New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 10 | 1 = | 0 (0.000) | 48 (0.750) | 32/184 | 1.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 32 | = 33892 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GGTACAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCGGAT > 32/33793‑33900 | tctacAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAt > 1:1071516‑M2/3‑100 (MQ=255) ggTACAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAt > 2:91536‑M2/1‑100 (MQ=255) gTACAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGACGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtg < 2:1656974‑M2/101‑3 (MQ=255) aCAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtaga < 2:1071511‑M2/101‑5 (MQ=255) cAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccg < 2:676576‑M2/101‑6 (MQ=255) aaaCCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggat > 2:1476359‑M2/1‑93 (MQ=255) aaCCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatg > 1:488786‑M2/1‑92 (MQ=255) cagcagGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcgg > 2:988021‑M2/1‑89 (MQ=255) agcagGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggc > 2:1345962‑M2/1‑88 (MQ=255) cTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaac > 1:869449‑M2/1‑82 (MQ=255) cTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaac > 1:1417101‑M2/1‑82 (MQ=255) tGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacg < 1:548570‑M2/101‑21 (MQ=255) tCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttat > 1:1495382‑M2/1‑75 (MQ=255) cagcagCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatc < 2:243356‑M2/101‑28 (MQ=255) gcagcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaactccttatccg < 1:6736‑M2/101‑30 (MQ=255) cagcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg > 2:1126414‑M2/1‑71 (MQ=255) cagcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg < 1:1132138‑M2/101‑31 (MQ=255) cagcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg > 1:324195‑M2/1‑71 (MQ=255) agcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaaagccttatccggc < 2:441593‑M2/101‑32 (MQ=255) gcCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcc < 1:1699079‑M2/101‑33 (MQ=255) cTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggccta < 2:652988‑M2/101‑35 (MQ=255) gTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctaca < 2:1677463‑M2/101‑37 (MQ=255) gTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctaca > 2:273585‑M2/1‑65 (MQ=255) gTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctaca < 1:16209‑M2/101‑37 (MQ=255) tttCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagt > 1:1378715‑M2/1‑62 (MQ=255) cATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcg < 2:1283353‑M2/101‑43 (MQ=255) cATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcg > 1:65196‑M2/1‑59 (MQ=255) aTAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgt > 2:1650617‑M2/1‑58 (MQ=255) aTAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgt < 1:426153‑M2/101‑44 (MQ=255) ttAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaa < 2:1432542‑M2/101‑48 (MQ=255) aCGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattc < 2:1156882‑M2/101‑52 (MQ=255) cGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggactacaagttcgggcaaattca < 2:234075‑M2/101‑53 (MQ=255) gTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaa < 2:39722‑M2/101‑54 (MQ=255) aTGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgggctacaagttcgtgcaaattcaataaa < 2:1605179‑M2/101‑58 (MQ=255) aTGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaa < 1:558128‑M2/101‑58 (MQ=255) tataAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattg > 1:32989‑M2/1‑41 (MQ=255) ataAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgc > 1:1656980‑M2/1‑40 (MQ=255) ataAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgc < 2:711215‑M2/101‑62 (MQ=255) taAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgca > 2:1699073‑M2/1‑39 (MQ=255) aaaaGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaat > 2:698120‑M2/1‑37 (MQ=255) aaaGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaata > 2:1139521‑M2/1‑36 (MQ=255) aaGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggactacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatat > 2:1453900‑M2/1‑35 (MQ=255) cGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgac > 2:339547‑M2/1‑32 (MQ=255) cGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgac > 2:752148‑M2/1‑32 (MQ=255) cGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgac > 2:575031‑M2/1‑32 (MQ=255) ggTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtagg > 1:293432‑M2/1‑27 (MQ=255) aGACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgat > 1:655378‑M2/1‑21 (MQ=255) gACAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgata > 2:77816‑M2/1‑20 (MQ=255) cAACGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataag > 1:1377510‑M2/1‑18 (MQ=255) aaCGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataagc > 1:672387‑M2/1‑17 (MQ=255) aaCGTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataagc > 1:378897‑M2/1‑17 (MQ=255) gTGCTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataagcgta < 1:437035‑M2/101‑88 (MQ=255) cTCGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataagcgtagcg < 1:367362‑M2/101‑91 (MQ=255) cGTTGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagttcgtgcaaattcaataaattgcaatatgacgtaggcctgataagcgtagcgca < 1:1432943‑M2/101‑93 (MQ=255) | GGTACAGAAACCAGCAGGCTGAGGATCAGCAGCCTGTTTTTCATAGTTAAACGTCCATGTATAAAAAGCGGTGGGTCGCAGACAACGTGCTCGTTGTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCGGAT > 32/33793‑33900 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |