New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 111 | 1 = | 0 (0.000) | 22 (0.360) | 18/200 | 2.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 224 | = 660 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GAATCGCAGCGGTGAAGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 224/561‑660 | gAATCGCAGCGGTGAAGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGg < 1:1472240‑M2/101‑2 (MQ=255) gCGGTGAAGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcg > 2:763283‑M2/1‑92 (MQ=255) tGAAGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccc < 2:208537‑M2/101‑14 (MQ=255) aaGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctt < 2:835870‑M2/101‑16 (MQ=255) agaCGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtctcctcgcccctttgg < 1:130157‑M2/101‑19 (MQ=255) agaCGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttgg > 1:659276‑M2/1‑83 (MQ=255) gaCGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggg > 1:621421‑M2/1‑82 (MQ=255) cGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttgggga < 2:51232‑M2/101‑22 (MQ=255) ggTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggag > 2:729650‑M2/1‑79 (MQ=255) ggTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggag > 2:1211051‑M2/1‑79 (MQ=255) tgctgcGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagag > 1:84685‑M2/1‑77 (MQ=255) tgctgcGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagag > 1:1658651‑M2/1‑77 (MQ=255) gctgcGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagg > 1:609160‑M2/1‑76 (MQ=255) ctgcGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagaggg < 1:1292060‑M2/101‑27 (MQ=255) aTTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtccccacgcccctttggggagagggttaggg < 1:686360‑M2/101‑33 (MQ=255) tGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgag > 2:938982‑M2/1‑65 (MQ=255) gCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgagg < 1:1287435‑M2/101‑38 (MQ=255) cGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGCTAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgaggg < 1:1379350‑M2/101‑39 (MQ=255) cGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgaggg < 1:1403916‑M2/101‑39 (MQ=255) gagaGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgaggggaa < 2:217378‑M2/101‑42 (MQ=255) agagTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgaggggaac > 1:548677‑M2/1‑59 (MQ=255) agTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACGgtcccctcgcccctttggggagagggttagggtgaggggaacgt < 2:949555‑M2/101‑45 (MQ=255) | GAATCGCAGCGGTGAAGAGACGGTGCTGCGGATTTTGCGTGAGAGTATTGCCAGTATTTAATGCTGGATAGCACCGTCAAGCTAAATTCCGTACTGAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 224/561‑660 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |