New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | REL606 | 2774435 = | NA (NA) | 67 (0.900) | 49/94 | 0.2 | NA | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 2822512 | NA (NA) | noncoding (443/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2774481‑2774435 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCG < REL606/2822512‑2822463 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCT < 1:4500720/51‑1 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCT < 1:3590843/51‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTC > 1:4945076/1‑51 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCC < 1:4223773/51‑1 ATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGG > 1:6045939/1‑51 TATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGA < 1:4769782/51‑1 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAA < 1:1634693/51‑1 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAA > 1:4198783/1‑51 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAA > 1:3856798/1‑51 TGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAG < 1:1154455/51‑1 CCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGTCTCCGGAAGAC < 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |