New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 131 | 1 = | 0 (0.000) | 63 (0.070) | 49/200 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AAAACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 131/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 AAAACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTT > 1:861150/1‑101 AAACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:1248725/1‑101 AAACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCAGTGATGCTGCCAACTTA > 2:723947/1‑101 ACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:319304/101‑1 ACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1294475/101‑1 ACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 2:1252593/101‑1 GCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:849735/101‑1 GCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:1069775/1‑101 GCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:1484815/101‑1 CCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 2:1232517/1‑101 CCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:680623/1‑101 CCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:1164639/1‑101 CTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:715854/1‑101 GCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:1182985/1‑101 ATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 2:698739/101‑1 GCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 2:1337444/101‑1 GGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1069780/101‑1 GGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 2:1316425/101‑1 CGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:1513223/1‑101 GGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 2:288284/101‑1 GGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:179228/1‑101 ATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:515702/1‑101 ATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:249051/1‑101 ATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGCTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 2:235294/101‑1 TACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:67078/101‑1 CCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:1524270/101‑1 AGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:767309/101‑1 AGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:589198/1‑101 AGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:1686786/1‑101 GACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:1182990/101‑1 GACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTAGCGAATCGGTGATCCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTTTGATGGGGTTTTTGAG > 2:1081981/1‑101 AGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 2:1638360/1‑101 GTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:443925/1‑101 GTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 2:1269715/101‑1 ATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 2:576252/1‑101 GACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:285955/101‑1 AATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:490578/1‑101 TATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 2:159825/1‑101 ATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 1:1642001/1‑101 GATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:768753/101‑1 ATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:395935/1‑101 TGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:248065/1‑101 CCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 1:800919/1‑101 CCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 1:1250977/1‑101 CCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:417251/101‑1 GATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:89909/101‑1 GATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:454132/101‑1 GATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 2:658545/1‑101 ATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 2:653317/1‑101 ATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:751701/101‑1 TCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:381677/101‑1 TCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 1:1645072/101‑1 GGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:520924/1‑101 GATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 1:278446/101‑1 GATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:150275/101‑1 ATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 1:1360699/1‑101 AGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:205291/1‑101 GTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 1:234541/1‑101 GTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 1:1211484/1‑101 GTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:1268365/101‑1 TATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:258253/101‑1 TATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > 1:636644/1‑101 ATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 1:821522/101‑1 AAAACGCCCTGCATTGCTGGCGGTATACCAGACAGTATGACGAATATTGCGATGCCCAAGATAATCCTGGATAAGTCGCGTATCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 131/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |