| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 3,947,872 | (TAATTGA)2→3 | intergenic (‑66/+620) | aslA ← / ← hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3947854 = | 2 (0.030) | 87 (1.540) | 57/176 | 0.0 | 98.4% | intergenic (‑48/+638) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein |
| ? | REL606 | = 3947860 | 1 (0.020) | intergenic (‑54/+632) | aslA/hemY | acrylsulfatase‑like enzyme/predicted protoheme IX synthesis protein | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CGGCGACAGCTACAACAAGAAGTTTGGGTGAAAACGAAAATTCCATGCAAAATGCTCCGGTTTCATGTCGTCAAAATGTTGACGTAATTAAGCATTGATAATTGATAATTGAGATCCCTCTCCCTGACAGGATGATTGCATAAATAATAGTGATGAAAATAAATTATTTATTTATCCAGAAAATGAATTGGAAAATCAGG > REL606/3947761‑3947960 | agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa > 1:188177‑M1/94‑101 (MQ=255)agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 1:183703‑M1/8‑1 (MQ=255)agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 2:1170278‑M1/8‑1 (MQ=255)agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 2:1683616‑M1/8‑1 (MQ=255)agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 2:105639‑M1/8‑1 (MQ=255)agctacaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataa < 2:445238‑M1/8‑1 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 2:913157‑M1/12‑1 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga > 2:1213897‑M1/90‑101 (MQ=255) acaacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattga < 2:1112973‑M1/12‑1 (MQ=255) aacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata > 2:310454‑M1/88‑101 (MQ=255) aacaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgata > 1:264382‑M1/88‑101 (MQ=255) acaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagcattgataattgataattgataa < 2:375635‑M1/15‑1 (MQ=255) acaagaagtttgggtgaaaacgaaaattccatgcaaaatgctccggtttcatgtcgtcaaaatgttgacgtaattaagaattgataattgataattgataa < 2:1169288‑M1/15‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |