Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 4,462,655 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑85/‑100) | yjgM ← / → yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 4462655 = | 0 (0.000) | 90 (1.400) | 73/200 | 0.0 | 100% | intergenic (‑85/‑108) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
? | REL606 | 4521571 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 4462663 | 0 (0.000) | 83 (1.300) | 60/198 | 0.1 | 100% | intergenic (‑93/‑100) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
? | REL606 | = 4506109 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
CGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > REL606/4521471‑4521667 | cGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCgg > 1:1667790/1‑101 (MQ=255) aCTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGt > 2:1541175/1‑101 (MQ=255) aCTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGt < 2:1510382/101‑1 (MQ=255) aCTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGt < 1:1214480/101‑1 (MQ=255) cTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTa > 2:1295044/1‑101 (MQ=255) tCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAAt < 2:823039/101‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAAt < 2:1263868/101‑1 (MQ=255) ccGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATg > 2:774993/1‑101 (MQ=255) cGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGa < 2:390877/101‑1 (MQ=255) ggtggtAGTGCCGGGTTGTCACTGTAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGGTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGAc < 2:461100/101‑1 (MQ=255) ggtggtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGAc < 1:1008611/101‑1 (MQ=255) gtggtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACt > 1:74057/1‑101 (MQ=255) gtggtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACt < 2:1500871/101‑1 (MQ=255) tggtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTATGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTc < 1:167098/101‑1 (MQ=255) ggtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTcc < 1:1330633/101‑1 (MQ=255) gtAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCa < 1:1350903/101‑1 (MQ=255) tAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCaa < 2:1561712/101‑1 (MQ=255) aaTGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAAc < 2:1099491/101‑1 (MQ=255) aTGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACt < 1:65592/101‑1 (MQ=255) gggTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTg < 2:842607/101‑1 (MQ=255) ggTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:556989/101‑1 (MQ=255) gTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGAt > 1:1556830/1‑101 (MQ=255) cACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGGGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGCTAgagt > 1:80006/1‑101 (MQ=255) cTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 2:1683537/101‑1 (MQ=255) cTGGAGATTCATCCCCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTTCTTTGGCGAAGAGGGGAATAGAAACGCGGGTAATGACCCCAACTTATTTATAGTGttt < 2:858429/101‑1 (MQ=255) gagaTTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 2:1480922/101‑1 (MQ=255) gaTTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 2:1038554/101‑1 (MQ=255) aTTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:318748/1‑101 (MQ=255) ttCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:90893/1‑101 (MQ=255) cATCCGCACATGTTACGTCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 2:390315/101‑1 (MQ=255) cATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg > 2:455103/1‑101 (MQ=255) aTCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 2:1500438/1‑101 (MQ=255) aTCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:907149/1‑101 (MQ=255) tCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 2:362271/101‑1 (MQ=255) ccGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGAAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 2:1120869/1‑101 (MQ=255) cGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGCTTTATGTTCAGATaa < 2:1510276/101‑1 (MQ=255) gCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:72498/1‑101 (MQ=255) gCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 2:1560804/101‑1 (MQ=255) cacaTGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATg < 2:385776/101‑1 (MQ=255) acaTGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc < 1:1420729/101‑1 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATTCCCg < 2:1194791/101‑1 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:1324830/101‑1 (MQ=255) tGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg > 1:728932/1‑101 (MQ=255) ttACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:855055/101‑1 (MQ=255) cGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 1:533577/101‑1 (MQ=255) cGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc > 1:1680113/1‑101 (MQ=255) gCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt < 1:1672625/101‑1 (MQ=255) ccATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 2:650423/1‑101 (MQ=255) ccATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 2:379326/1‑101 (MQ=255) cATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 2:1145309/1‑101 (MQ=255) aTTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:1349754/101‑1 (MQ=255) cGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:1557774/1‑101 (MQ=255) gtgtGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 2:1315419/101‑1 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCGACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 2:690127/1‑101 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 2:352334/1‑101 (MQ=255) gtgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:1040754/1‑101 (MQ=255) tgGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa < 2:1225853/101‑1 (MQ=255) ggTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:1214981/1‑101 (MQ=255) ggTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg < 1:821936/101‑1 (MQ=255) ggTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 2:1313058/1‑101 (MQ=255) ttttGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCt < 1:1651283/101‑1 (MQ=255) tttGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTc > 1:150422/1‑101 (MQ=255) ttGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc < 1:397362/101‑1 (MQ=255) gCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc > 1:850135/1‑101 (MQ=255) gCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc < 2:1483962/101‑1 (MQ=255) cGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt < 1:1295050/101‑1 (MQ=255) gAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg > 1:1216480/1‑101 (MQ=255) aaTATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:599390/1‑101 (MQ=255) aaTATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 2:1006829/1‑101 (MQ=255) atatGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag < 2:306514/101‑1 (MQ=255) atatGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag < 1:1322511/101‑1 (MQ=255) tatGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgaga < 2:957843/101‑1 (MQ=255) ggAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:1002135/1‑101 (MQ=255) ggAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 2:922404/1‑101 (MQ=255) aaTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:401040/101‑1 (MQ=255) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:1339321/101‑1 (MQ=40) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg > 1:76880/1‑101 (MQ=40) aTAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:650428/101‑1 (MQ=40) tAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc > 2:24153/1‑101 (MQ=40) aGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg < 2:1015526/101‑1 (MQ=38) gATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 1:1591340/1‑101 (MQ=38) aTACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc < 1:272432/101‑1 (MQ=35) gccccgGGGAATGACTCCATCTTATTGATGCTGTTGTATGTCCATATAATGCCCGATGACTTTGTCATCCAGCTGCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt < 2:243390/97‑1 (MQ=11) cgcgGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc < 2:80006/101‑1 (MQ=32) | CGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > REL606/4521471‑4521667 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |