Missing coverage evidence...
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*	*	÷	REL606	2842025–2842086	2842276–2842224	139–252	34 [31]	[32] 34	[metZ]–[metV]	[metZ],metW,[metV]

GCTCATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGGTGTT  >  REL606/2842257‑2842327                     |                                                   gCTCATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCTCGCAACCAattat                      >  1:5542523/1‑51 (MQ=9)  cTCATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAattatt                     <  1:2706052/51‑1 (MQ=33)   tCATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTg                    <  1:5013829/51‑1 (MQ=35)    cATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGa                   <  1:1870004/51‑1 (MQ=38)     aTAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGaa                  <  1:747035/51‑1 (MQ=40)     aTAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGaa                  <  1:4872704/51‑1 (MQ=40)       aaCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAaca                <  1:1082696/51‑1 (MQ=255)       aaCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAaca                <  1:4320153/51‑1 (MQ=255)       aaCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAaca                <  1:6560669/51‑1 (MQ=255)       aaCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAaca                <  1:4956771/51‑1 (MQ=255)       aaCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAaca                <  1:2551525/51‑1 (MQ=255)        aCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAacac               >  1:171067/1‑51 (MQ=255)        aCCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAacac               >  1:426430/1‑51 (MQ=255)          ccGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACAccc             <  1:502455/51‑1 (MQ=255)           cGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCt            <  1:2578278/51‑1 (MQ=255)            gAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTa           >  1:1680951/1‑51 (MQ=255)            gAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTa           <  1:3674664/51‑1 (MQ=255)            gAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTa           >  1:2606296/1‑51 (MQ=255)            gAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTa           >  1:7058660/1‑51 (MQ=255)             aaGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTaa          <  1:6087994/51‑1 (MQ=255)             aaGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTaa          <  1:7275708/51‑1 (MQ=255)             aaGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTaa          <  1:6443773/51‑1 (MQ=255)              aGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAAc         <  1:2686445/51‑1 (MQ=255)               ggTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACg        <  1:6306938/51‑1 (MQ=255)               ggTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACg        <  1:6202031/51‑1 (MQ=255)               ggTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACg        <  1:2526402/51‑1 (MQ=255)                  cgtcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACggg      >  1:255661/1‑50 (MQ=255)                  cgtcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGgt     <  1:496008/51‑1 (MQ=255)                    tcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGgtgt   >  1:642498/1‑51 (MQ=255)                    tcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGgtgt   <  1:5729892/51‑1 (MQ=255)                    tcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGgtgt   >  1:5740323/1‑51 (MQ=255)                    tcgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGgtgt   <  1:6621290/51‑1 (MQ=255)                     cgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGGTGtt  >  1:6990780/1‑51 (MQ=255)                     cgGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGGTGtt  <  1:3013462/51‑1 (MQ=255)                     |                                                   GCTCATAACCCGAAGGTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCAATTATTGAACACCCTAACGGGTGTT  >  REL606/2842257‑2842327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑