New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | REL606 | 2774435 = | NA (NA) | 58 (0.930) | 49/194 | 0.3 | NA | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 2822512 | NA (NA) | noncoding (443/768 nt) | IS1 | repeat region |
AGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2774532‑2774435 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATATG < REL606/2822512‑2822413 AGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTC > 2:736670/1‑101 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCC < 2:1696430/101‑1 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCC < 2:600845/101‑1 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCC < 2:906595/101‑1 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CAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGG > 2:1257521/1‑101 GAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAAC < 2:1138014/101‑1 GAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAAC > 2:296046/1‑101 GGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGGCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTAT < 2:119391/101‑1 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGC < 2:1634553/101‑1 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGC > 2:1054289/1‑101 GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACG < 2:1361932/101‑1 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGC > 2:734765/1‑101 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TGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGA > 1:1381047/1‑101 GGTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGT < 1:76063/101‑1 GTCAGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTG < 1:1478816/101‑1 AGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATTAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTG > 1:244635/1‑101 AGTACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTG > 1:581757/1‑101 TACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGAT < 1:683746/101‑1 ACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATA > 1:927190/1‑101 ACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATA < 1:574351/101‑1 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ACAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATA > 1:596546/1‑101 CAGTGTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT < 1:194117/101‑1 CAGTCTCCGGTTGTCGGTTGTTGCTCCCTCACTCGGTGAACGCTCTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCCCCCTTTGACGTGGTGATAT < 1:731356/101‑1 CAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCATTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT < 1:44982/101‑1 CAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT > 1:526220/1‑101 CAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT > 1:1620664/1‑101 CAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT > 1:566087/1‑101 CAGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATAT > 1:1019217/1‑101 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AGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATATG > 1:707890/1‑101 AGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2774532‑2774435 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATATG < REL606/2822512‑2822413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |