Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | REL606 | 4,558,781 | (T)7→6 | coding (657/1425 nt) | hsdS ← | specificity determinant for hsdM and hsdR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | REL606 | 4,558,775 | 0 | T | . | 98.8% | 396.6 / ‑1.8 | 81 | coding (663/1425 nt) | hsdS | specificity determinant for hsdM and hsdR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base . (36/44); total (36/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
CCACACCATAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACTTTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGAT > REL606/4558675‑4558870 | ccacaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACt > 2:787788/1‑101 (MQ=255) ccacaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACt > 2:546504/1‑101 (MQ=255) ccacaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACt > 1:1475294/1‑101 (MQ=255) ccacaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACt < 2:1445402/101‑1 (MQ=255) acaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttt < 2:121998/101‑1 (MQ=255) acaccaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttt < 1:645365/101‑1 (MQ=255) accaTAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttttt < 2:1168613/101‑1 (MQ=255) catagcatgaGGGTCGTTGTCTATTGATAATGTTATGCAAAATTGTTTCGCTCTAGTCTTCTGGAATAAGGAGATATTAGTAACCTAATTCCGCtttttta < 2:569148/101‑2 (MQ=255) cataacataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACtttttta > 1:940855/1‑100 (MQ=255) ataacataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttttttat < 2:256304/101‑3 (MQ=255) ataacataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttttttat > 1:1125901/1‑99 (MQ=255) ataacataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttttttat < 2:264750/101‑3 (MQ=255) ataacataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACttttttat > 1:158849/1‑99 (MQ=255) acataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTtattat > 1:633191/1‑101 (MQ=255) cataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATtata < 2:726183/101‑1 (MQ=255) cataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATtata < 1:1700657/101‑1 (MQ=255) cataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATtata < 2:1529961/101‑1 (MQ=255) cataaTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATtata < 2:753905/101‑1 (MQ=255) aTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAAt < 2:31913/101‑1 (MQ=255) aTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAAt > 2:1495886/1‑101 (MQ=255) aTGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAAt < 1:560122/101‑1 (MQ=255) tGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATc < 2:797779/101‑1 (MQ=255) ggTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCt < 2:491050/101‑1 (MQ=255) ggTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCt > 2:264783/1‑101 (MQ=255) tCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCttt < 2:648793/101‑1 (MQ=255) tCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCttt < 1:1395998/101‑1 (MQ=255) tCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCttt < 1:1267223/101‑1 (MQ=255) cTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTa > 1:507145/1‑101 (MQ=255) cTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTa < 1:1651322/101‑1 (MQ=255) tgtgTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTAtct > 2:780978/1‑101 (MQ=255) gtgtATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTAtctt < 1:450835/101‑1 (MQ=255) tgtATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTAtcttc < 1:187092/101‑1 (MQ=255) ttGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTg < 2:1013897/101‑1 (MQ=255) tGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACTTTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTg < 2:458116/101‑1 (MQ=255) aaTGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCaa < 1:544737/101‑1 (MQ=255) aTGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAAc > 2:859468/1‑101 (MQ=255) aTGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAAc > 1:1307108/1‑101 (MQ=255) tGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAAcc > 2:462998/1‑101 (MQ=255) ttATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTa > 2:471006/1‑101 (MQ=255) ttATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTa > 2:770933/1‑101 (MQ=255) ttATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTa < 1:859473/101‑1 (MQ=255) ttATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTa > 2:324895/1‑101 (MQ=255) tATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTAc > 2:1015853/1‑101 (MQ=255) ttCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCa < 2:1307102/101‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCa < 2:633186/101‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCa < 1:471011/101‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCa < 2:1355875/101‑1 (MQ=255) aaaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTGTAAAATCTTTATCTTCTTTTGTCAACCTACCAGTTa < 2:840985/101‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTAc < 2:1249062/101‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTAc < 2:1618554/101‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTAc < 2:158849/101‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTAc < 2:354170/101‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTAc < 2:884335/101‑1 (MQ=255) aTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACt < 2:726797/101‑1 (MQ=255) aTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACt < 2:1430363/101‑1 (MQ=255) aTTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACt < 2:831803/101‑1 (MQ=255) cTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGcc > 1:389234/1‑101 (MQ=255) tCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCa > 2:1030429/1‑101 (MQ=255) tCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCa < 1:1263424/101‑1 (MQ=255) ccAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCaa > 1:882328/1‑101 (MQ=255) ccAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCaa > 2:252588/1‑101 (MQ=255) cAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAac < 1:546509/101‑1 (MQ=255) aGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAaca > 2:683699/1‑101 (MQ=255) gTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAacac > 2:1528588/1‑101 (MQ=255) gTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAacac < 1:286105/101‑1 (MQ=255) gTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAacac > 1:1396003/1‑101 (MQ=255) tctGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGcc < 2:1125896/101‑1 (MQ=255) ggAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGa > 2:1037304/1‑101 (MQ=255) atctaGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACg < 2:1660355/97‑1 (MQ=255) aaTAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACg > 2:930399/1‑101 (MQ=255) aaTAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACg > 1:1435706/1‑101 (MQ=255) aTAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGa > 1:724192/1‑101 (MQ=255) aaGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGaaa < 1:1623974/101‑1 (MQ=255) aGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGagat > 1:1660361/1‑98 (MQ=255) aGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGaaaa > 2:484901/1‑101 (MQ=255) ggATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAAc > 2:1334930/1‑101 (MQ=255) ggATTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAAc < 1:787793/101‑1 (MQ=255) aTTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGt > 1:366230/1‑101 (MQ=255) aTTTTGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGt > 1:1402105/1‑101 (MQ=255) tGTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCa < 1:1030434/101‑1 (MQ=255) gTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAg < 1:1046349/101‑1 (MQ=255) gTAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAg < 1:1548287/101‑1 (MQ=255) tAGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCCgg > 2:852141/1‑101 (MQ=255) aGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGa < 1:909205/101‑1 (MQ=255) aGTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGa > 1:566885/1‑101 (MQ=255) gTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCATCCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGAt < 1:264783/101‑1 (MQ=255) gTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGAt > 2:1385999/1‑101 (MQ=255) gTTATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGAt > 2:1681626/1‑101 (MQ=255) tATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGAttt > 1:1027714/1‑101 (MQ=255) tATCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGAttt > 2:1306227/1‑101 (MQ=255) aTCTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTtg > 2:1131031/1‑101 (MQ=255) cTAATTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTtgtg < 1:1334936/101‑1 (MQ=255) aaTTCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTggg < 1:1386005/101‑1 (MQ=255) ttCAAC‑TTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGAt > 2:835216/1‑101 (MQ=255) | CCACACCATAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCAACTTTTTTTATTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGAT > REL606/4558675‑4558870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |