| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 195 | = 5423 | 0 (0.000) | 36 (0.640) | 24/200 | 1.9 | 80.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 25 | 29389 = | 18 (0.320) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GTCCGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 195/5324‑5423 | gTCCGTTTGTAAGAATTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATAAAGTAAAAAATAATACCGATGAGGCCAACGACAAACTACAAAACGCCCGCGcacac < 2:1096016/101‑2 (MQ=255) ccGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtc < 1:1429322‑M1/101‑4 (MQ=255) cGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcc > 2:1105954‑M1/1‑97 (MQ=255) tGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctc > 1:1561250‑M1/1‑93 (MQ=255) tGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctc > 2:251878‑M1/1‑93 (MQ=255) gTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcg < 2:392906‑M1/101‑10 (MQ=255) gTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcg > 2:916272‑M1/1‑92 (MQ=255) aaGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcc > 2:1494558‑M1/1‑90 (MQ=255) agTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccct > 2:1094324‑M1/1‑87 (MQ=255) agTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccct < 1:1262888‑M1/101‑15 (MQ=255) gTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctc > 1:181874‑M1/1‑86 (MQ=255) gTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctc > 1:273364‑M1/1‑86 (MQ=255) aaCCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctgg < 2:1524187‑M1/101‑19 (MQ=255) aaCCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctgg < 2:290357‑M1/101‑19 (MQ=255) cGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctgggga > 2:936073‑M1/1‑80 (MQ=255) cGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctgggga > 2:34976‑M1/1‑80 (MQ=255) gTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggag > 2:759569‑M1/1‑79 (MQ=255) gTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggag > 1:715571‑M1/1‑79 (MQ=255) tGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagag < 2:1363376‑M1/101‑25 (MQ=255) aaGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggtt > 1:950545‑M1/1‑73 (MQ=255) aGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggtta < 1:459234‑M1/101‑30 (MQ=255) gggAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttag < 2:255711‑M1/101‑31 (MQ=255) ggAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagg < 1:1481130‑M1/101‑32 (MQ=255) ggAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagg < 1:933247‑M1/101‑32 (MQ=255) gAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttaggg > 1:1145624‑M1/1‑69 (MQ=255) aaTGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAACACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggt > 2:481535‑M1/1‑68 (MQ=255) aTGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtg > 2:1287465‑M1/1‑67 (MQ=255) aTGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtg > 2:1223827‑M1/1‑67 (MQ=255) aTGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtg > 1:1173693‑M1/1‑67 (MQ=255) gATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgag < 1:153788‑M1/101‑37 (MQ=255) tAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggg < 2:1084764‑M1/101‑39 (MQ=255) tGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggggtaaaa > 2:1577483‑M1/1‑57 (MQ=255) aGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggggtaaaacac < 2:1145619‑M1/101‑48 (MQ=255) gTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggatagggtgaggggcaaaacacg > 2:1523943‑M1/1‑53 (MQ=255) aaaaaaTAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggggtaaaacacgcg > 1:1208536‑M1/1‑51 (MQ=255) aaaaaaTAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggggtaaaacacgcg > 1:527380‑M1/1‑51 (MQ=255) aaaaaaTAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAgtcccctcgcccctctggggagagggttagggtgaggggtaaaacacgcg < 2:812939‑M1/101‑51 (MQ=255) | GTCCGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 195/5324‑5423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |