Missing coverage evidence...
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TTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTT  >  REL606/762108‑762242                                                                                                     |                                   ttAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTc                                    <  1:1088400/101‑1 (MQ=255) ttAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTc                                    <  1:632265/101‑1 (MQ=255) ttAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTc                                    >  1:449781/1‑101 (MQ=255)    aaGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGaa                                 >  2:19665/1‑101 (MQ=255)     aGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt                                <  2:968516/101‑1 (MQ=255)       aTTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc                              >  2:825694/1‑101 (MQ=255)        ttGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt                             <  1:1639307/101‑1 (MQ=255)         tGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg                            >  1:629882/1‑101 (MQ=255)           gTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCa                          >  1:1564928/1‑101 (MQ=255)                 aGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAccc                    >  1:896942/1‑101 (MQ=255)                  gTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACcca                   <  1:1714188/101‑1 (MQ=255)                   tAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccac                  <  1:608450/101‑1 (MQ=255)                     gAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTACCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccacca                >  2:1250818/1‑101 (MQ=255)                      aaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACccaccat               <  2:1005912/101‑2 (MQ=255)                        aTCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtg             >  1:1515/1‑100 (MQ=255)                            ttCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaa         <  2:1271164/101‑1 (MQ=255)                              cAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaa       <  1:554809/101‑3 (MQ=255)                              cAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaa       <  1:19665/101‑3 (MQ=255)                                ggTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaag     <  2:1189650/101‑5 (MQ=255)                                ggTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaag     >  2:8022/1‑97 (MQ=255)                                  tAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCACCACCAATGTaaaaaagcg   >  1:1519683/1‑95 (MQ=11)                                   aaCACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaagcgc  >  2:416038/1‑94 (MQ=255)                                                                                                     |                                   TTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTT  >  REL606/762108‑762242

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑