| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 11 | 30149 = | 198 (3.120) | 57 (1.120) | 33/168 | 0.6 | 40.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 93 | 17 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAC > 93/1‑116 | cgcctttagggcgcttttttacagtggtgggtcgcgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgaccca < 2:140125‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccat > 2:621859‑M2/100‑100 (MQ=255) cctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccata > 2:289863‑M2/99‑99 (MQ=255) cctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccata < 2:413986‑M2/3‑3 (MQ=255) ctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatat > 2:495618‑M2/98‑98 (MQ=255) ctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatat > 1:825699‑M2/98‑98 (MQ=255) ctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatat < 1:1590729‑M2/4‑4 (MQ=255) tttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatg > 1:1250823‑M2/97‑97 (MQ=255) tttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatg > 2:1564922‑M2/97‑97 (MQ=255) tttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatg > 2:194169‑M2/97‑97 (MQ=255) tagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatggg > 1:1632880‑M2/95‑95 (MQ=255) agggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatgggt < 2:1357280‑M2/8‑8 (MQ=255) gggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatgggtg < 1:60730‑M2/9‑9 (MQ=255) ggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatgggggt > 2:1481781‑M2/92‑92 (MQ=255) gcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccatatgggtgtt < 2:416038‑M2/11‑11 (MQ=255) accttagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCt > 1:1067827‑M2/88‑101 (MQ=255) cttagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCttt > 2:1083132‑M2/86‑101 (MQ=255) ttagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTc > 2:180353‑M2/85‑101 (MQ=255) ttagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTc < 1:409623‑M2/17‑1 (MQ=255) tagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccCCTTTTTCGTTGCTTTCg < 2:875926‑M2/18‑1 (MQ=255) tagcgattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCg < 2:651426‑M2/18‑1 (MQ=255) tagcgattggtgggtcgtgcagaattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCg < 1:1404330‑M2/18‑1 (MQ=255) attggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGgtttg < 1:1083137‑M2/23‑1 (MQ=255) attggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgaaccACTTTTTCGTTGCTTTCGgtttg > 2:577942‑M2/79‑101 (MQ=255) tgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGa < 1:378946‑M2/28‑1 (MQ=255) ggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGata < 2:465966‑M2/30‑1 (MQ=255) ggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGata > 1:1052356‑M2/72‑101 (MQ=255) ggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGata < 1:754027‑M2/30‑1 (MQ=255) cgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATcc > 2:184116‑M2/69‑101 (MQ=255) gtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATccc > 2:342647‑M2/68‑101 (MQ=255) tgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCg > 1:582653‑M2/67‑101 (MQ=255) tgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCg > 1:911804‑M2/67‑101 (MQ=255) ttcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAc < 1:530112‑M2/42‑1 (MQ=255) ttcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAc < 1:558328‑M2/42‑1 (MQ=255) gaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAcggc > 1:1443402‑M2/57‑101 (MQ=255) gaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAcggc > 1:873336‑M2/57‑101 (MQ=255) cgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCatat < 2:1161597‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATACCGTGGCAACGGCGGCATATAtt > 2:1631339‑M2/47‑101 (MQ=255) attgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACt > 1:209181‑M2/44‑101 (MQ=255) tgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGa > 1:1089401‑M2/42‑101 (MQ=255) ttaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGAttt < 2:658415‑M2/63‑1 (MQ=255) taaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTc < 1:342647‑M2/64‑1 (MQ=255) aaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAg > 2:1101974‑M2/36‑101 (MQ=255) aaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAg < 1:371946‑M2/66‑1 (MQ=255) aaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAg < 1:1628815‑M2/66‑1 (MQ=255) aagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGa > 1:328432‑M2/35‑101 (MQ=255) agtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTTAGAc > 1:1515348‑M2/34‑101 (MQ=255) agtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGAc > 1:848273‑M2/34‑101 (MQ=255) gtcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACt > 2:320686‑M2/33‑101 (MQ=255) tcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACtt < 2:1107437‑M2/70‑1 (MQ=255) tcaactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACtt < 2:273946‑M2/70‑1 (MQ=255) caactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTg < 1:577947‑M2/71‑1 (MQ=255) caactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTg < 2:1526689‑M2/71‑1 (MQ=255) aactgctctaccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGa > 1:1287769‑M2/30‑101 (MQ=255) taccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGcaaca > 2:494733‑M2/22‑101 (MQ=255) ccaactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACaaa > 2:347615‑M2/20‑101 (MQ=255) aactgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACaaaaa < 2:810883‑M2/84‑1 (MQ=255) gagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTc > 1:139313‑M2/14‑101 (MQ=255) ctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAt < 1:1033137‑M2/91‑1 (MQ=255) ctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAt < 2:209181‑M2/91‑1 (MQ=255) ctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAt < 2:1649297‑M2/91‑1 (MQ=255) aacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGc < 1:388938‑M2/93‑1 (MQ=255) acgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGatgaa < 1:489829‑M2/94‑3 (MQ=255) cgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAg > 1:1081822‑M2/7‑101 (MQ=255) gacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGa > 2:315957‑M2/6‑101 (MQ=255) cccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATc > 1:303253‑M2/4‑101 (MQ=255) cccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATc > 1:1547118‑M2/4‑101 (MQ=255) cccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATc > 1:1399473‑M2/4‑101 (MQ=255) ccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCa > 2:216855‑M2/3‑101 (MQ=255) cACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAc < 2:911799‑M2/100‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAC > 93/1‑116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |