| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 138 | 1 = | 0 (0.000) | 64 (1.150) | 51/170 | 0.0 | 67.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 24 | 27433 = | 63 (1.210) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTTTAATGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 138/114‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtttaatgcgccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCAAATTCATATCAACGGACCTCC > 24/27433‑27532 CATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGG > 1:394746/1‑101 ATTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGT > 1:1280680/1‑101 TTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTT < 1:1345485/101‑1 TTGACCTGACAGAAACACAGAAAAGAAGCGATTTGCCGCAATCTTAAGCAGTTGAATCGCTTTTACTGAAATTAGGTTGACGAGATGTGCAGATTACGGTT > 1:251956/1‑101 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |