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAGCTGT > 133/2030‑2225 | tGCGCGTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGttt < 1:751288/101‑1 (MQ=255) gcgcGTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTg > 1:221714/1‑101 (MQ=255) cgcgTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTgg < 1:1281967/101‑1 (MQ=255) gcgTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTggg < 2:165100/101‑1 (MQ=255) cgTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGa > 2:300358/1‑101 (MQ=255) cgTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGa < 2:721184/101‑1 (MQ=255) gAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGAtgt > 1:20312/1‑101 (MQ=255) catacCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGc > 2:1178700/4‑101 (MQ=255) catacCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGc > 1:1688113/4‑101 (MQ=255) atacCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCa > 1:2470/3‑101 (MQ=255) atacCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCa > 2:944669/3‑101 (MQ=255) acacCCAGGCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCa > 2:55362/1‑101 (MQ=255) cccAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGc < 1:1018512/101‑1 (MQ=255) cAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCt > 1:999136/1‑101 (MQ=255) cAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCt < 1:628859/101‑1 (MQ=255) aGGCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTg > 2:159966/1‑101 (MQ=255) aGGCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTg > 1:639598/1‑101 (MQ=255) gCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGAt < 2:1669008/101‑1 (MQ=255) gCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGAt > 1:846208/1‑101 (MQ=255) gCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGAt < 1:1571051/101‑1 (MQ=255) gCAGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGAt < 1:411348/101‑1 (MQ=255) aGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATgg > 1:534582/1‑101 (MQ=255) aGAATATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATgg > 2:294496/1‑101 (MQ=255) gAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGa > 1:1467120/1‑101 (MQ=255) aaTATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGAt > 1:1581097/1‑101 (MQ=255) aaTATCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGGGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGAt > 2:1368690/1‑101 (MQ=255) tatCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGAttt > 2:686595/1‑101 (MQ=255) tatCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGCTGGAttt > 2:1291806/1‑101 (MQ=255) tatCGCTGGATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGAttt < 1:1440136/101‑1 (MQ=255) atCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGAtttt < 1:977627/101‑1 (MQ=255) tGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCtgt < 1:1359356/101‑1 (MQ=255) ggATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCtgtg > 1:400685/1‑101 (MQ=255) ggATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCtgtg < 2:1052130/101‑1 (MQ=255) ggATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCtgtg < 1:1103412/101‑1 (MQ=255) gATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGc > 1:363951/1‑101 (MQ=255) gATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGc < 1:1258998/101‑1 (MQ=255) gATCGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGc > 1:1103185/1‑101 (MQ=255) aTTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGcc > 1:618361/1‑101 (MQ=255) tGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGACGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCgg > 2:1334839/1‑101 (MQ=255) cgAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCgg > 2:1239798/2‑101 (MQ=255) gAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggt > 1:529144/1‑101 (MQ=255) gAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggt < 1:990178/101‑1 (MQ=255) gAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggt > 2:1289302/1‑101 (MQ=255) aTGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggtggt > 1:348162/1‑101 (MQ=255) aTGTTCGGGCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggtggt > 2:827298/1‑101 (MQ=255) aTGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCggtggt < 1:692526/101‑1 (MQ=255) gTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGtggtgg > 1:1041433/1‑101 (MQ=255) ttCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGc < 2:1412426/101‑1 (MQ=255) gggCATGGCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGGTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCgtg > 2:1693389/1‑101 (MQ=255) gCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTc < 2:1467114/101‑1 (MQ=255) gCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTc < 2:1116678/101‑1 (MQ=255) cATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTct < 2:1688107/101‑1 (MQ=255) cATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTGTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTct < 2:1257569/101‑1 (MQ=255) aTGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTctg > 1:596845/1‑101 (MQ=255) aTGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTctg > 1:981135/1‑101 (MQ=255) ggCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTctgct < 1:1574303/101‑1 (MQ=255) gCAAGCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTctgctg < 1:1197706/101‑1 (MQ=255) gCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTctgctg < 2:1439565/101‑1 (MQ=255) cAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTgg < 2:410054/101‑1 (MQ=255) aaGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGt > 2:1532113/1‑101 (MQ=255) gCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCt < 2:1689104/101‑1 (MQ=255) gCGGATTAACATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCt > 2:1571738/1‑101 (MQ=255) gCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCt < 2:1623395/101‑1 (MQ=255) cGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTg > 1:752239/1‑101 (MQ=255) cGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTg < 2:1703336/101‑1 (MQ=255) cGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTg < 1:510590/101‑1 (MQ=255) gaatgaatATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTgg > 1:1691118/1‑101 (MQ=255) attaacatGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCt > 1:1309752/7‑101 (MQ=255) atatGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTg > 2:262472/1‑101 (MQ=255) tatGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTgg > 2:1406741/1‑101 (MQ=255) tatGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTgg < 1:305824/101‑1 (MQ=255) catGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTgg < 1:1467742/100‑1 (MQ=255) atGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGt > 1:1632278/1‑101 (MQ=255) tGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGtt < 2:711721/101‑1 (MQ=255) tGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGtt < 1:523943/101‑1 (MQ=255) gCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTa < 2:453697/101‑1 (MQ=255) gCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTa < 1:382862/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATc > 1:432549/1‑101 (MQ=255) gtggtgGGGCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATc < 1:1650073/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATc < 1:872925/101‑1 (MQ=255) tggtggGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCg < 1:1307430/101‑1 (MQ=255) ggtggGGCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGt < 1:1397767/101‑1 (MQ=255) ggggCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTggg < 2:118870/101‑1 (MQ=255) ggggCGGTTTTGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTACTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTggg < 2:618356/101‑1 (MQ=255) ggCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTg > 2:974742/1‑101 (MQ=255) ggCGGTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTg > 2:1677480/1‑101 (MQ=255) ggTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGaaa > 2:1501883/1‑101 (MQ=255) gTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGGTTTTGCTGTGCCGGCGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGGGGGTGaaaa > 1:1415545/1‑101 (MQ=255) gTTTTGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGaaaa > 2:418928/1‑101 (MQ=255) tttGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGaaaaaa > 1:663595/1‑101 (MQ=255) tttGATCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGaaaaaa < 2:175653/101‑1 (MQ=255) ttGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAg > 2:1312375/1‑101 (MQ=255) ttGATACACGTGCATGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAg < 1:682915/101‑1 (MQ=255) tGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAgg < 2:564628/101‑1 (MQ=255) aTCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCATGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTg < 2:736013/101‑1 (MQ=255) tCCGCGCGCGTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTgg < 1:298127/101‑2 (MQ=255) ccGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCGGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAg < 2:84369/101‑1 (MQ=255) gcgTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAGCt < 2:221714/101‑1 (MQ=255) gtgtTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAGCTGt > 1:1030416/1‑101 (MQ=255) gtgtTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGATCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAGCTGt < 1:1426495/101‑1 (MQ=255) | TGCGCGTGAACACACCCAGGCAGAATATCGCTGGATTGAAATGTTCGGGCATGGCAAGCGAATGAATATGCCGTGGTGGGGCGGTTTTGATCCGCGTGTTTGGGATGTGGCAAGCCTGATGGATTTTGCTGTGCCGGTGGTGGCGTGTCTGCTGGTCTGGCTGTTGGTTAATCGTGGGTGAAAAAAGGTGAGCTGT > 133/2030‑2225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |